Tetra-nucleotide Coding Repeats of Borrelia bissettii DN127 plasmid lp28-4
Total Repeats: 50
S.No. | Genome ID | Motif | Iterations | Length | Start | End | A% | T% | G% | C% | Protein ID |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | NC_015917 | GCTA | 2 | 8 | 475 | 482 | 25 % | 25 % | 25 % | 25 % | 343127153 |
2 | NC_015917 | TCTT | 2 | 8 | 670 | 677 | 0 % | 75 % | 0 % | 25 % | 343127153 |
3 | NC_015917 | AAAC | 2 | 8 | 699 | 706 | 75 % | 0 % | 0 % | 25 % | 343127153 |
4 | NC_015917 | GTTT | 2 | 8 | 1173 | 1180 | 0 % | 75 % | 25 % | 0 % | 343127153 |
5 | NC_015917 | TTGT | 2 | 8 | 1271 | 1278 | 0 % | 75 % | 25 % | 0 % | 343127153 |
6 | NC_015917 | TATC | 2 | 8 | 1684 | 1691 | 25 % | 50 % | 0 % | 25 % | 343127154 |
7 | NC_015917 | GGAT | 2 | 8 | 2158 | 2165 | 25 % | 25 % | 50 % | 0 % | 343127155 |
8 | NC_015917 | GAAA | 2 | 8 | 2307 | 2314 | 75 % | 0 % | 25 % | 0 % | 343127155 |
9 | NC_015917 | ATCA | 2 | 8 | 2529 | 2536 | 50 % | 25 % | 0 % | 25 % | 343127155 |
10 | NC_015917 | ATCA | 2 | 8 | 2689 | 2696 | 50 % | 25 % | 0 % | 25 % | 343127155 |
11 | NC_015917 | AAAG | 2 | 8 | 2804 | 2811 | 75 % | 0 % | 25 % | 0 % | 343127155 |
12 | NC_015917 | AATA | 2 | 8 | 3446 | 3453 | 75 % | 25 % | 0 % | 0 % | 343127157 |
13 | NC_015917 | CAAA | 2 | 8 | 3491 | 3498 | 75 % | 0 % | 0 % | 25 % | 343127157 |
14 | NC_015917 | TTAA | 2 | 8 | 3499 | 3506 | 50 % | 50 % | 0 % | 0 % | 343127157 |
15 | NC_015917 | CGGT | 2 | 8 | 4369 | 4376 | 0 % | 25 % | 50 % | 25 % | 343127159 |
16 | NC_015917 | AATT | 2 | 8 | 4697 | 4704 | 50 % | 50 % | 0 % | 0 % | 343127159 |
17 | NC_015917 | AAAC | 2 | 8 | 4845 | 4852 | 75 % | 0 % | 0 % | 25 % | 343127159 |
18 | NC_015917 | GCTT | 2 | 8 | 6067 | 6074 | 0 % | 50 % | 25 % | 25 % | 343127160 |
19 | NC_015917 | TTTG | 2 | 8 | 7705 | 7712 | 0 % | 75 % | 25 % | 0 % | 343127163 |
20 | NC_015917 | CATT | 2 | 8 | 10185 | 10192 | 25 % | 50 % | 0 % | 25 % | 343127164 |
21 | NC_015917 | CATC | 2 | 8 | 10467 | 10474 | 25 % | 25 % | 0 % | 50 % | 343127165 |
22 | NC_015917 | ATTT | 2 | 8 | 10777 | 10784 | 25 % | 75 % | 0 % | 0 % | 343127165 |
23 | NC_015917 | TAAT | 2 | 8 | 10851 | 10858 | 50 % | 50 % | 0 % | 0 % | 343127165 |
24 | NC_015917 | AATA | 2 | 8 | 11225 | 11232 | 75 % | 25 % | 0 % | 0 % | 343127166 |
