MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia bissettii DN127 plasmid lp56

Total Repeats: 352

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015920	CTT	2	6	122	127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127221
2	NC_015920	AAT	2	6	129	134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127221
3	NC_015920	TCT	2	6	167	172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127221
4	NC_015920	TCT	2	6	221	226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127221
5	NC_015920	ATT	2	6	259	264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127221
6	NC_015920	TCT	2	6	326	331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127221
7	NC_015920	TTC	2	6	454	459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127221
8	NC_015920	CAT	2	6	466	471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127221
9	NC_015920	ATA	2	6	563	568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127221
10	NC_015920	AAT	2	6	569	574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127221
11	NC_015920	TAA	2	6	736	741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127221
12	NC_015920	TCT	2	6	752	757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127221
13	NC_015920	TAA	2	6	880	885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127221
14	NC_015920	ATT	2	6	895	900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127221
15	NC_015920	TCT	2	6	938	943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127221
16	NC_015920	TAT	2	6	1009	1014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127221
17	NC_015920	GCC	2	6	1351	1356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	343127221
18	NC_015920	CCA	2	6	1412	1417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	343127221
19	NC_015920	ATT	2	6	1450	1455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127221
20	NC_015920	GAT	2	6	1503	1508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127221
21	NC_015920	AGT	2	6	1520	1525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127221
22	NC_015920	TCA	2	6	1601	1606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127221
23	NC_015920	GGA	2	6	1625	1630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	343127221
24	NC_015920	CTT	2	6	1653	1658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127221
25	NC_015920	TAA	2	6	1697	1702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127221
26	NC_015920	ATT	2	6	1862	1867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127221
27	NC_015920	TAT	3	9	1938	1946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127221
28	NC_015920	ATG	2	6	2104	2109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127221
29	NC_015920	TGA	2	6	2122	2127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127221
30	NC_015920	AAT	2	6	2137	2142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127221
31	NC_015920	CTT	2	6	2212	2217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127221
32	NC_015920	TTC	2	6	2272	2277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127221
33	NC_015920	CTT	2	6	2280	2285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127221
34	NC_015920	CTT	2	6	2316	2321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127221
35	NC_015920	AAT	2	6	2367	2372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127221
36	NC_015920	AAT	2	6	2416	2421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127221
37	NC_015920	CGC	2	6	2470	2475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	343127221
38	NC_015920	CTT	2	6	2604	2609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127221
39	NC_015920	ATA	2	6	2620	2625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127221
40	NC_015920	AGT	2	6	2653	2658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127221
41	NC_015920	AAG	2	6	2771	2776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127221
42	NC_015920	TTC	2	6	2794	2799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127221
43	NC_015920	ATT	2	6	2827	2832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127221
44	NC_015920	TCT	2	6	2849	2854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127221
45	NC_015920	TCC	2	6	2863	2868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	343127221
46	NC_015920	TAT	2	6	2926	2931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127221
47	NC_015920	TCA	2	6	2963	2968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127221
48	NC_015920	TCT	2	6	3014	3019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127221
49	NC_015920	TTC	2	6	3091	3096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127221
50	NC_015920	TCA	2	6	3321	3326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127221
51	NC_015920	TGG	3	9	3657	3665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	343127222
52	NC_015920	ACT	2	6	3669	3674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127222
53	NC_015920	GCC	2	6	3741	3746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	343127222
54	NC_015920	GCA	2	6	3802	3807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	343127222
55	NC_015920	ATT	3	9	3823	3831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127222
56	NC_015920	CTT	2	6	4310	4315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127223
57	NC_015920	TCT	2	6	4363	4368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127223
58	NC_015920	TCA	2	6	4397	4402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127223
59	NC_015920	TAT	2	6	4424	4429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127223
60	NC_015920	CTC	2	6	4490	4495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	343127223
61	NC_015920	TAT	2	6	4688	4693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127223
62	NC_015920	ATC	2	6	4698	4703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127223
63	NC_015920	ATT	2	6	4734	4739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127223
64	NC_015920	CTA	2	6	4810	4815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127223
65	NC_015920	AAT	2	6	4822	4827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127223
66	NC_015920	GTT	2	6	4836	4841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343127223
67	NC_015920	TAA	2	6	4959	4964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127224
68	NC_015920	CTT	2	6	5001	5006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127224
69	NC_015920	TAA	2	6	5054	5059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127224
70	NC_015920	TTC	2	6	5104	5109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127224
71	NC_015920	CAT	2	6	5193	5198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127224
72	NC_015920	ATT	2	6	5258	5263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127224
73	NC_015920	AGA	2	6	5381	5386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127224
74	NC_015920	TTA	2	6	5465	5470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127224
75	NC_015920	CAC	2	6	5655	5660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	343127224
