MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Borrelia bissettii DN127 plasmid lp17

Total Repeats: 53

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015915	AAAC	2	8	3936	3943	75 %	0 %	0 %	25 %	343127122
2	NC_015915	TAAA	2	8	4121	4128	75 %	25 %	0 %	0 %	343127122
3	NC_015915	TTAA	2	8	4391	4398	50 %	50 %	0 %	0 %	343127123
4	NC_015915	AAAT	2	8	4482	4489	75 %	25 %	0 %	0 %	343127123
5	NC_015915	TAGC	2	8	4678	4685	25 %	25 %	25 %	25 %	343127124
6	NC_015915	CAAA	2	8	5592	5599	75 %	0 %	0 %	25 %	343127125
7	NC_015915	AAAG	2	8	7244	7251	75 %	0 %	25 %	0 %	343127126
8	NC_015915	AAAT	2	8	7624	7631	75 %	25 %	0 %	0 %	343127126
9	NC_015915	TAAA	2	8	7728	7735	75 %	25 %	0 %	0 %	343127126
10	NC_015915	CAAA	2	8	8931	8938	75 %	0 %	0 %	25 %	343127127
11	NC_015915	TGTA	2	8	10296	10303	25 %	50 %	25 %	0 %	343127130
12	NC_015915	ATAA	2	8	10364	10371	75 %	25 %	0 %	0 %	343127130
13	NC_015915	AAAC	2	8	10754	10761	75 %	0 %	0 %	25 %	343127131
14	NC_015915	CAAT	2	8	12128	12135	50 %	25 %	0 %	25 %	343127133
15	NC_015915	TTTG	2	8	12302	12309	0 %	75 %	25 %	0 %	343127133
16	NC_015915	TCAA	2	8	12436	12443	50 %	25 %	0 %	25 %	343127133
17	NC_015915	ATTA	2	8	13497	13504	50 %	50 %	0 %	0 %	343127134
18	NC_015915	TCTA	2	8	13510	13517	25 %	50 %	0 %	25 %	343127134
19	NC_015915	AATC	2	8	13574	13581	50 %	25 %	0 %	25 %	343127134
20	NC_015915	AATG	2	8	13644	13651	50 %	25 %	25 %	0 %	343127134
21	NC_015915	CAAT	2	8	13759	13766	50 %	25 %	0 %	25 %	343127134
22	NC_015915	AAAT	2	8	14785	14792	75 %	25 %	0 %	0 %	343127135
23	NC_015915	TACT	2	8	15060	15067	25 %	50 %	0 %	25 %	343127136
24	NC_015915	AGCA	2	8	16378	16385	50 %	0 %	25 %	25 %	343127137
25	NC_015915	ATCA	2	8	16912	16919	50 %	25 %	0 %	25 %	343127138
26	NC_015915	ATAA	2	8	17234	17241	75 %	25 %	0 %	0 %	343127138
27	NC_015915	TAAA	2	8	17277	17284	75 %	25 %	0 %	0 %	343127138
28	NC_015915	ATTA	2	8	17718	17725	50 %	50 %	0 %	0 %	343127138
29	NC_015915	ATTT	2	8	19737	19744	25 %	75 %	0 %	0 %	343127140
30	NC_015915	TAAT	2	8	20899	20906	50 %	50 %	0 %	0 %	343127142
31	NC_015915	TAAT	2	8	20920	20927	50 %	50 %	0 %	0 %	343127142
32	NC_015915	TAAT	2	8	20941	20948	50 %	50 %	0 %	0 %	343127142
33	NC_015915	TAAT	2	8	20962	20969	50 %	50 %	0 %	0 %	343127142
34	NC_015915	TAAT	2	8	20983	20990	50 %	50 %	0 %	0 %	343127142
35	NC_015915	TAAT	2	8	21004	21011	50 %	50 %	0 %	0 %	343127142
36	NC_015915	TAAT	2	8	21025	21032	50 %	50 %	0 %	0 %	343127142
37	NC_015915	TAAT	2	8	21046	21053	50 %	50 %	0 %	0 %	343127142
38	NC_015915	TAAT	2	8	21067	21074	50 %	50 %	0 %	0 %	343127142
39	NC_015915	TAAT	2	8	21088	21095	50 %	50 %	0 %	0 %	343127142
40	NC_015915	TAAT	2	8	21109	21116	50 %	50 %	0 %	0 %	343127142
41	NC_015915	TAAT	2	8	21130	21137	50 %	50 %	0 %	0 %	343127142
42	NC_015915	TAAT	2	8	21151	21158	50 %	50 %	0 %	0 %	343127142
43	NC_015915	TAAT	2	8	21172	21179	50 %	50 %	0 %	0 %	343127142
44	NC_015915	TAAT	2	8	21193	21200	50 %	50 %	0 %	0 %	343127142
45	NC_015915	TTAT	2	8	21304	21311	25 %	75 %	0 %	0 %	343127143
46	NC_015915	ATCT	2	8	21600	21607	25 %	50 %	0 %	25 %	343127143
47	NC_015915	CAAG	2	8	22101	22108	50 %	0 %	25 %	25 %	343127144
48	NC_015915	TAAA	2	8	23300	23307	75 %	25 %	0 %	0 %	343127145
49	NC_015915	ATTG	2	8	23398	23405	25 %	50 %	25 %	0 %	343127145
50	NC_015915	TATG	2	8	25227	25234	25 %	50 %	25 %	0 %	343127148
51	NC_015915	TTGA	2	8	26480	26487	25 %	50 %	25 %	0 %	343127151
52	NC_015915	TAAT	2	8	26688	26695	50 %	50 %	0 %	0 %	343127151
53	NC_015915	ATAG	2	8	26709	26716	50 %	25 %	25 %	0 %	343127151

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.