MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Borrelia bissettii DN127 plasmid lp54

Total Repeats: 90

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015919	AT	3	6	220	225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015919	AC	3	6	766	771	50 %	0 %	0 %	50 %	343127254
3	NC_015919	CT	4	8	1269	1276	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_015919	TA	3	6	2012	2017	50 %	50 %	0 %	0 %	343127255
5	NC_015919	CT	4	8	2473	2480	0 %	50 %	0 %	50 %	343127256
6	NC_015919	TC	3	6	2871	2876	0 %	50 %	0 %	50 %	343127256
7	NC_015919	TA	3	6	3091	3096	50 %	50 %	0 %	0 %	343127257
8	NC_015919	AG	3	6	3155	3160	50 %	0 %	50 %	0 %	343127257
9	NC_015919	AT	3	6	5252	5257	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015919	CA	3	6	6438	6443	50 %	0 %	0 %	50 %	343127260
11	NC_015919	AC	3	6	6992	6997	50 %	0 %	0 %	50 %	343127261
12	NC_015919	AC	3	6	7611	7616	50 %	0 %	0 %	50 %	343127262
13	NC_015919	AC	3	6	7941	7946	50 %	0 %	0 %	50 %	343127262
14	NC_015919	AT	3	6	8593	8598	50 %	50 %	0 %	0 %	343127264
15	NC_015919	AG	3	6	8744	8749	50 %	0 %	50 %	0 %	343127264
16	NC_015919	AT	3	6	9497	9502	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015919	TA	3	6	11232	11237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015919	TA	3	6	11301	11306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015919	AC	3	6	11935	11940	50 %	0 %	0 %	50 %	343127268
20	NC_015919	TA	4	8	12263	12270	50 %	50 %	0 %	0 %	343127268
21	NC_015919	AT	4	8	13819	13826	50 %	50 %	0 %	0 %	343127270
22	NC_015919	TA	3	6	13995	14000	50 %	50 %	0 %	0 %	343127270
23	NC_015919	TG	3	6	14048	14053	0 %	50 %	50 %	0 %	343127270
24	NC_015919	AC	4	8	14188	14195	50 %	0 %	0 %	50 %	343127270
25	NC_015919	GA	4	8	14250	14257	50 %	0 %	50 %	0 %	343127270
26	NC_015919	AT	3	6	15309	15314	50 %	50 %	0 %	0 %	343127272
27	NC_015919	AG	3	6	15708	15713	50 %	0 %	50 %	0 %	343127273
28	NC_015919	AG	3	6	17794	17799	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015919	AT	3	6	18071	18076	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015919	AT	3	6	18140	18145	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015919	AT	3	6	18249	18254	50 %	50 %	0 %	0 %	343127278
32	NC_015919	GA	4	8	18679	18686	50 %	0 %	50 %	0 %	343127278
33	NC_015919	GA	3	6	18747	18752	50 %	0 %	50 %	0 %	343127278
34	NC_015919	AG	4	8	19845	19852	50 %	0 %	50 %	0 %	343127279
35	NC_015919	TC	3	6	20516	20521	0 %	50 %	0 %	50 %	343127280
36	NC_015919	AG	3	6	20840	20845	50 %	0 %	50 %	0 %	343127281
37	NC_015919	AG	3	6	20885	20890	50 %	0 %	50 %	0 %	343127281
38	NC_015919	AT	3	6	21002	21007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015919	AT	3	6	21130	21135	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015919	TA	4	8	21141	21148	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015919	GA	4	8	21251	21258	50 %	0 %	50 %	0 %	343127282
42	NC_015919	AG	3	6	21631	21636	50 %	0 %	50 %	0 %	343127282
43	NC_015919	AT	3	6	21998	22003	50 %	50 %	0 %	0 %	343127283
44	NC_015919	GT	3	6	22782	22787	0 %	50 %	50 %	0 %	343127283
45	NC_015919	GA	4	8	22817	22824	50 %	0 %	50 %	0 %	343127283
