MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Borrelia bissettii DN127 plasmid lp28-7

Total Repeats: 426

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015918	ACA	2	6	35	40	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_015918	ATA	2	6	105	110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015918	ATT	2	6	117	122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015918	ACA	3	9	123	131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_015918	CTT	2	6	227	232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_015918	TAA	3	9	341	349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127184
7	NC_015918	ACT	2	6	400	405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127184
8	NC_015918	ACT	2	6	457	462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127184
9	NC_015918	TAA	2	6	653	658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127184
10	NC_015918	GAT	2	6	819	824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127184
11	NC_015918	ACT	2	6	841	846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127184
12	NC_015918	TAT	2	6	940	945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127184
13	NC_015918	ATA	2	6	952	957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127184
14	NC_015918	ATC	2	6	961	966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127184
15	NC_015918	CTA	3	9	978	986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127184
16	NC_015918	TAA	2	6	993	998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127184
17	NC_015918	ATT	2	6	1096	1101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127184
18	NC_015918	ATA	2	6	1312	1317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127184
19	NC_015918	TTA	2	6	1427	1432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127184
20	NC_015918	ATT	2	6	1439	1444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127184
21	NC_015918	TAA	2	6	1499	1504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015918	ACT	2	6	1519	1524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_015918	ATT	2	6	1544	1549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015918	AGG	2	6	1550	1555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015918	TGG	3	9	1763	1771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	343127185
26	NC_015918	ACT	2	6	1775	1780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127185
27	NC_015918	GGA	2	6	1797	1802	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	343127185
28	NC_015918	CAG	2	6	1861	1866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	343127185
29	NC_015918	TAA	2	6	1867	1872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127185
30	NC_015918	TAT	2	6	1882	1887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127185
31	NC_015918	AGG	2	6	1895	1900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	343127185
32	NC_015918	GCA	2	6	1911	1916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	343127185
33	NC_015918	ATT	3	9	1932	1940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127185
34	NC_015918	ATT	2	6	2097	2102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015918	AAT	2	6	2109	2114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015918	CTA	2	6	2128	2133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_015918	CTT	3	9	2232	2240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_015918	CAT	2	6	2374	2379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_015918	TTG	2	6	2677	2682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015918	AGA	2	6	2698	2703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015918	TAA	2	6	2816	2821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127186
42	NC_015918	AAT	3	9	2824	2832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127186
43	NC_015918	ATA	2	6	2970	2975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015918	ACT	3	9	3081	3089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_015918	TAT	2	6	3115	3120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015918	TAT	2	6	3215	3220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015918	AGG	2	6	3238	3243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015918	ATA	2	6	3262	3267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127187
49	NC_015918	CAA	2	6	3399	3404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127187
50	NC_015918	ATC	2	6	3435	3440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127187
51	NC_015918	CTA	2	6	3521	3526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127187
52	NC_015918	CAA	2	6	3596	3601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127187
53	NC_015918	AAC	3	9	3605	3613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127187
54	NC_015918	AAC	3	9	3620	3628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127187
55	NC_015918	AAC	3	9	3635	3643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127187
56	NC_015918	AAC	3	9	3650	3658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127187
57	NC_015918	AAC	3	9	3665	3673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127187
58	NC_015918	AAC	3	9	3680	3688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127187
59	NC_015918	AAC	3	9	3695	3703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127187
60	NC_015918	AAC	3	9	3710	3718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127187
61	NC_015918	AAC	3	9	3725	3733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127187
62	NC_015918	AAC	2	6	3740	3745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127187
63	NC_015918	GAT	2	6	3913	3918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127187
64	NC_015918	ATT	2	6	3919	3924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127187
65	NC_015918	GAA	2	6	3994	3999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127187
66	NC_015918	AAG	2	6	4041	4046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127187
67	NC_015918	GAT	2	6	4069	4074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127187
68	NC_015918	ATT	2	6	4181	4186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127187
69	NC_015918	AAT	2	6	4198	4203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127187
70	NC_015918	TAT	2	6	4209	4214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127187
71	NC_015918	AAT	2	6	4235	4240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127187
72	NC_015918	TTA	2	6	4563	4568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015918	CTT	2	6	4642	4647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127189
74	NC_015918	TCT	2	6	4656	4661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127189
75	NC_015918	TCT	2	6	4914	4919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_015918	TAA	2	6	5001	5006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015918	TAA	2	6	5063	5068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015918	ATC	2	6	5078	5083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_015918	TTG	2	6	5121	5126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015918	ATA	2	6	5178	5183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015918	GAA	2	6	5195	5200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015918	ATT	3	9	5247	5255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127190
83	NC_015918	TCT	2	6	5405	5410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127190
84	NC_015918	TAT	2	6	5414	5419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127190
85	NC_015918	TAA	2	6	5474	5479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127190
86	NC_015918	ATC	2	6	5481	5486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127190
87	NC_015918	TCT	2	6	5503	5508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_015918	TAA	2	6	5655	5660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015918	TAA	2	6	5679	5684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015918	ATA	2	6	5687	5692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015918	TAA	2	6	5785	5790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015918	TAA	2	6	5798	5803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015918	TTA	2	6	5809	5814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015918	ATA	2	6	5826	5831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015918	TCT	2	6	5865	5870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_015918	ATT	2	6	5971	5976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015918	ACT	2	6	6025	6030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_015918	TAA	2	6	6077	6082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015918	AAG	3	9	6120	6128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015918	TAA	2	6	6133	6138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015918	AAG	2	6	6141	6146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015918	ATG	2	6	6277	6282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127191
