MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia bissettii DN127 plasmid lp28-7

Total Repeats: 242

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015918	TAA	3	9	341	349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127184
2	NC_015918	ACT	2	6	400	405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127184
3	NC_015918	ACT	2	6	457	462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127184
4	NC_015918	TAA	2	6	653	658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127184
5	NC_015918	GAT	2	6	819	824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127184
6	NC_015918	ACT	2	6	841	846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127184
7	NC_015918	TAT	2	6	940	945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127184
8	NC_015918	ATA	2	6	952	957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127184
9	NC_015918	ATC	2	6	961	966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127184
10	NC_015918	CTA	3	9	978	986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127184
11	NC_015918	TAA	2	6	993	998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127184
12	NC_015918	ATT	2	6	1096	1101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127184
13	NC_015918	ATA	2	6	1312	1317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127184
14	NC_015918	TTA	2	6	1427	1432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127184
15	NC_015918	ATT	2	6	1439	1444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127184
16	NC_015918	TGG	3	9	1763	1771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	343127185
17	NC_015918	ACT	2	6	1775	1780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127185
18	NC_015918	GGA	2	6	1797	1802	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	343127185
19	NC_015918	CAG	2	6	1861	1866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	343127185
20	NC_015918	TAA	2	6	1867	1872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127185
21	NC_015918	TAT	2	6	1882	1887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127185
22	NC_015918	AGG	2	6	1895	1900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	343127185
23	NC_015918	GCA	2	6	1911	1916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	343127185
24	NC_015918	ATT	3	9	1932	1940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127185
25	NC_015918	TAA	2	6	2816	2821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127186
26	NC_015918	AAT	3	9	2824	2832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127186
27	NC_015918	ATA	2	6	3262	3267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127187
28	NC_015918	CAA	2	6	3399	3404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127187
29	NC_015918	ATC	2	6	3435	3440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127187
30	NC_015918	CTA	2	6	3521	3526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127187
31	NC_015918	CAA	2	6	3596	3601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127187
32	NC_015918	AAC	3	9	3605	3613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127187
33	NC_015918	AAC	3	9	3620	3628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127187
34	NC_015918	AAC	3	9	3635	3643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127187
35	NC_015918	AAC	3	9	3650	3658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127187
36	NC_015918	AAC	3	9	3665	3673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127187
37	NC_015918	AAC	3	9	3680	3688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127187
38	NC_015918	AAC	3	9	3695	3703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127187
39	NC_015918	AAC	3	9	3710	3718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127187
40	NC_015918	AAC	3	9	3725	3733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127187
41	NC_015918	AAC	2	6	3740	3745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127187
42	NC_015918	GAT	2	6	3913	3918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127187
43	NC_015918	ATT	2	6	3919	3924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127187
44	NC_015918	GAA	2	6	3994	3999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127187
45	NC_015918	AAG	2	6	4041	4046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127187
46	NC_015918	GAT	2	6	4069	4074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127187
47	NC_015918	ATT	2	6	4181	4186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127187
48	NC_015918	AAT	2	6	4198	4203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127187
49	NC_015918	TAT	2	6	4209	4214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127187
50	NC_015918	AAT	2	6	4235	4240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127187
51	NC_015918	CTT	2	6	4642	4647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127189
52	NC_015918	TCT	2	6	4656	4661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127189
53	NC_015918	ATT	3	9	5247	5255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127190
54	NC_015918	TCT	2	6	5405	5410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127190
55	NC_015918	TAT	2	6	5414	5419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127190
56	NC_015918	TAA	2	6	5474	5479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127190
57	NC_015918	ATC	2	6	5481	5486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127190
58	NC_015918	ATG	2	6	6277	6282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127191
59	NC_015918	TTA	2	6	6506	6511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127192
60	NC_015918	ATA	2	6	6522	6527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127192
61	NC_015918	TAT	2	6	7582	7587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127193
62	NC_015918	TAT	2	6	7636	7641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127193
63	NC_015918	ATT	2	6	7709	7714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127193
64	NC_015918	ATC	2	6	7742	7747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127193
65	NC_015918	ATT	2	6	7763	7768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127193
66	NC_015918	AAG	2	6	7797	7802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127193
67	NC_015918	ATA	2	6	7816	7821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127193