46	NC_015919	AT	4	8	23623	23630	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015919	CT	3	6	23631	23636	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_015919	AT	3	6	24483	24488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015919	CT	3	6	25158	25163	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_015919	TG	3	6	27770	27775	0 %	50 %	50 %	0 %	343127289
51	NC_015919	TA	3	6	28097	28102	50 %	50 %	0 %	0 %	343127290
52	NC_015919	GA	3	6	28396	28401	50 %	0 %	50 %	0 %	343127290
53	NC_015919	AT	3	6	28817	28822	50 %	50 %	0 %	0 %	343127290
54	NC_015919	AT	3	6	29485	29490	50 %	50 %	0 %	0 %	343127292
55	NC_015919	AG	3	6	29886	29891	50 %	0 %	50 %	0 %	343127293
56	NC_015919	AG	3	6	30612	30617	50 %	0 %	50 %	0 %	343127294
57	NC_015919	CT	3	6	31399	31404	0 %	50 %	0 %	50 %	343127295
58	NC_015919	TC	3	6	31456	31461	0 %	50 %	0 %	50 %	343127295
59	NC_015919	GA	3	6	31812	31817	50 %	0 %	50 %	0 %	343127296
60	NC_015919	AG	3	6	32545	32550	50 %	0 %	50 %	0 %	343127297
61	NC_015919	GA	3	6	33873	33878	50 %	0 %	50 %	0 %	343127299
62	NC_015919	TC	3	6	34592	34597	0 %	50 %	0 %	50 %	343127300
63	NC_015919	AG	3	6	36357	36362	50 %	0 %	50 %	0 %	343127302
64	NC_015919	AG	3	6	36477	36482	50 %	0 %	50 %	0 %	343127302
65	NC_015919	AG	3	6	36835	36840	50 %	0 %	50 %	0 %	343127302
66	NC_015919	AT	3	6	39086	39091	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015919	AT	3	6	39094	39099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015919	TA	3	6	39458	39463	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015919	AT	3	6	39525	39530	50 %	50 %	0 %	0 %	343127307
70	NC_015919	CT	3	6	40145	40150	0 %	50 %	0 %	50 %	343127307
71	NC_015919	TA	3	6	40387	40392	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015919	TA	3	6	40564	40569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015919	GT	3	6	40664	40669	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015919	AG	3	6	42922	42927	50 %	0 %	50 %	0 %	343127311
75	NC_015919	CT	3	6	43122	43127	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_015919	GT	3	6	44411	44416	0 %	50 %	50 %	0 %	343127313
77	NC_015919	GT	3	6	44678	44683	0 %	50 %	50 %	0 %	343127313
78	NC_015919	AG	4	8	46830	46837	50 %	0 %	50 %	0 %	343127315
79	NC_015919	TG	3	6	48065	48070	0 %	50 %	50 %	0 %	343127317
80	NC_015919	TA	3	6	48116	48121	50 %	50 %	0 %	0 %	343127317
81	NC_015919	AT	3	6	49730	49735	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015919	CA	4	8	51854	51861	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_015919	TC	3	6	52067	52072	0 %	50 %	0 %	50 %	343127321
84	NC_015919	GT	3	6	52228	52233	0 %	50 %	50 %	0 %	343127321
85	NC_015919	TA	3	6	54078	54083	50 %	50 %	0 %	0 %	343127322
86	NC_015919	TA	3	6	54150	54155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015919	AG	3	6	54413	54418	50 %	0 %	50 %	0 %	343127323
88	NC_015919	CA	3	6	54468	54473	50 %	0 %	0 %	50 %	343127323
89	NC_015919	AG	3	6	54594	54599	50 %	0 %	50 %	0 %	343127323
90	NC_015919	TA	3	6	54796	54801	50 %	50 %	0 %	0 %	343127323

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.