MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia bissettii DN127 plasmid lp17

Total Repeats: 109

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015915	TATT	3	12	47	58	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015915	TAAC	2	8	128	135	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_015915	ATAA	2	8	448	455	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015915	AATA	2	8	569	576	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015915	AAGC	2	8	915	922	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_015915	ATTT	2	8	1001	1008	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015915	TAGC	2	8	1682	1689	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_015915	ATTA	2	8	2579	2586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015915	CAAA	2	8	2661	2668	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_015915	AATT	2	8	2855	2862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015915	AATT	2	8	2913	2920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015915	TATC	2	8	3136	3143	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_015915	ACTT	2	8	3782	3789	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_015915	AAAC	2	8	3936	3943	75 %	0 %	0 %	25 %	343127122
15	NC_015915	TAAA	2	8	4121	4128	75 %	25 %	0 %	0 %	343127122
16	NC_015915	AGTT	2	8	4142	4149	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015915	AAAT	2	8	4246	4253	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015915	TTAA	2	8	4391	4398	50 %	50 %	0 %	0 %	343127123
19	NC_015915	AAAT	2	8	4482	4489	75 %	25 %	0 %	0 %	343127123
20	NC_015915	TAGC	2	8	4678	4685	25 %	25 %	25 %	25 %	343127124
21	NC_015915	CAAA	2	8	5065	5072	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_015915	CAAA	2	8	5134	5141	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_015915	TATT	2	8	5312	5319	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015915	TATT	2	8	5462	5469	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015915	CAAA	2	8	5592	5599	75 %	0 %	0 %	25 %	343127125
26	NC_015915	AATA	2	8	6693	6700	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015915	AAAG	2	8	7244	7251	75 %	0 %	25 %	0 %	343127126
28	NC_015915	AAAT	2	8	7624	7631	75 %	25 %	0 %	0 %	343127126
29	NC_015915	TAAA	2	8	7728	7735	75 %	25 %	0 %	0 %	343127126
30	NC_015915	TAAA	2	8	8136	8143	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015915	AAAT	2	8	8148	8155	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015915	TTAT	2	8	8258	8265	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015915	CTTT	2	8	8730	8737	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_015915	CAAA	2	8	8931	8938	75 %	0 %	0 %	25 %	343127127
35	NC_015915	AAGT	2	8	9487	9494	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015915	ATAC	2	8	9531	9538	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_015915	TAAA	2	8	9770	9777	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015915	TAAT	2	8	10188	10195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015915	TGTA	2	8	10296	10303	25 %	50 %	25 %	0 %	343127130
40	NC_015915	ATAA	2	8	10364	10371	75 %	25 %	0 %	0 %	343127130
41	NC_015915	AAAC	2	8	10754	10761	75 %	0 %	0 %	25 %	343127131
42	NC_015915	TTTA	2	8	11368	11375	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015915	TAAA	2	8	11416	11423	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015915	AATA	2	8	11471	11478	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015915	AATT	2	8	11479	11486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015915	TAAG	2	8	11679	11686	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015915	CAAT	2	8	12128	12135	50 %	25 %	0 %	25 %	343127133
48	NC_015915	TTTG	2	8	12302	12309	0 %	75 %	25 %	0 %	343127133
49	NC_015915	TCAA	2	8	12436	12443	50 %	25 %	0 %	25 %	343127133
50	NC_015915	CTTT	2	8	13075	13082	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_015915	ATTA	2	8	13497	13504	50 %	50 %	0 %	0 %	343127134
52	NC_015915	TCTA	2	8	13510	13517	25 %	50 %	0 %	25 %	343127134
