MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia bissettii DN127 plasmid lp28-4

Total Repeats: 58

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015917	TTAA	2	8	1395	1402	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015917	TTTA	2	8	1624	1631	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015917	TGAT	2	8	2941	2948	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015917	ATTT	2	8	3803	3810	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015917	AACT	2	8	3812	3819	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_015917	AAGC	2	8	5207	5214	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_015917	TTAA	2	8	6277	6284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015917	TTAA	2	8	6665	6672	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015917	CATT	2	8	6735	6742	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_015917	GATT	2	8	6821	6828	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015917	AAAG	2	8	6913	6920	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015917	TTTA	2	8	7182	7189	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015917	TCAT	2	8	7403	7410	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_015917	TTTA	2	8	8256	8263	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015917	AATA	2	8	8493	8500	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015917	TTTA	2	8	9235	9242	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015917	AAGA	2	8	9846	9853	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015917	AAGC	2	8	9978	9985	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_015917	AAAG	2	8	10029	10036	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015917	ATTT	2	8	10323	10330	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015917	TATT	2	8	13633	13640	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015917	GTTG	2	8	13976	13983	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015917	TAGT	2	8	14062	14069	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015917	ATTT	2	8	14293	14300	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015917	TTTG	2	8	14331	14338	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015917	AAAT	2	8	14651	14658	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015917	CTAT	2	8	14925	14932	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_015917	AGAT	2	8	15010	15017	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015917	TCCT	2	8	15366	15373	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_015917	TTTA	2	8	15547	15554	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015917	TAAT	2	8	16036	16043	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015917	TTAG	2	8	17255	17262	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015917	TTTA	2	8	17552	17559	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015917	TTAT	2	8	18068	18075	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015917	TTAA	2	8	19441	19448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015917	TATT	2	8	19578	19585	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015917	ATTT	2	8	19619	19626	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015917	AATT	2	8	19847	19854	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015917	TTTA	2	8	20284	20291	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015917	TAAA	2	8	20893	20900	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015917	ATAA	2	8	21049	21056	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015917	TTAT	2	8	21198	21205	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015917	GTTT	2	8	21560	21567	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015917	TTAA	2	8	21630	21637	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015917	TTTG	2	8	21682	21689	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015917	ACTT	2	8	21752	21759	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_015917	TGTT	2	8	21954	21961	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015917	CTTT	2	8	22302	22309	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_015917	ATCT	2	8	22671	22678	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_015917	TAGT	2	8	22694	22701	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015917	TTAA	2	8	22936	22943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015917	TTAA	2	8	23847	23854	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015917	ATCT	2	8	24161	24168	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_015917	TAAA	2	8	25179	25186	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015917	TAAA	2	8	25649	25656	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015917	TTTA	2	8	25891	25898	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015917	TTGA	2	8	26654	26661	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015917	ATTC	2	8	27133	27140	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.