MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Borrelia bissettii DN127 plasmid lp28-7

Total Repeats: 34

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015918	TCTTT	2	10	677	686	0 %	80 %	0 %	20 %	343127184
2	NC_015918	AAGTA	2	10	2261	2270	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015918	ATTAA	2	10	2952	2961	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015918	ATATT	2	10	3193	3202	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015918	TCAAA	2	10	3373	3382	60 %	20 %	0 %	20 %	343127187
6	NC_015918	TAACA	2	10	3447	3456	60 %	20 %	0 %	20 %	343127187
7	NC_015918	TTGAT	2	10	4612	4621	20 %	60 %	20 %	0 %	343127189
8	NC_015918	TAATA	2	10	6955	6964	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015918	AAAAT	2	10	7062	7071	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015918	TAATA	2	10	7079	7088	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015918	ATTAT	2	10	7505	7514	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015918	TAATT	2	10	7649	7658	40 %	60 %	0 %	0 %	343127193
13	NC_015918	TTTCT	2	10	7721	7730	0 %	80 %	0 %	20 %	343127193
14	NC_015918	ATTTT	2	10	7749	7758	20 %	80 %	0 %	0 %	343127193
15	NC_015918	TAAAG	2	10	8325	8334	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015918	ATTTG	2	10	9200	9209	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015918	ATTTA	2	10	9441	9450	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015918	ACATT	2	10	10281	10290	40 %	40 %	0 %	20 %	343127194
19	NC_015918	TTTCA	2	10	10486	10495	20 %	60 %	0 %	20 %	343127194
20	NC_015918	TTCTT	2	10	15878	15887	0 %	80 %	0 %	20 %	343127201
21	NC_015918	TGTTT	2	10	16450	16459	0 %	80 %	20 %	0 %	343127201
22	NC_015918	TTAAT	2	10	16498	16507	40 %	60 %	0 %	0 %	343127201
23	NC_015918	AATCT	2	10	16888	16897	40 %	40 %	0 %	20 %	343127201
24	NC_015918	ATTTT	2	10	17887	17896	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015918	ATTAA	2	10	17984	17993	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015918	ACACT	2	10	18168	18177	40 %	20 %	0 %	40 %	343127202
27	NC_015918	GAAAA	2	10	18618	18627	80 %	0 %	20 %	0 %	343127202
28	NC_015918	AATAA	2	10	18660	18669	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015918	TTTAA	2	10	19272	19281	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015918	CGATA	2	10	19771	19780	40 %	20 %	20 %	20 %	343127204
31	NC_015918	AAAAT	3	15	20017	20031	80 %	20 %	0 %	0 %	343127205
32	NC_015918	TTTAT	2	10	25000	25009	20 %	80 %	0 %	0 %	343127211
33	NC_015918	AAATT	2	10	26857	26866	60 %	40 %	0 %	0 %	343127213
34	NC_015918	CCCCA	2	10	28715	28724	20 %	0 %	0 %	80 %	343127216

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.