MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Borrelia bissettii DN127 plasmid lp28-3

Total Repeats: 75

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015916	TA	3	6	2101	2106	50 %	50 %	0 %	0 %	343128143
2	NC_015916	AT	3	6	2441	2446	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015916	TA	7	14	2634	2647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015916	GT	3	6	2853	2858	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015916	AT	4	8	3356	3363	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015916	TA	3	6	3463	3468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015916	AT	3	6	3475	3480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015916	AT	3	6	3630	3635	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015916	TA	4	8	3713	3720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015916	TA	3	6	4156	4161	50 %	50 %	0 %	0 %	343128145
11	NC_015916	AT	3	6	4436	4441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015916	AT	3	6	4448	4453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015916	TA	3	6	4461	4466	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015916	AT	3	6	5681	5686	50 %	50 %	0 %	0 %	343128146
15	NC_015916	AG	3	6	5693	5698	50 %	0 %	50 %	0 %	343128146
16	NC_015916	TA	3	6	5887	5892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015916	AT	3	6	6262	6267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015916	AT	3	6	6438	6443	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015916	CT	3	6	6540	6545	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_015916	AT	3	6	6661	6666	50 %	50 %	0 %	0 %	343128147
21	NC_015916	AG	3	6	7233	7238	50 %	0 %	50 %	0 %	343128147
22	NC_015916	AT	3	6	7244	7249	50 %	50 %	0 %	0 %	343128147
23	NC_015916	AT	3	6	7726	7731	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015916	AT	3	6	7951	7956	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015916	AT	3	6	8057	8062	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015916	AT	3	6	8179	8184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015916	TA	3	6	8732	8737	50 %	50 %	0 %	0 %	343128148
28	NC_015916	CA	3	6	8747	8752	50 %	0 %	0 %	50 %	343128148
29	NC_015916	AT	3	6	9403	9408	50 %	50 %	0 %	0 %	343128148
30	NC_015916	AT	3	6	11172	11177	50 %	50 %	0 %	0 %	343128148
31	NC_015916	AT	4	8	11279	11286	50 %	50 %	0 %	0 %	343128148
32	NC_015916	TC	3	6	11335	11340	0 %	50 %	0 %	50 %	343128148
33	NC_015916	AT	3	6	11511	11516	50 %	50 %	0 %	0 %	343128148
34	NC_015916	TA	3	6	11614	11619	50 %	50 %	0 %	0 %	343128148
35	NC_015916	TA	3	6	13093	13098	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015916	AT	3	6	13590	13595	50 %	50 %	0 %	0 %	343128150
37	NC_015916	TA	4	8	13729	13736	50 %	50 %	0 %	0 %	343128150
38	NC_015916	TA	3	6	13884	13889	50 %	50 %	0 %	0 %	343128150
39	NC_015916	TA	4	8	13896	13903	50 %	50 %	0 %	0 %	343128150
40	NC_015916	AT	4	8	13905	13912	50 %	50 %	0 %	0 %	343128150
41	NC_015916	TA	3	6	14764	14769	50 %	50 %	0 %	0 %	343128151
42	NC_015916	AT	3	6	14977	14982	50 %	50 %	0 %	0 %	343128152
43	NC_015916	AT	3	6	15439	15444	50 %	50 %	0 %	0 %	343128152
44	NC_015916	TA	3	6	15698	15703	50 %	50 %	0 %	0 %	343128153
45	NC_015916	AT	3	6	15942	15947	50 %	50 %	0 %	0 %	343128153
46	NC_015916	AG	3	6	16197	16202	50 %	0 %	50 %	0 %	343128153
47	NC_015916	AT	3	6	16306	16311	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015916	TC	4	8	16339	16346	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_015916	TA	3	6	16450	16455	50 %	50 %	0 %	0 %	343128154
50	NC_015916	AT	3	6	16830	16835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015916	TA	3	6	16849	16854	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015916	TA	3	6	17764	17769	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015916	AT	3	6	17839	17844	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015916	AT	3	6	18126	18131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015916	TA	3	6	18176	18181	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015916	TA	3	6	18610	18615	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015916	AT	3	6	18694	18699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015916	TA	3	6	18862	18867	50 %	50 %	0 %	0 %	343128157
59	NC_015916	AT	3	6	18905	18910	50 %	50 %	0 %	0 %	343128157
60	NC_015916	TA	3	6	19517	19522	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015916	AT	3	6	20608	20613	50 %	50 %	0 %	0 %	343128160
62	NC_015916	TA	3	6	21182	21187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015916	AT	3	6	21189	21194	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015916	AT	3	6	21217	21222	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015916	TA	3	6	21305	21310	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015916	TA	4	8	21438	21445	50 %	50 %	0 %	0 %	343128162
67	NC_015916	TA	3	6	21512	21517	50 %	50 %	0 %	0 %	343128162
68	NC_015916	AT	3	6	21887	21892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015916	AT	3	6	21976	21981	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015916	AT	3	6	22083	22088	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015916	TA	3	6	22428	22433	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015916	GA	3	6	23375	23380	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015916	TA	3	6	24227	24232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015916	CT	3	6	24548	24553	0 %	50 %	0 %	50 %	343128165
75	NC_015916	CT	3	6	24591	24596	0 %	50 %	0 %	50 %	343128165

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.