76	NC_015920	TAT	2	6	5712	5717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127225
77	NC_015920	CTT	2	6	5898	5903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127225
78	NC_015920	TAT	3	9	5918	5926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127225
79	NC_015920	TCT	2	6	5992	5997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127225
80	NC_015920	TTG	2	6	5999	6004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343127225
81	NC_015920	TCC	2	6	6027	6032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	343127225
82	NC_015920	ATT	2	6	6106	6111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127225
83	NC_015920	AAT	2	6	6113	6118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127225
84	NC_015920	TCT	2	6	6139	6144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127225
85	NC_015920	TTC	2	6	6219	6224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127226
86	NC_015920	TTA	2	6	6549	6554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127226
87	NC_015920	TAT	2	6	6574	6579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127226
88	NC_015920	TTA	2	6	6768	6773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127226
89	NC_015920	TCT	2	6	6804	6809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127226
90	NC_015920	CTT	2	6	6841	6846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127226
91	NC_015920	TTG	2	6	6881	6886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343127226
92	NC_015920	GTG	2	6	6887	6892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	343127226
93	NC_015920	TAT	2	6	6943	6948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127226
94	NC_015920	TTC	2	6	6953	6958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127226
95	NC_015920	TTA	2	6	6979	6984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127226
96	NC_015920	ATT	2	6	6990	6995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127226
97	NC_015920	ATA	2	6	7018	7023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127226
98	NC_015920	AAT	2	6	7042	7047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127226
99	NC_015920	ATT	2	6	7456	7461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127227
100	NC_015920	TCT	2	6	7502	7507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127227
101	NC_015920	AAT	2	6	7510	7515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127227
102	NC_015920	CAC	3	9	7647	7655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	343127227
103	NC_015920	ATC	2	6	7747	7752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127227
104	NC_015920	CTT	2	6	7844	7849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127227
105	NC_015920	TTC	2	6	7954	7959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127227
106	NC_015920	TCA	2	6	8018	8023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127227
107	NC_015920	CTT	2	6	8083	8088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127227
108	NC_015920	GCT	2	6	8249	8254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	343127227
109	NC_015920	TTG	2	6	8354	8359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343127227
110	NC_015920	TTC	2	6	8575	8580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127227
111	NC_015920	TAA	3	9	8587	8595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127227
112	NC_015920	TTA	2	6	8706	8711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127227
113	NC_015920	ATT	2	6	8887	8892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127227
114	NC_015920	CTG	2	6	8928	8933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	343127227
115	NC_015920	TTG	2	6	9020	9025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343127227
116	NC_015920	TTG	2	6	9058	9063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343127227
117	NC_015920	TCT	2	6	9107	9112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127227
118	NC_015920	TAT	2	6	9123	9128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127227
119	NC_015920	TAT	2	6	9133	9138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127227
120	NC_015920	AGC	2	6	9202	9207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	343127227
121	NC_015920	ATC	2	6	9476	9481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127227
122	NC_015920	ACC	2	6	9595	9600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	343127227
123	NC_015920	CTT	2	6	9696	9701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127227
124	NC_015920	TCT	2	6	9752	9757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127227
125	NC_015920	CCA	2	6	9827	9832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	343127227
126	NC_015920	TCA	2	6	9941	9946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127227
127	NC_015920	TTC	2	6	9985	9990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127227
128	NC_015920	TCA	2	6	10034	10039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127227
129	NC_015920	AAT	2	6	10093	10098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127227
130	NC_015920	ACC	2	6	10231	10236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	343127227
131	NC_015920	TTG	2	6	10439	10444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343127227
132	NC_015920	ATT	3	9	10466	10474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127227
133	NC_015920	TCA	2	6	10475	10480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127227
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244	NC_015920	GAT	2	6	19862	19867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127242
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248	NC_015920	TCC	2	6	19972	19977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	343127242
249	NC_015920	GTT	2	6	20001	20006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343127242
250	NC_015920	CTT	2	6	20075	20080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127242
251	NC_015920	TCA	2	6	20093	20098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127242
252	NC_015920	GCA	2	6	20201	20206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	343127242
253	NC_015920	AAC	2	6	20284	20289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127242
254	NC_015920	ATC	2	6	20632	20637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127242
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256	NC_015920	TTG	2	6	20760	20765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343127242
257	NC_015920	ATT	2	6	20837	20842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127242
258	NC_015920	CTG	2	6	20948	20953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	343127242
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260	NC_015920	CTT	3	9	21075	21083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127242
261	NC_015920	CTG	2	6	21131	21136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	343127242
262	NC_015920	GCT	2	6	21139	21144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	343127242
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.