68	NC_015918	CTT	2	6	9546	9551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127194
69	NC_015918	TAA	2	6	9568	9573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127194
70	NC_015918	TTG	2	6	9708	9713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343127194
71	NC_015918	CTT	2	6	9771	9776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127194
72	NC_015918	CTT	3	9	9792	9800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127194
73	NC_015918	TTG	2	6	9855	9860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343127194
74	NC_015918	AAT	2	6	9863	9868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127194
75	NC_015918	ATC	2	6	9976	9981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127194
76	NC_015918	TCA	2	6	9983	9988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127194
77	NC_015918	TTC	2	6	9991	9996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127194
78	NC_015918	TCA	2	6	10031	10036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127194
79	NC_015918	CAC	2	6	10146	10151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	343127194
80	NC_015918	TTG	2	6	10204	10209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343127194
81	NC_015918	TAA	2	6	10249	10254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127194
82	NC_015918	TTC	2	6	10270	10275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127194
83	NC_015918	ATT	2	6	11437	11442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127196
84	NC_015918	TGC	2	6	11464	11469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	343127196
85	NC_015918	GCT	2	6	11486	11491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	343127196
86	NC_015918	GTC	2	6	11524	11529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	343127196
87	NC_015918	TAC	2	6	11619	11624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127196
88	NC_015918	AAT	2	6	11753	11758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127196
89	NC_015918	CTG	2	6	11856	11861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	343127196
90	NC_015918	GAG	2	6	11886	11891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	343127196
91	NC_015918	ATC	2	6	11965	11970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127196
92	NC_015918	CTT	2	6	12108	12113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127196
93	NC_015918	ATT	2	6	12146	12151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127196
94	NC_015918	ATT	2	6	13158	13163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127197
95	NC_015918	AAT	2	6	13189	13194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127197
96	NC_015918	TAA	2	6	13251	13256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127197
97	NC_015918	TTA	2	6	13331	13336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127197
98	NC_015918	ATG	2	6	13388	13393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127197
99	NC_015918	CAA	2	6	13434	13439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127197
100	NC_015918	GCA	2	6	13450	13455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	343127197
101	NC_015918	TAT	2	6	13461	13466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127197
102	NC_015918	ATA	2	6	13572	13577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127198
103	NC_015918	GAA	2	6	13649	13654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127198
104	NC_015918	CTG	2	6	13862	13867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	343127198
105	NC_015918	ATT	2	6	14037	14042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127198
106	NC_015918	TTA	2	6	14047	14052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127198
107	NC_015918	AGA	2	6	14100	14105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127198
108	NC_015918	TGA	2	6	14199	14204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127198
109	NC_015918	TAA	3	9	14834	14842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127199
110	NC_015918	TGA	2	6	14945	14950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127199
111	NC_015918	AGA	2	6	14954	14959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127199
112	NC_015918	AAG	2	6	15060	15065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127199
113	NC_015918	TAA	2	6	15071	15076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127199
114	NC_015918	TTG	2	6	15132	15137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343127199
115	NC_015918	TTA	2	6	15161	15166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127200
116	NC_015918	AAC	2	6	15223	15228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127200
117	NC_015918	ATT	2	6	15250	15255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127200
118	NC_015918	TAA	2	6	15271	15276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127200
119	NC_015918	ATT	2	6	15312	15317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127200
120	NC_015918	ATT	2	6	15392	15397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127200
121	NC_015918	TAA	2	6	15749	15754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127201
122	NC_015918	TGC	2	6	15838	15843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	343127201
123	NC_015918	TAG	2	6	15910	15915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127201
124	NC_015918	CTT	2	6	16042	16047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127201
125	NC_015918	TGA	2	6	16117	16122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127201
126	NC_015918	CAA	2	6	16223	16228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127201
127	NC_015918	GTT	2	6	16230	16235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343127201
128	NC_015918	AGA	2	6	16322	16327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127201
129	NC_015918	ATA	2	6	16359	16364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127201
130	NC_015918	GAT	2	6	16461	16466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127201
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134	NC_015918	GAT	2	6	16802	16807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127201
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242	NC_015918	ATA	2	6	30159	30164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127219

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.