MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia bissettii DN127 plasmid lp54

Total Repeats: 157

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015919	TTA	2	6	11	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015919	TAA	2	6	23	28	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015919	TAA	2	6	96	101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015919	ATT	2	6	109	114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015919	TAA	2	6	122	127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015919	TAA	3	9	134	142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015919	ATA	2	6	324	329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015919	AAC	2	6	346	351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_015919	TTA	2	6	396	401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015919	AGA	2	6	407	412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015919	CTT	2	6	431	436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_015919	TAT	2	6	477	482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015919	TCT	2	6	560	565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_015919	TCT	2	6	581	586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_015919	TAT	2	6	642	647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015919	ATA	2	6	691	696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015919	ACA	2	6	1199	1204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_015919	CAA	2	6	1243	1248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_015919	ATT	2	6	1374	1379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015919	AAC	2	6	1408	1413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_015919	TAA	3	9	1414	1422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015919	ATT	2	6	1425	1430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015919	ATT	2	6	1451	1456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015919	AAT	2	6	1487	1492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015919	TAG	2	6	2058	2063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015919	ACT	2	6	2070	2075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_015919	AGA	2	6	3001	3006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015919	ATT	2	6	4321	4326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015919	ATT	2	6	4378	4383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015919	TTA	2	6	4386	4391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015919	TGT	2	6	4411	4416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015919	TAA	2	6	4519	4524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015919	ATT	2	6	4530	4535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015919	TAA	2	6	4536	4541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015919	CAA	2	6	4624	4629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_015919	ATA	2	6	5271	5276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015919	TTA	2	6	9400	9405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015919	TTA	2	6	11277	11282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015919	ACT	2	6	11392	11397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_015919	AAT	2	6	11536	11541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015919	TAA	2	6	11551	11556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015919	AAT	2	6	11611	11616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015919	TTA	2	6	11634	11639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015919	ATA	2	6	11643	11648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015919	TAT	2	6	11652	11657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015919	ACT	2	6	11784	11789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_015919	AGG	2	6	14390	14395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015919	TAT	2	6	15178	15183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015919	GTT	2	6	15908	15913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015919	TTG	2	6	15964	15969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015919	TGG	2	6	16059	16064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015919	TAA	2	6	16686	16691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015919	AGC	2	6	16693	16698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_015919	CCT	2	6	17346	17351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_015919	TTA	2	6	17395	17400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015919	TAT	2	6	17669	17674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015919	CCG	2	6	18057	18062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_015919	CAA	2	6	18064	18069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_015919	TTA	2	6	18116	18121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015919	ATT	2	6	18158	18163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015919	ATA	2	6	18165	18170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015919	AAT	2	6	18177	18182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015919	TTA	2	6	20211	20216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015919	ATT	2	6	20220	20225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015919	TTG	2	6	20431	20436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015919	TAT	2	6	20459	20464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015919	AAG	2	6	20475	20480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015919	TTA	2	6	20966	20971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015919	TCC	2	6	21092	21097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_015919	TAA	2	6	21669	21674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015919	CCT	2	6	23325	23330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_015919	TAA	2	6	23342	23347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015919	AAG	2	6	23581	23586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015919	TTG	2	6	23598	23603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015919	AAT	2	6	23650	23655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015919	GAC	2	6	23715	23720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_015919	TTA	2	6	23759	23764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015919	TTA	2	6	24491	24496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015919	ATT	2	6	25220	25225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015919	ATA	3	9	25420	25428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015919	ATA	2	6	25454	25459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015919	ATT	2	6	27418	27423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015919	AGG	2	6	30730	30735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015919	TTG	2	6	32258	32263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015919	TTA	2	6	35897	35902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015919	TAA	2	6	35921	35926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015919	TAA	2	6	39045	39050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015919	TAA	2	6	39132	39137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015919	ATT	2	6	39424	39429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015919	ATA	3	9	40390	40398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015919	ATT	2	6	40402	40407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015919	TAG	2	6	40451	40456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015919	AAG	2	6	40474	40479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015919	CTT	2	6	40498	40503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_015919	AGT	2	6	40519	40524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015919	ATT	2	6	40525	40530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015919	TAA	2	6	40691	40696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015919	ATT	2	6	41402	41407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015919	ATT	2	6	41470	41475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015919	AAG	2	6	41556	41561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015919	ACA	2	6	41827	41832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_015919	AAT	2	6	41898	41903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015919	TAT	2	6	41921	41926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015919	TAA	2	6	43060	43065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015919	AAT	2	6	43151	43156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015919	TAA	2	6	44048	44053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015919	ATT	2	6	44072	44077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015919	TCT	2	6	44152	44157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_015919	TAA	2	6	45495	45500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015919	ATT	2	6	45534	45539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015919	AAT	2	6	45562	45567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015919	ATT	2	6	45633	45638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015919	AAT	2	6	45682	45687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015919	TTA	2	6	45690	45695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015919	ATT	2	6	45717	45722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015919	GAA	2	6	45827	45832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015919	ATT	2	6	45867	45872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015919	TTA	2	6	46585	46590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015919	CAA	2	6	46624	46629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_015919	ATT	2	6	46642	46647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015919	TTA	2	6	46691	46696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015919	TTA	2	6	46703	46708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015919	GAA	2	6	46767	46772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015919	GCA	2	6	46800	46805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_015919	TTA	2	6	47619	47624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015919	TAA	2	6	48518	48523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015919	ATT	2	6	48558	48563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015919	GAA	2	6	48646	48651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015919	ATA	2	6	49548	49553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015919	TAA	2	6	49568	49573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015919	ATA	3	9	49581	49589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015919	TAT	2	6	49618	49623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015919	GAA	2	6	49693	49698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015919	TAA	2	6	50654	50659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015919	CAA	2	6	50673	50678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_015919	TTG	2	6	50725	50730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015919	GAA	2	6	50793	50798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015919	AAT	2	6	51663	51668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015919	ATA	2	6	51722	51727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015919	ATT	3	9	51760	51768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015919	AAC	2	6	51841	51846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_015919	TTA	2	6	52777	52782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015919	TTA	2	6	52784	52789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015919	GTT	2	6	52854	52859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015919	TAA	2	6	52881	52886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015919	TTG	2	6	52942	52947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015919	TTA	2	6	52984	52989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015919	TGA	2	6	53025	53030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015919	TAA	3	9	53060	53068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015919	AAT	2	6	54112	54117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_015919	GTT	2	6	54206	54211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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153	NC_015919	AAT	2	6	54245	54250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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157	NC_015919	TTA	2	6	55209	55214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.