25 | NC_015917 | TATT | 2 | 8 | 11578 | 11585 | 25 % | 75 % | 0 % | 0 % | 343127166 |
26 | NC_015917 | ATTT | 2 | 8 | 12001 | 12008 | 25 % | 75 % | 0 % | 0 % | 343127167 |
27 | NC_015917 | TTTG | 2 | 8 | 12110 | 12117 | 0 % | 75 % | 25 % | 0 % | 343127167 |
28 | NC_015917 | CATT | 2 | 8 | 12146 | 12153 | 25 % | 50 % | 0 % | 25 % | 343127167 |
29 | NC_015917 | TTTC | 2 | 8 | 12363 | 12370 | 0 % | 75 % | 0 % | 25 % | 343127168 |
30 | NC_015917 | ATTG | 2 | 8 | 13086 | 13093 | 25 % | 50 % | 25 % | 0 % | 343127168 |
31 | NC_015917 | GTTG | 2 | 8 | 13177 | 13184 | 0 % | 50 % | 50 % | 0 % | 343127168 |
32 | NC_015917 | GTTG | 2 | 8 | 13244 | 13251 | 0 % | 50 % | 50 % | 0 % | 343127168 |
33 | NC_015917 | TAAA | 2 | 8 | 13470 | 13477 | 75 % | 25 % | 0 % | 0 % | 343127168 |
34 | NC_015917 | AATC | 2 | 8 | 14855 | 14862 | 50 % | 25 % | 0 % | 25 % | 343127169 |
35 | NC_015917 | ATTA | 2 | 8 | 16619 | 16626 | 50 % | 50 % | 0 % | 0 % | 343127171 |
36 | NC_015917 | TTGT | 2 | 8 | 16671 | 16678 | 0 % | 75 % | 25 % | 0 % | 343127171 |
37 | NC_015917 | CTTT | 2 | 8 | 16857 | 16864 | 0 % | 75 % | 0 % | 25 % | 343127171 |
38 | NC_015917 | TAAA | 2 | 8 | 16990 | 16997 | 75 % | 25 % | 0 % | 0 % | 343127171 |
39 | NC_015917 | ATTT | 2 | 8 | 17615 | 17622 | 25 % | 75 % | 0 % | 0 % | 343127172 |
40 | NC_015917 | TTAA | 2 | 8 | 18364 | 18371 | 50 % | 50 % | 0 % | 0 % | 343127174 |
41 | NC_015917 | TATT | 2 | 8 | 18890 | 18897 | 25 % | 75 % | 0 % | 0 % | 343127174 |
42 | NC_015917 | ATTT | 2 | 8 | 19086 | 19093 | 25 % | 75 % | 0 % | 0 % | 343127174 |
43 | NC_015917 | TTAC | 2 | 8 | 20123 | 20130 | 25 % | 50 % | 0 % | 25 % | 343127175 |
44 | NC_015917 | TTGA | 2 | 8 | 23056 | 23063 | 25 % | 50 % | 25 % | 0 % | 343127177 |
45 | NC_015917 | GCTT | 2 | 8 | 23626 | 23633 | 0 % | 50 % | 25 % | 25 % | 343127177 |
46 | NC_015917 | GTAT | 2 | 8 | 24252 | 24259 | 25 % | 50 % | 25 % | 0 % | 343127178 |
47 | NC_015917 | CTTT | 2 | 8 | 24265 | 24272 | 0 % | 75 % | 0 % | 25 % | 343127178 |
48 | NC_015917 | AATT | 2 | 8 | 25077 | 25084 | 50 % | 50 % | 0 % | 0 % | 343127179 |
49 | NC_015917 | ATTA | 2 | 8 | 26397 | 26404 | 50 % | 50 % | 0 % | 0 % | 343127181 |
50 | NC_015917 | TAAT | 2 | 8 | 26861 | 26868 | 50 % | 50 % | 0 % | 0 % | 343127182 |