MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Borrelia bissettii DN127 plasmid lp54

Total Repeats: 51

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015919	ATTTA	2	10	923	932	40 %	60 %	0 %	0 %	343127254
2	NC_015919	AGCAA	2	10	1653	1662	60 %	0 %	20 %	20 %	343127255
3	NC_015919	GGCAT	2	10	2503	2512	20 %	20 %	40 %	20 %	343127256
4	NC_015919	TAAAT	2	10	4299	4308	60 %	40 %	0 %	0 %	343127257
5	NC_015919	TTAAA	2	10	4935	4944	60 %	40 %	0 %	0 %	343127258
6	NC_015919	AAGAA	2	10	5130	5139	80 %	0 %	20 %	0 %	343127258
7	NC_015919	AATAA	2	10	5141	5150	80 %	20 %	0 %	0 %	343127258
8	NC_015919	CAATT	2	10	5784	5793	40 %	40 %	0 %	20 %	343127260
9	NC_015919	CAAAA	2	10	7870	7879	80 %	0 %	0 %	20 %	343127262
10	NC_015919	AAGAG	2	10	8772	8781	60 %	0 %	40 %	0 %	343127264
11	NC_015919	TGAAA	2	10	9611	9620	60 %	20 %	20 %	0 %	343127266
12	NC_015919	AGTAA	2	10	10662	10671	60 %	20 %	20 %	0 %	343127267
13	NC_015919	AACAA	2	10	12321	12330	80 %	0 %	0 %	20 %	343127268
14	NC_015919	CAAAA	2	10	12359	12368	80 %	0 %	0 %	20 %	343127268
15	NC_015919	TAAAA	2	10	12719	12728	80 %	20 %	0 %	0 %	343127268
16	NC_015919	TCCAT	2	10	13932	13941	20 %	40 %	0 %	40 %	343127270
17	NC_015919	TTAAA	2	10	13951	13960	60 %	40 %	0 %	0 %	343127270
18	NC_015919	GATTT	2	10	14290	14299	20 %	60 %	20 %	0 %	343127270
19	NC_015919	AAAAT	2	10	14941	14950	80 %	20 %	0 %	0 %	343127271
20	NC_015919	TTTCT	2	10	16113	16122	0 %	80 %	0 %	20 %	343127274
21	NC_015919	TTTTG	2	10	16836	16845	0 %	80 %	20 %	0 %	343127275
22	NC_015919	ATTTT	2	10	17217	17226	20 %	80 %	0 %	0 %	343127275
23	NC_015919	TATTT	2	10	17881	17890	20 %	80 %	0 %	0 %	343127277
24	NC_015919	AATGA	2	10	19618	19627	60 %	20 %	20 %	0 %	343127279
25	NC_015919	CAAAA	2	10	20067	20076	80 %	0 %	0 %	20 %	343127279
26	NC_015919	AATTA	2	10	23151	23160	60 %	40 %	0 %	0 %	343127283
27	NC_015919	AAAGA	2	10	24947	24956	80 %	0 %	20 %	0 %	343127286
28	NC_015919	CCAAA	2	10	28547	28556	60 %	0 %	0 %	40 %	343127290
29	NC_015919	AAATT	2	10	29818	29827	60 %	40 %	0 %	0 %	343127293
30	NC_015919	TTTTA	2	10	30348	30357	20 %	80 %	0 %	0 %	343127294
31	NC_015919	TAATG	2	10	31899	31908	40 %	40 %	20 %	0 %	343127296
32	NC_015919	AAATA	2	10	33830	33839	80 %	20 %	0 %	0 %	343127299
33	NC_015919	AAATC	2	10	34463	34472	60 %	20 %	0 %	20 %	343127300
34	NC_015919	TTTAT	2	10	38973	38982	20 %	80 %	0 %	0 %	343127305
35	NC_015919	CTTTT	2	10	39238	39247	0 %	80 %	0 %	20 %	343127306
36	NC_015919	AGATG	2	10	41644	41653	40 %	20 %	40 %	0 %	343127309
37	NC_015919	TCTTT	2	10	42875	42884	0 %	80 %	0 %	20 %	343127311
38	NC_015919	TGTAT	2	10	43280	43289	20 %	60 %	20 %	0 %	343127312
39	NC_015919	GTTTT	2	10	43859	43868	0 %	80 %	20 %	0 %	343127312
40	NC_015919	TTTTA	2	10	47214	47223	20 %	80 %	0 %	0 %	343127315
41	NC_015919	GTTTA	2	10	47568	47577	20 %	60 %	20 %	0 %	343127315
42	NC_015919	TTCTT	2	10	47753	47762	0 %	80 %	0 %	20 %	343127316
43	NC_015919	ATAGT	2	10	47880	47889	40 %	40 %	20 %	0 %	343127317
44	NC_015919	GTTTG	2	10	48013	48022	0 %	60 %	40 %	0 %	343127317
45	NC_015919	CGTTT	2	10	48818	48827	0 %	60 %	20 %	20 %	343127318
46	NC_015919	TTTGC	2	10	48906	48915	0 %	60 %	20 %	20 %	343127318
47	NC_015919	GTTTA	2	10	49478	49487	20 %	60 %	20 %	0 %	343127318
48	NC_015919	CTTTT	2	10	49929	49938	0 %	80 %	0 %	20 %	343127319
49	NC_015919	TTTGA	2	10	50426	50435	20 %	60 %	20 %	0 %	343127319
50	NC_015919	ATTTT	2	10	52287	52296	20 %	80 %	0 %	0 %	343127321
51	NC_015919	AAAAG	2	10	54423	54432	80 %	0 %	20 %	0 %	343127323

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.