103	NC_015918	TTA	2	6	6506	6511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127192
104	NC_015918	ATA	2	6	6522	6527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127192
105	NC_015918	GAA	2	6	6609	6614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015918	AAC	2	6	6850	6855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_015918	TAA	2	6	6927	6932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015918	ATT	2	6	7031	7036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015918	TAT	2	6	7055	7060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015918	ATA	2	6	7133	7138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015918	TAT	2	6	7208	7213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015918	TCA	2	6	7247	7252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_015918	ATA	2	6	7309	7314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015918	GGA	2	6	7364	7369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015918	AAT	2	6	7385	7390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015918	TGA	2	6	7438	7443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015918	TAA	2	6	7541	7546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015918	TAT	2	6	7582	7587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127193
119	NC_015918	TAT	2	6	7636	7641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127193
120	NC_015918	ATT	2	6	7709	7714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127193
121	NC_015918	ATC	2	6	7742	7747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127193
122	NC_015918	ATT	2	6	7763	7768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127193
123	NC_015918	AAG	2	6	7797	7802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127193
124	NC_015918	ATA	2	6	7816	7821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127193
125	NC_015918	TCT	2	6	7852	7857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_015918	TAA	2	6	7868	7873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015918	GCA	2	6	7948	7953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_015918	TAA	2	6	7980	7985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015918	TTA	2	6	8100	8105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015918	TTA	2	6	8145	8150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015918	TCT	2	6	8193	8198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_015918	TAT	2	6	8256	8261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015918	ATA	2	6	8339	8344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015918	AGT	2	6	8357	8362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015918	ATT	2	6	8477	8482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015918	TGA	2	6	8761	8766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015918	TTC	2	6	8786	8791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_015918	TTA	2	6	8992	8997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015918	TAT	2	6	9033	9038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015918	ATT	2	6	9472	9477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015918	CTT	2	6	9546	9551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127194
142	NC_015918	TAA	2	6	9568	9573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127194
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145	NC_015918	CTT	3	9	9792	9800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127194
146	NC_015918	TTG	2	6	9855	9860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343127194
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157	NC_015918	TTA	2	6	10643	10648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_015918	ATT	2	6	10660	10665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_015918	ATA	2	6	10682	10687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_015918	TTA	2	6	10786	10791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_015918	TAA	2	6	10970	10975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_015918	TCA	2	6	11052	11057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
164	NC_015918	ATT	2	6	11236	11241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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166	NC_015918	ATT	2	6	11437	11442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127196
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268	NC_015918	AGA	2	6	18257	18262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127202
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270	NC_015918	AAT	3	9	18326	18334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127202
271	NC_015918	TTA	2	6	18374	18379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127202
272	NC_015918	ATA	2	6	18390	18395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127202
273	NC_015918	GCG	2	6	18480	18485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	343127202
274	NC_015918	GAT	2	6	18503	18508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127202
275	NC_015918	GAA	2	6	18584	18589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127202
276	NC_015918	GAA	2	6	18593	18598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127202
277	NC_015918	AGA	3	9	18601	18609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127202
278	NC_015918	TAC	2	6	18649	18654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
279	NC_015918	CTT	2	6	18691	18696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
280	NC_015918	ATA	2	6	18740	18745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
281	NC_015918	TAC	3	9	18771	18779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
282	NC_015918	ACT	2	6	18927	18932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
283	NC_015918	AAT	2	6	18951	18956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127203
284	NC_015918	TAA	2	6	18962	18967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127203
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289	NC_015918	ATA	3	9	19243	19251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_015918	TTG	2	6	19260	19265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
291	NC_015918	CAA	2	6	19289	19294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
292	NC_015918	AAT	2	6	19459	19464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127204
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298	NC_015918	CCT	2	6	19960	19965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
299	NC_015918	TAA	2	6	19967	19972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
300	NC_015918	ATA	2	6	20073	20078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127205
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302	NC_015918	TAT	2	6	20129	20134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127205
303	NC_015918	AAT	2	6	20337	20342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127205
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324	NC_015918	TAG	2	6	22166	22171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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332	NC_015918	GTT	2	6	23144	23149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
333	NC_015918	GTT	2	6	23213	23218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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390	NC_015918	TCT	2	6	27558	27563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
391	NC_015918	CGC	3	9	27626	27634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
392	NC_015918	CAG	2	6	27640	27645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
393	NC_015918	GCA	2	6	27648	27653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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395	NC_015918	TTC	2	6	27708	27713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
396	NC_015918	AGG	2	6	27792	27797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
397	NC_015918	AAG	2	6	27828	27833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127215
398	NC_015918	GCA	2	6	28153	28158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	343127215
399	NC_015918	GTA	2	6	28232	28237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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401	NC_015918	ACT	2	6	28280	28285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.