MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Borrelia bissettii DN127 plasmid lp54

Total Repeats: 48

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015919	ATATTA	2	12	717	728	50 %	50 %	0 %	0 %	343127254
2	NC_015919	TTAAAC	2	12	1689	1700	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	343127255
3	NC_015919	AAATTT	2	12	4594	4605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015919	TTAGCA	2	12	4823	4834	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	343127258
5	NC_015919	ACAATA	2	12	5615	5626	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	343127259
6	NC_015919	ATTGAG	2	12	6145	6156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127260
7	NC_015919	TAGTGA	2	12	6447	6458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127260
8	NC_015919	AAATTT	2	12	8431	8442	50 %	50 %	0 %	0 %	343127263
9	NC_015919	CTTTTT	2	12	9286	9297	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_015919	AAAGAC	2	12	9639	9650	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	343127266
11	NC_015919	AAAAGT	2	12	10997	11008	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	343127267
12	NC_015919	ATAACA	2	12	11374	11385	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_015919	CAAAAA	2	12	13087	13098	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	343127269
14	NC_015919	AATTAA	2	12	13100	13111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127269
15	NC_015919	ATTCTT	2	12	16101	16112	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	343127274
16	NC_015919	ATGATA	2	12	16574	16585	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	343127274
17	NC_015919	AATATT	2	12	16704	16715	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015919	TTTTTA	2	12	17203	17214	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	343127275
19	NC_015919	AGCTAT	2	12	17312	17323	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	343127275
20	NC_015919	TAATAT	2	12	18879	18890	50 %	50 %	0 %	0 %	343127279
21	NC_015919	AGAAAA	2	12	19205	19216	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	343127279
22	NC_015919	ATCAAA	2	12	24674	24685	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	343127286
23	NC_015919	ATGAAG	2	12	24889	24900	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	343127286
24	NC_015919	GAAGAT	2	12	25761	25772	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	343127287
25	NC_015919	ATTATG	2	12	25951	25962	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	343127287
26	NC_015919	TGAAAA	2	12	26642	26653	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	343127287
27	NC_015919	GTTTTA	2	12	30563	30574	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	343127294
28	NC_015919	TAAAAA	4	24	30676	30699	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015919	GCTTAA	2	12	31701	31712	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	343127295
30	NC_015919	TTCCAA	2	12	31937	31948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127296
31	NC_015919	AAAAAG	2	12	33842	33853	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	343127299
32	NC_015919	TCAAGC	2	12	33936	33947	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	343127299
33	NC_015919	GAAAGC	2	12	35748	35759	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	343127301
34	NC_015919	TTTTCT	2	12	37781	37792	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	343127304
35	NC_015919	GATTTT	2	12	38756	38767	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015919	ATTTTT	2	12	39845	39856	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	343127307
37	NC_015919	ATTGAT	2	12	41507	41518	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015919	ATTAAA	2	12	41961	41972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127310
39	NC_015919	GGGTTG	2	12	42727	42738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	343127311
40	NC_015919	TTTTGT	2	12	45072	45083	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	343127313
41	NC_015919	CTTGTT	2	12	45239	45250	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	343127313
42	NC_015919	AAAACA	2	12	45410	45421	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	343127313
43	NC_015919	AATTTA	2	12	45725	45736	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015919	TAGTTG	2	12	48959	48970	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	343127318
45	NC_015919	ACTAAT	2	12	49521	49532	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_015919	GATTTA	2	12	49665	49676	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015919	GTAATT	2	12	50910	50921	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	343127320
48	NC_015919	AATATA	2	12	52818	52829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.