MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia bissettii DN127 plasmid lp28-7

Total Repeats: 44

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015918	AACA	2	8	2475	2482	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_015918	TTTG	2	8	2650	2657	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015918	AAAC	2	8	3016	3023	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_015918	CTTT	2	8	4297	4304	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_015918	TATT	2	8	4985	4992	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015918	TTAA	2	8	5940	5947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015918	AAAC	2	8	6105	6112	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_015918	AACA	3	12	6538	6549	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_015918	GTAT	2	8	6780	6787	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015918	ATAA	2	8	7100	7107	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015918	ATAA	2	8	7907	7914	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015918	AGAT	2	8	7927	7934	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015918	ATAA	2	8	8517	8524	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015918	TAAT	2	8	8828	8835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015918	ATAA	2	8	8975	8982	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015918	TACT	2	8	9290	9297	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_015918	TAAT	2	8	9499	9506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015918	TCTT	2	8	10730	10737	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_015918	TAAA	2	8	10824	10831	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015918	GCAA	2	8	11203	11210	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_015918	GATT	2	8	13065	13072	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015918	TAAT	2	8	13088	13095	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015918	ATTT	2	8	14313	14320	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015918	TTTA	2	8	14652	14659	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015918	ATTT	2	8	14696	14703	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015918	TAAA	2	8	14722	14729	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015918	TAAA	2	8	15600	15607	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015918	ATAA	2	8	17555	17562	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015918	AATA	2	8	17640	17647	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015918	ATTA	2	8	17707	17714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015918	AAAT	2	8	17786	17793	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015918	ATTA	2	8	17911	17918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015918	TAAA	2	8	17970	17977	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015918	TAAT	2	8	18874	18881	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015918	GAAT	2	8	22124	22131	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015918	GCTT	2	8	22364	22371	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_015918	CCAA	2	8	23067	23074	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_015918	TGAT	2	8	23103	23110	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015918	GGAA	2	8	24015	24022	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015918	TTGA	2	8	25778	25785	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015918	TAAA	2	8	25800	25807	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015918	GAAT	2	8	27069	27076	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015918	GAAT	2	8	30220	30227	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015918	ATTT	2	8	30236	30243	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.