MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia bissettii DN127 plasmid lp28-7

Total Repeats: 86

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015918	ATCT	2	8	486	493	25 %	50 %	0 %	25 %	343127184
2	NC_015918	AATA	2	8	806	813	75 %	25 %	0 %	0 %	343127184
3	NC_015918	AACA	2	8	2475	2482	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_015918	TTTG	2	8	2650	2657	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015918	AAAC	2	8	3016	3023	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_015918	ATAA	2	8	3427	3434	75 %	25 %	0 %	0 %	343127187
7	NC_015918	CATA	2	8	3839	3846	50 %	25 %	0 %	25 %	343127187
8	NC_015918	TAAA	2	8	3854	3861	75 %	25 %	0 %	0 %	343127187
9	NC_015918	ATTC	2	8	3937	3944	25 %	50 %	0 %	25 %	343127187
10	NC_015918	CTTT	2	8	4297	4304	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_015918	TATT	2	8	4985	4992	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015918	TTAA	2	8	5940	5947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015918	AAAC	2	8	6105	6112	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_015918	TAAT	2	8	6377	6384	50 %	50 %	0 %	0 %	343127192
15	NC_015918	AACA	3	12	6538	6549	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_015918	GTAT	2	8	6780	6787	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015918	ATAA	2	8	7100	7107	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015918	ATAA	2	8	7907	7914	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015918	AGAT	2	8	7927	7934	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015918	ATAA	2	8	8517	8524	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015918	TAAT	2	8	8828	8835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015918	ATAA	2	8	8975	8982	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015918	TACT	2	8	9290	9297	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_015918	TAAT	2	8	9499	9506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015918	ACTT	2	8	9724	9731	25 %	50 %	0 %	25 %	343127194
26	NC_015918	CTTT	2	8	10374	10381	0 %	75 %	0 %	25 %	343127194
27	NC_015918	TCTT	2	8	10730	10737	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_015918	TAAA	2	8	10824	10831	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015918	GCAA	2	8	11203	11210	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_015918	ATTA	2	8	11821	11828	50 %	50 %	0 %	0 %	343127196
31	NC_015918	AATC	2	8	11844	11851	50 %	25 %	0 %	25 %	343127196
32	NC_015918	GATT	2	8	13065	13072	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015918	TAAT	2	8	13088	13095	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015918	TGCA	2	8	13362	13369	25 %	25 %	25 %	25 %	343127197
35	NC_015918	TAAT	2	8	13820	13827	50 %	50 %	0 %	0 %	343127198
36	NC_015918	AAGA	2	8	14230	14237	75 %	0 %	25 %	0 %	343127198
37	NC_015918	ATTT	2	8	14313	14320	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015918	TTTA	2	8	14652	14659	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015918	ATTT	2	8	14696	14703	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015918	TAAA	2	8	14722	14729	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015918	ATAA	2	8	14814	14821	75 %	25 %	0 %	0 %	343127199
42	NC_015918	TAAA	2	8	15318	15325	75 %	25 %	0 %	0 %	343127200
43	NC_015918	TAAA	2	8	15600	15607	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015918	ATAA	2	8	15701	15708	75 %	25 %	0 %	0 %	343127201
45	NC_015918	ATTT	2	8	15712	15719	25 %	75 %	0 %	0 %	343127201
46	NC_015918	ATAA	2	8	15996	16003	75 %	25 %	0 %	0 %	343127201
47	NC_015918	TAAA	2	8	16195	16202	75 %	25 %	0 %	0 %	343127201
48	NC_015918	GAAG	2	8	16371	16378	50 %	0 %	50 %	0 %	343127201
49	NC_015918	ATAA	2	8	17555	17562	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015918	AATA	2	8	17640	17647	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015918	ATTA	2	8	17707	17714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015918	AAAT	2	8	17786	17793	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015918	ATTA	2	8	17911	17918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015918	TAAA	2	8	17970	17977	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015918	TAGA	2	8	18561	18568	50 %	25 %	25 %	0 %	343127202
56	NC_015918	TAAT	2	8	18874	18881	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015918	GGAA	2	8	20514	20521	50 %	0 %	50 %	0 %	343127205
58	NC_015918	ATTA	2	8	20855	20862	50 %	50 %	0 %	0 %	343127206
59	NC_015918	CTTT	2	8	21099	21106	0 %	75 %	0 %	25 %	343127206
60	NC_015918	AAAT	2	8	21146	21153	75 %	25 %	0 %	0 %	343127206
61	NC_015918	TTAT	2	8	21246	21253	25 %	75 %	0 %	0 %	343127206
62	NC_015918	TTCT	2	8	21391	21398	0 %	75 %	0 %	25 %	343127207
63	NC_015918	ATTT	2	8	21473	21480	25 %	75 %	0 %	0 %	343127207
64	NC_015918	TGAC	2	8	21594	21601	25 %	25 %	25 %	25 %	343127207
65	NC_015918	TTGT	2	8	22041	22048	0 %	75 %	25 %	0 %	343127207
66	NC_015918	GAAT	2	8	22124	22131	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015918	GCTT	2	8	22364	22371	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_015918	CCAA	2	8	23067	23074	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_015918	TGAT	2	8	23103	23110	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015918	GGAA	2	8	24015	24022	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015918	GATA	2	8	25379	25386	50 %	25 %	25 %	0 %	343127211
72	NC_015918	ATCA	2	8	25389	25396	50 %	25 %	0 %	25 %	343127211
73	NC_015918	TTGA	2	8	25778	25785	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015918	TAAA	2	8	25800	25807	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015918	TTGA	2	8	26921	26928	25 %	50 %	25 %	0 %	343127213
76	NC_015918	GAAT	2	8	27069	27076	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015918	AATC	2	8	27133	27140	50 %	25 %	0 %	25 %	343127214
78	NC_015918	ATTC	2	8	27148	27155	25 %	50 %	0 %	25 %	343127214
79	NC_015918	ATTA	2	8	27413	27420	50 %	50 %	0 %	0 %	343127214
80	NC_015918	TATG	2	8	28506	28513	25 %	50 %	25 %	0 %	343127216
81	NC_015918	ATTA	2	8	29490	29497	50 %	50 %	0 %	0 %	343127218
82	NC_015918	TTGA	2	8	29747	29754	25 %	50 %	25 %	0 %	343127219
83	NC_015918	TAAT	2	8	29955	29962	50 %	50 %	0 %	0 %	343127219
84	NC_015918	ATAG	2	8	29976	29983	50 %	25 %	25 %	0 %	343127219
85	NC_015918	GAAT	2	8	30220	30227	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015918	ATTT	2	8	30236	30243	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.