MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia bissettii DN127 plasmid lp28-3

Total Repeats: 172

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015916	ATA	2	6	106	111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015916	TAT	2	6	155	160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015916	ATA	2	6	207	212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015916	TAT	2	6	226	231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015916	ATT	2	6	232	237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015916	ATA	2	6	505	510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015916	ATA	2	6	514	519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015916	ATT	2	6	525	530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015916	AAC	2	6	710	715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_015916	ATT	2	6	738	743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015916	ATT	2	6	753	758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015916	ATT	2	6	807	812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015916	TAA	2	6	835	840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015916	ATT	2	6	857	862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015916	AAC	2	6	925	930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_015916	ATT	2	6	1065	1070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015916	AAT	2	6	1102	1107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015916	TAT	2	6	1138	1143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015916	ATA	2	6	1202	1207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015916	ATT	2	6	1239	1244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015916	TTA	2	6	1245	1250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015916	ATA	2	6	1264	1269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015916	TTA	2	6	2238	2243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015916	TAA	2	6	2369	2374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015916	ACT	2	6	2379	2384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_015916	ATT	2	6	2431	2436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015916	TAT	2	6	2466	2471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015916	ATT	2	6	2554	2559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015916	TAA	2	6	2745	2750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015916	ATG	2	6	2835	2840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015916	TTG	2	6	2890	2895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015916	ATC	2	6	2953	2958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_015916	ACT	2	6	3133	3138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_015916	ATA	3	9	3192	3200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015916	AAT	2	6	3225	3230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015916	TAA	2	6	3304	3309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015916	ATT	2	6	3310	3315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015916	AGA	2	6	3540	3545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015916	ATT	2	6	3571	3576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015916	TAT	2	6	3618	3623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015916	TTA	2	6	3671	3676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015916	TAA	2	6	3743	3748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015916	CTA	2	6	3845	3850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_015916	TCT	2	6	3882	3887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_015916	ATA	2	6	3903	3908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015916	TAA	2	6	3948	3953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015916	TAA	2	6	4324	4329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015916	TAT	3	9	4330	4338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015916	ATT	2	6	4358	4363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015916	TAT	2	6	4541	4546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015916	TAT	2	6	4564	4569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015916	TAA	2	6	4576	4581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015916	AAT	2	6	4583	4588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015916	TTA	2	6	4606	4611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015916	TAA	2	6	4652	4657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015916	TTA	2	6	4808	4813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015916	TTG	2	6	4839	4844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015916	ATA	2	6	4863	4868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015916	ATT	2	6	4889	4894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015916	CTT	2	6	4901	4906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_015916	TTA	2	6	4951	4956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015916	TTA	2	6	4999	5004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015916	AAT	2	6	5027	5032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015916	AAT	2	6	5122	5127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015916	TTA	2	6	5373	5378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015916	TTA	3	9	5404	5412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015916	ATA	2	6	5413	5418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015916	TTC	2	6	5506	5511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_015916	ATA	2	6	5516	5521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015916	TCT	2	6	5567	5572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_015916	CTT	3	9	5863	5871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_015916	ATT	2	6	5937	5942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015916	ATA	2	6	5996	6001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015916	TAC	3	9	6095	6103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_015916	CAT	2	6	6139	6144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_015916	TAT	2	6	6172	6177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015916	TAA	2	6	6178	6183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015916	ACT	2	6	6228	6233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_015916	ATT	2	6	6300	6305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015916	TTC	2	6	6334	6339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_015916	ATA	2	6	6431	6436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015916	ACT	2	6	6473	6478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_015916	CTA	2	6	6487	6492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_015916	AGT	2	6	6518	6523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015916	GAT	2	6	7575	7580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015916	AAT	2	6	7618	7623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015916	ATA	2	6	7740	7745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015916	TTA	2	6	7756	7761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015916	AAG	2	6	7775	7780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015916	ATT	2	6	7783	7788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015916	AAT	2	6	7881	7886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015916	TCT	2	6	7900	7905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_015916	TAA	2	6	8000	8005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015916	TCT	2	6	8006	8011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_015916	ATT	2	6	8067	8072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015916	TTC	2	6	8073	8078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_015916	AAC	2	6	8121	8126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_015916	TAA	2	6	12583	12588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015916	AAT	2	6	12607	12612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015916	ACA	2	6	12627	12632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_015916	ATA	2	6	12636	12641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015916	AAT	2	6	12742	12747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015916	TTA	2	6	12896	12901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015916	TAT	3	9	13140	13148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015916	TAT	2	6	13239	13244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015916	TAA	2	6	13329	13334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015916	ATT	2	6	13336	13341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015916	AAT	2	6	13342	13347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015916	AAT	2	6	15586	15591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015916	GTT	2	6	15606	15611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015916	ATA	2	6	16292	16297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015916	TAT	3	9	16309	16317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015916	CTG	2	6	16787	16792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_015916	TTA	2	6	16861	16866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015916	AGA	2	6	17011	17016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015916	TAT	2	6	17046	17051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015916	ATA	2	6	17143	17148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015916	TTA	2	6	17167	17172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015916	TAA	2	6	17359	17364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015916	TTG	2	6	17369	17374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015916	GTT	2	6	17378	17383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015916	TAA	2	6	17451	17456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015916	TTG	3	9	17656	17664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015916	AAT	2	6	17684	17689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015916	TCT	2	6	17758	17763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_015916	ACA	2	6	17866	17871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_015916	TAA	3	9	17964	17972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015916	TAA	3	9	18001	18009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015916	TTG	2	6	18022	18027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015916	TAA	2	6	18087	18092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015916	AGA	2	6	18249	18254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015916	TAA	2	6	18291	18296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015916	AGA	2	6	18309	18314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015916	AGG	2	6	18339	18344	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015916	AAG	2	6	18417	18422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015916	TTG	2	6	18474	18479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015916	TAA	2	6	18496	18501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015916	ATT	2	6	18711	18716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015916	ATT	2	6	19546	19551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015916	TAA	2	6	19579	19584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015916	TAA	2	6	19851	19856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015916	TCT	2	6	19858	19863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_015916	ATT	2	6	21173	21178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015916	ATC	2	6	21349	21354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_015916	ATT	2	6	21361	21366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015916	GTG	2	6	21386	21391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015916	GGA	2	6	21432	21437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015916	TTG	2	6	21782	21787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015916	TAA	2	6	21825	21830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015916	ATT	3	9	21895	21903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_015916	AGA	2	6	21912	21917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_015916	GAT	2	6	21960	21965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_015916	ATT	2	6	21988	21993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_015916	ATA	2	6	22041	22046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_015916	TAA	2	6	22061	22066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_015916	TTA	2	6	22175	22180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_015916	ATA	2	6	22186	22191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_015916	TTA	2	6	22201	22206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_015916	AGA	2	6	22226	22231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
160	NC_015916	TAA	2	6	22301	22306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_015916	AAT	2	6	22392	22397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_015916	GTA	3	9	22506	22514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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164	NC_015916	TTA	2	6	22835	22840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_015916	GTA	2	6	22863	22868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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169	NC_015916	TAT	3	9	23145	23153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_015916	AAG	2	6	23260	23265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
171	NC_015916	CAA	2	6	24249	24254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
172	NC_015916	TGC	2	6	24285	24290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.