53	NC_015915	AATC	2	8	13574	13581	50 %	25 %	0 %	25 %	343127134
54	NC_015915	AATG	2	8	13644	13651	50 %	25 %	25 %	0 %	343127134
55	NC_015915	CAAT	2	8	13759	13766	50 %	25 %	0 %	25 %	343127134
56	NC_015915	AAAT	2	8	14785	14792	75 %	25 %	0 %	0 %	343127135
57	NC_015915	TATT	2	8	14829	14836	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015915	TACT	2	8	15060	15067	25 %	50 %	0 %	25 %	343127136
59	NC_015915	AGCA	2	8	16378	16385	50 %	0 %	25 %	25 %	343127137
60	NC_015915	ATCA	2	8	16912	16919	50 %	25 %	0 %	25 %	343127138
61	NC_015915	ATAA	2	8	17234	17241	75 %	25 %	0 %	0 %	343127138
62	NC_015915	TAAA	2	8	17277	17284	75 %	25 %	0 %	0 %	343127138
63	NC_015915	ATTA	2	8	17718	17725	50 %	50 %	0 %	0 %	343127138
64	NC_015915	ATTT	2	8	17763	17770	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015915	AATT	2	8	17813	17820	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015915	TAAA	2	8	18504	18511	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015915	AATT	2	8	18519	18526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015915	AAAT	2	8	18545	18552	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015915	AAGA	2	8	18605	18612	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015915	AAAT	2	8	18652	18659	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015915	AAAT	2	8	18829	18836	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015915	ATTT	2	8	18842	18849	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015915	ATTT	2	8	19737	19744	25 %	75 %	0 %	0 %	343127140
74	NC_015915	TAAA	2	8	19936	19943	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015915	CAAG	2	8	20547	20554	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_015915	TAAT	2	8	20899	20906	50 %	50 %	0 %	0 %	343127142
77	NC_015915	TAAT	2	8	20920	20927	50 %	50 %	0 %	0 %	343127142
78	NC_015915	TAAT	2	8	20941	20948	50 %	50 %	0 %	0 %	343127142
79	NC_015915	TAAT	2	8	20962	20969	50 %	50 %	0 %	0 %	343127142
80	NC_015915	TAAT	2	8	20983	20990	50 %	50 %	0 %	0 %	343127142
81	NC_015915	TAAT	2	8	21004	21011	50 %	50 %	0 %	0 %	343127142
82	NC_015915	TAAT	2	8	21025	21032	50 %	50 %	0 %	0 %	343127142
83	NC_015915	TAAT	2	8	21046	21053	50 %	50 %	0 %	0 %	343127142
84	NC_015915	TAAT	2	8	21067	21074	50 %	50 %	0 %	0 %	343127142
85	NC_015915	TAAT	2	8	21088	21095	50 %	50 %	0 %	0 %	343127142
86	NC_015915	TAAT	2	8	21109	21116	50 %	50 %	0 %	0 %	343127142
87	NC_015915	TAAT	2	8	21130	21137	50 %	50 %	0 %	0 %	343127142
88	NC_015915	TAAT	2	8	21151	21158	50 %	50 %	0 %	0 %	343127142
89	NC_015915	TAAT	2	8	21172	21179	50 %	50 %	0 %	0 %	343127142
90	NC_015915	TAAT	2	8	21193	21200	50 %	50 %	0 %	0 %	343127142
91	NC_015915	TTAT	2	8	21304	21311	25 %	75 %	0 %	0 %	343127143
92	NC_015915	ATCT	2	8	21600	21607	25 %	50 %	0 %	25 %	343127143
93	NC_015915	CAAG	2	8	22101	22108	50 %	0 %	25 %	25 %	343127144
94	NC_015915	AATA	2	8	22441	22448	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015915	CTTT	2	8	22480	22487	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_015915	TATT	2	8	22633	22640	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015915	AAAG	2	8	22883	22890	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015915	TAAA	2	8	23300	23307	75 %	25 %	0 %	0 %	343127145
99	NC_015915	ATTG	2	8	23398	23405	25 %	50 %	25 %	0 %	343127145
100	NC_015915	AATT	2	8	23471	23478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015915	AATA	2	8	23547	23554	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015915	TATT	2	8	23815	23822	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015915	ATGT	2	8	23825	23832	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015915	TAAA	2	8	24017	24024	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015915	TATG	2	8	25227	25234	25 %	50 %	25 %	0 %	343127148
106	NC_015915	TTGA	2	8	26480	26487	25 %	50 %	25 %	0 %	343127151
107	NC_015915	TAAT	2	8	26688	26695	50 %	50 %	0 %	0 %	343127151
108	NC_015915	ATAG	2	8	26709	26716	50 %	25 %	25 %	0 %	343127151
109	NC_015915	ATTT	2	8	26969	26976	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.