MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Borrelia bissettii DN127 plasmid lp56

Total Repeats: 51

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015920	AT	3	6	38	43	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015920	TG	4	8	54	61	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015920	CA	3	6	625	630	50 %	0 %	0 %	50 %	343127221
4	NC_015920	TA	4	8	1253	1260	50 %	50 %	0 %	0 %	343127221
5	NC_015920	AT	3	6	1281	1286	50 %	50 %	0 %	0 %	343127221
6	NC_015920	AT	3	6	3050	3055	50 %	50 %	0 %	0 %	343127221
7	NC_015920	AT	4	8	3157	3164	50 %	50 %	0 %	0 %	343127221
8	NC_015920	TC	3	6	3235	3240	0 %	50 %	0 %	50 %	343127221
9	NC_015920	AT	3	6	3714	3719	50 %	50 %	0 %	0 %	343127222
10	NC_015920	AT	3	6	4225	4230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015920	TA	3	6	5074	5079	50 %	50 %	0 %	0 %	343127224
12	NC_015920	AT	3	6	5537	5542	50 %	50 %	0 %	0 %	343127224
13	NC_015920	AT	3	6	5616	5621	50 %	50 %	0 %	0 %	343127224
14	NC_015920	AG	3	6	6531	6536	50 %	0 %	50 %	0 %	343127226
15	NC_015920	TA	3	6	6711	6716	50 %	50 %	0 %	0 %	343127226
16	NC_015920	TA	3	6	7302	7307	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015920	AT	3	6	7616	7621	50 %	50 %	0 %	0 %	343127227
18	NC_015920	TC	3	6	8071	8076	0 %	50 %	0 %	50 %	343127227
19	NC_015920	CT	3	6	9857	9862	0 %	50 %	0 %	50 %	343127227
20	NC_015920	TA	3	6	11501	11506	50 %	50 %	0 %	0 %	343127230
21	NC_015920	GA	3	6	12922	12927	50 %	0 %	50 %	0 %	343127233
22	NC_015920	TG	3	6	15913	15918	0 %	50 %	50 %	0 %	343127237
23	NC_015920	GT	3	6	16126	16131	0 %	50 %	50 %	0 %	343127237
24	NC_015920	GA	3	6	16449	16454	50 %	0 %	50 %	0 %	343127238
25	NC_015920	CA	4	8	16689	16696	50 %	0 %	0 %	50 %	343127238
26	NC_015920	AC	3	6	16864	16869	50 %	0 %	0 %	50 %	343127238
27	NC_015920	TC	3	6	16961	16966	0 %	50 %	0 %	50 %	343127238
28	NC_015920	AT	3	6	17763	17768	50 %	50 %	0 %	0 %	343127240
29	NC_015920	TA	3	6	17845	17850	50 %	50 %	0 %	0 %	343127240
30	NC_015920	AG	3	6	18404	18409	50 %	0 %	50 %	0 %	343127240
31	NC_015920	AG	3	6	18422	18427	50 %	0 %	50 %	0 %	343127240
32	NC_015920	AT	3	6	18724	18729	50 %	50 %	0 %	0 %	343127241
33	NC_015920	GT	3	6	19407	19412	0 %	50 %	50 %	0 %	343127242
34	NC_015920	TG	3	6	19919	19924	0 %	50 %	50 %	0 %	343127242
35	NC_015920	GT	3	6	20528	20533	0 %	50 %	50 %	0 %	343127242
36	NC_015920	TC	3	6	21101	21106	0 %	50 %	0 %	50 %	343127242
37	NC_015920	AT	3	6	24021	24026	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015920	TG	3	6	24031	24036	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015920	GT	3	6	24152	24157	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015920	TA	3	6	24594	24599	50 %	50 %	0 %	0 %	343127247
41	NC_015920	TA	3	6	25012	25017	50 %	50 %	0 %	0 %	343127247
42	NC_015920	GA	3	6	25422	25427	50 %	0 %	50 %	0 %	343127247
43	NC_015920	GA	3	6	25515	25520	50 %	0 %	50 %	0 %	343127247
44	NC_015920	AT	3	6	25910	25915	50 %	50 %	0 %	0 %	343127248
45	NC_015920	AT	3	6	25981	25986	50 %	50 %	0 %	0 %	343127248
46	NC_015920	AG	3	6	26332	26337	50 %	0 %	50 %	0 %	343127249
47	NC_015920	GT	3	6	26520	26525	0 %	50 %	50 %	0 %	343127249
48	NC_015920	AG	3	6	27491	27496	50 %	0 %	50 %	0 %	343127250
49	NC_015920	AT	3	6	27767	27772	50 %	50 %	0 %	0 %	343127251
50	NC_015920	AT	3	6	28738	28743	50 %	50 %	0 %	0 %	343127252
51	NC_015920	TA	3	6	29270	29275	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.