Tetra-nucleotide Coding Repeats of Borrelia bissettii DN127 plasmid lp28-7
Total Repeats: 42
S.No. | Genome ID | Motif | Iterations | Length | Start | End | A% | T% | G% | C% | Protein ID |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | NC_015918 | ATCT | 2 | 8 | 486 | 493 | 25 % | 50 % | 0 % | 25 % | 343127184 |
2 | NC_015918 | AATA | 2 | 8 | 806 | 813 | 75 % | 25 % | 0 % | 0 % | 343127184 |
3 | NC_015918 | ATAA | 2 | 8 | 3427 | 3434 | 75 % | 25 % | 0 % | 0 % | 343127187 |
4 | NC_015918 | CATA | 2 | 8 | 3839 | 3846 | 50 % | 25 % | 0 % | 25 % | 343127187 |
5 | NC_015918 | TAAA | 2 | 8 | 3854 | 3861 | 75 % | 25 % | 0 % | 0 % | 343127187 |
6 | NC_015918 | ATTC | 2 | 8 | 3937 | 3944 | 25 % | 50 % | 0 % | 25 % | 343127187 |
7 | NC_015918 | TAAT | 2 | 8 | 6377 | 6384 | 50 % | 50 % | 0 % | 0 % | 343127192 |
8 | NC_015918 | ACTT | 2 | 8 | 9724 | 9731 | 25 % | 50 % | 0 % | 25 % | 343127194 |
9 | NC_015918 | CTTT | 2 | 8 | 10374 | 10381 | 0 % | 75 % | 0 % | 25 % | 343127194 |
10 | NC_015918 | ATTA | 2 | 8 | 11821 | 11828 | 50 % | 50 % | 0 % | 0 % | 343127196 |
11 | NC_015918 | AATC | 2 | 8 | 11844 | 11851 | 50 % | 25 % | 0 % | 25 % | 343127196 |
12 | NC_015918 | TGCA | 2 | 8 | 13362 | 13369 | 25 % | 25 % | 25 % | 25 % | 343127197 |
13 | NC_015918 | TAAT | 2 | 8 | 13820 | 13827 | 50 % | 50 % | 0 % | 0 % | 343127198 |
14 | NC_015918 | AAGA | 2 | 8 | 14230 | 14237 | 75 % | 0 % | 25 % | 0 % | 343127198 |
15 | NC_015918 | ATAA | 2 | 8 | 14814 | 14821 | 75 % | 25 % | 0 % | 0 % | 343127199 |
16 | NC_015918 | TAAA | 2 | 8 | 15318 | 15325 | 75 % | 25 % | 0 % | 0 % | 343127200 |
17 | NC_015918 | ATAA | 2 | 8 | 15701 | 15708 | 75 % | 25 % | 0 % | 0 % | 343127201 |
18 | NC_015918 | ATTT | 2 | 8 | 15712 | 15719 | 25 % | 75 % | 0 % | 0 % | 343127201 |
19 | NC_015918 | ATAA | 2 | 8 | 15996 | 16003 | 75 % | 25 % | 0 % | 0 % | 343127201 |
20 | NC_015918 | TAAA | 2 | 8 | 16195 | 16202 | 75 % | 25 % | 0 % | 0 % | 343127201 |
21 | NC_015918 | GAAG | 2 | 8 | 16371 | 16378 | 50 % | 0 % | 50 % | 0 % | 343127201 |
22 | NC_015918 | TAGA | 2 | 8 | 18561 | 18568 | 50 % | 25 % | 25 % | 0 % | 343127202 |
23 | NC_015918 | GGAA | 2 | 8 | 20514 | 20521 | 50 % | 0 % | 50 % | 0 % | 343127205 |
24 | NC_015918 | ATTA | 2 | 8 | 20855 | 20862 | 50 % | 50 % | 0 % | 0 % | 343127206 |
25 | NC_015918 | CTTT | 2 | 8 | 21099 | 21106 | 0 % | 75 % | 0 % | 25 % | 343127206 |
26 | NC_015918 | AAAT | 2 | 8 | 21146 | 21153 | 75 % | 25 % | 0 % | 0 % | 343127206 |
27 | NC_015918 | TTAT | 2 | 8 | 21246 | 21253 | 25 % | 75 % | 0 % | 0 % | 343127206 |
28 | NC_015918 | TTCT | 2 | 8 | 21391 | 21398 | 0 % | 75 % | 0 % | 25 % | 343127207 |
29 | NC_015918 | ATTT | 2 | 8 | 21473 | 21480 | 25 % | 75 % | 0 % | 0 % | 343127207 |
30 | NC_015918 | TGAC | 2 | 8 | 21594 | 21601 | 25 % | 25 % | 25 % | 25 % | 343127207 |
31 | NC_015918 | TTGT | 2 | 8 | 22041 | 22048 | 0 % | 75 % | 25 % | 0 % | 343127207 |
32 | NC_015918 | GATA | 2 | 8 | 25379 | 25386 | 50 % | 25 % | 25 % | 0 % | 343127211 |
33 | NC_015918 | ATCA | 2 | 8 | 25389 | 25396 | 50 % | 25 % | 0 % | 25 % | 343127211 |
34 | NC_015918 | TTGA | 2 | 8 | 26921 | 26928 | 25 % | 50 % | 25 % | 0 % | 343127213 |
35 | NC_015918 | AATC | 2 | 8 | 27133 | 27140 | 50 % | 25 % | 0 % | 25 % | 343127214 |
36 | NC_015918 | ATTC | 2 | 8 | 27148 | 27155 | 25 % | 50 % | 0 % | 25 % | 343127214 |
37 | NC_015918 | ATTA | 2 | 8 | 27413 | 27420 | 50 % | 50 % | 0 % | 0 % | 343127214 |
38 | NC_015918 | TATG | 2 | 8 | 28506 | 28513 | 25 % | 50 % | 25 % | 0 % | 343127216 |
39 | NC_015918 | ATTA | 2 | 8 | 29490 | 29497 | 50 % | 50 % | 0 % | 0 % | 343127218 |
40 | NC_015918 | TTGA | 2 | 8 | 29747 | 29754 | 25 % | 50 % | 25 % | 0 % | 343127219 |
41 | NC_015918 | TAAT | 2 | 8 | 29955 | 29962 | 50 % | 50 % | 0 % | 0 % | 343127219 |
42 | NC_015918 | ATAG | 2 | 8 | 29976 | 29983 | 50 % | 25 % | 25 % | 0 % | 343127219 |