MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia bissettii DN127 plasmid lp17

Total Repeats: 56

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015915	TATT	3	12	47	58	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015915	TAAC	2	8	128	135	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_015915	ATAA	2	8	448	455	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015915	AATA	2	8	569	576	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015915	AAGC	2	8	915	922	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_015915	ATTT	2	8	1001	1008	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015915	TAGC	2	8	1682	1689	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_015915	ATTA	2	8	2579	2586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015915	CAAA	2	8	2661	2668	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_015915	AATT	2	8	2855	2862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015915	AATT	2	8	2913	2920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015915	TATC	2	8	3136	3143	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_015915	ACTT	2	8	3782	3789	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_015915	AGTT	2	8	4142	4149	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015915	AAAT	2	8	4246	4253	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015915	CAAA	2	8	5065	5072	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_015915	CAAA	2	8	5134	5141	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_015915	TATT	2	8	5312	5319	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015915	TATT	2	8	5462	5469	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015915	AATA	2	8	6693	6700	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015915	TAAA	2	8	8136	8143	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015915	AAAT	2	8	8148	8155	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015915	TTAT	2	8	8258	8265	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015915	CTTT	2	8	8730	8737	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_015915	AAGT	2	8	9487	9494	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015915	ATAC	2	8	9531	9538	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_015915	TAAA	2	8	9770	9777	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015915	TAAT	2	8	10188	10195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015915	TTTA	2	8	11368	11375	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015915	TAAA	2	8	11416	11423	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015915	AATA	2	8	11471	11478	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015915	AATT	2	8	11479	11486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015915	TAAG	2	8	11679	11686	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015915	CTTT	2	8	13075	13082	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_015915	TATT	2	8	14829	14836	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015915	ATTT	2	8	17763	17770	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015915	AATT	2	8	17813	17820	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015915	TAAA	2	8	18504	18511	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015915	AATT	2	8	18519	18526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015915	AAAT	2	8	18545	18552	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015915	AAGA	2	8	18605	18612	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015915	AAAT	2	8	18652	18659	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015915	AAAT	2	8	18829	18836	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015915	ATTT	2	8	18842	18849	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015915	TAAA	2	8	19936	19943	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015915	CAAG	2	8	20547	20554	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_015915	AATA	2	8	22441	22448	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015915	CTTT	2	8	22480	22487	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_015915	TATT	2	8	22633	22640	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015915	AAAG	2	8	22883	22890	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015915	AATT	2	8	23471	23478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015915	AATA	2	8	23547	23554	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015915	TATT	2	8	23815	23822	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015915	ATGT	2	8	23825	23832	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015915	TAAA	2	8	24017	24024	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015915	ATTT	2	8	26969	26976	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.