MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia bissettii DN127 plasmid lp54

Total Repeats: 58

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015919	AAAT	2	8	316	323	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015919	CTTT	2	8	383	390	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_015919	TAAT	2	8	500	507	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015919	AAAC	2	8	619	626	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_015919	AAAT	2	8	1231	1238	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015919	TAAT	2	8	1473	1480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015919	TAAT	2	8	2040	2047	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015919	TAAA	2	8	4331	4338	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015919	TACA	2	8	4353	4360	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_015919	TAAA	2	8	4462	4469	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015919	AACA	2	8	4630	4637	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_015919	TAAA	2	8	5218	5225	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015919	ATAA	2	8	8292	8299	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015919	TTAT	2	8	9436	9443	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015919	TGAA	2	8	11514	11521	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015919	ATAA	3	12	11524	11535	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015919	TAAA	2	8	11589	11596	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015919	ACTT	2	8	11662	11669	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_015919	ATTA	2	8	11760	11767	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015919	AGAA	2	8	13011	13018	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015919	ATTT	2	8	14951	14958	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015919	AAAG	2	8	15068	15075	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015919	TAAA	2	8	15369	15376	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015919	TATT	2	8	15394	15401	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015919	TTTA	2	8	17363	17370	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015919	ATTT	2	8	18108	18115	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015919	TTAA	2	8	18150	18157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015919	TTAA	2	8	18206	18213	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015919	TAAA	2	8	20301	20308	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015919	ATGT	2	8	21037	21044	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015919	TTTG	2	8	23396	23403	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015919	TAAT	2	8	25297	25304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015919	TAAT	2	8	25407	25414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015919	TTAG	2	8	27324	27331	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015919	TTTG	2	8	27338	27345	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015919	TAAA	2	8	30700	30707	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015919	TTAA	2	8	32309	32316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015919	ATTA	2	8	34989	34996	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015919	AATT	2	8	40458	40465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015919	ATTT	2	8	41348	41355	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015919	ATTT	2	8	41419	41426	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015919	GATT	2	8	41913	41920	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015919	TAAT	2	8	43024	43031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015919	ATTA	2	8	43033	43040	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015919	ATTA	2	8	45506	45513	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015919	ATTA	2	8	45523	45530	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015919	AGTT	2	8	45544	45551	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015919	AATA	2	8	45569	45576	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015919	TAAA	2	8	45577	45584	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015919	GATT	2	8	45779	45786	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015919	ATTT	2	8	46731	46738	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015919	ATTA	2	8	48496	48503	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015919	TATT	2	8	50631	50638	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015919	ATTT	2	8	50836	50843	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015919	TGTT	2	8	51700	51707	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015919	TTAT	2	8	52860	52867	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015919	AAAT	2	8	53240	53247	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015919	ATTA	2	8	54254	54261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.