MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Borrelia bissettii DN127 plasmid lp17

Total Repeats: 372

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015915	ACA	2	6	142	147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_015915	TAA	2	6	224	229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015915	AGG	2	6	232	237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015915	ACA	2	6	282	287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127119
5	NC_015915	ATA	2	6	352	357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127119
6	NC_015915	ATT	2	6	364	369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127119
7	NC_015915	ACA	3	9	370	378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127119
8	NC_015915	AAT	2	6	542	547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015915	ATT	2	6	667	672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015915	TAA	2	6	713	718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015915	TTA	2	6	750	755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015915	ATT	2	6	763	768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015915	ACA	2	6	809	814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_015915	TTA	2	6	825	830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015915	AAT	2	6	893	898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015915	TCA	2	6	1219	1224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127120
17	NC_015915	ATC	2	6	1242	1247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127120
18	NC_015915	ATT	2	6	1275	1280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127120
19	NC_015915	CAT	2	6	1316	1321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127120
20	NC_015915	CAT	2	6	1496	1501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127120
21	NC_015915	ATT	2	6	1675	1680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015915	TAT	2	6	1701	1706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015915	AAT	2	6	1782	1787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015915	TTC	2	6	1910	1915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_015915	TTA	2	6	2031	2036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015915	TTA	2	6	2067	2072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015915	TAT	2	6	2094	2099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015915	ATA	2	6	2115	2120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015915	TAA	2	6	2234	2239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015915	ATA	2	6	2318	2323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015915	TTA	2	6	2702	2707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015915	TTC	2	6	2943	2948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_015915	TAT	2	6	2973	2978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015915	ATT	2	6	2997	3002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015915	TTA	2	6	3016	3021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015915	ACA	2	6	3178	3183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_015915	AAT	2	6	3193	3198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015915	CTT	2	6	3714	3719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_015915	TTA	2	6	4090	4095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127122
40	NC_015915	CAA	2	6	4102	4107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127122
41	NC_015915	CTC	2	6	4223	4228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_015915	TTA	2	6	4286	4291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015915	TAT	2	6	4532	4537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127123
44	NC_015915	TAA	2	6	4567	4572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015915	AAG	2	6	4636	4641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015915	GAA	2	6	4692	4697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127124
47	NC_015915	ATT	2	6	4701	4706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127124
48	NC_015915	AGA	2	6	4769	4774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127124
49	NC_015915	TCT	2	6	4791	4796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127124
50	NC_015915	ATG	2	6	4819	4824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127124
51	NC_015915	TAA	2	6	4858	4863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127124
52	NC_015915	GTG	2	6	4891	4896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	343127124
53	NC_015915	GGA	2	6	4920	4925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	343127124
54	NC_015915	TAA	2	6	4966	4971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015915	TCT	2	6	4973	4978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_015915	TAT	2	6	4984	4989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015915	TAA	2	6	5003	5008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015915	ACC	2	6	5116	5121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_015915	TTA	2	6	5154	5159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015915	CAT	2	6	5202	5207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_015915	TAA	2	6	5230	5235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015915	ATT	2	6	5388	5393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015915	ATT	2	6	5409	5414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015915	ATT	3	9	5419	5427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015915	ATT	3	9	5438	5446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015915	ATT	2	6	5531	5536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127125
67	NC_015915	CAC	2	6	5611	5616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	343127125
68	NC_015915	CAA	2	6	5712	5717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127125
69	NC_015915	CAA	2	6	5727	5732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127125
70	NC_015915	ATA	2	6	5856	5861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127125
71	NC_015915	GAT	2	6	5921	5926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127125
72	NC_015915	AGA	2	6	6103	6108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127125
73	NC_015915	GAA	2	6	6164	6169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127125
74	NC_015915	TAC	2	6	6171	6176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127125
75	NC_015915	CTA	2	6	6329	6334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127125
76	NC_015915	TAA	2	6	6363	6368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015915	TTC	2	6	6403	6408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_015915	ATA	3	9	6479	6487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015915	AAT	2	6	6533	6538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015915	GAA	2	6	6551	6556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015915	GTT	2	6	6702	6707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015915	ACA	2	6	6764	6769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_015915	AAT	2	6	6801	6806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015915	TAA	2	6	6812	6817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015915	AGT	3	9	6848	6856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015915	CTA	2	6	6896	6901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_015915	TAT	2	6	6907	6912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015915	ATT	2	6	6975	6980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015915	TAA	2	6	7009	7014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015915	AAG	2	6	7041	7046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015915	TGT	2	6	7185	7190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343127126
92	NC_015915	TAT	2	6	7197	7202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127126
93	NC_015915	AGA	2	6	7327	7332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127126
94	NC_015915	AGA	3	9	7438	7446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127126
95	NC_015915	TGA	2	6	7462	7467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127126
96	NC_015915	TGA	2	6	7540	7545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127126
97	NC_015915	TAT	2	6	7601	7606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127126
98	NC_015915	AAT	2	6	7652	7657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127126
99	NC_015915	ATA	3	9	7674	7682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127126
100	NC_015915	AAT	2	6	7721	7726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127126
101	NC_015915	TGA	2	6	7750	7755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127126
102	NC_015915	AAG	2	6	7836	7841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127126
103	NC_015915	CTT	2	6	7956	7961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127126
104	NC_015915	GAA	2	6	7986	7991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127126
105	NC_015915	AAG	2	6	8016	8021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127126
106	NC_015915	ATT	3	9	8112	8120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015915	TTC	2	6	8124	8129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_015915	AAT	2	6	8284	8289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015915	TAA	2	6	8305	8310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015915	TAG	2	6	8322	8327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015915	TCC	2	6	8542	8547	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_015915	TCC	2	6	8552	8557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_015915	TTG	2	6	8666	8671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015915	TAA	2	6	8759	8764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015915	TAT	2	6	8770	8775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127127
116	NC_015915	TCC	2	6	8785	8790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	343127127
117	NC_015915	AAC	2	6	8850	8855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127127
118	NC_015915	CTT	2	6	8868	8873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127127
119	NC_015915	TAG	2	6	8900	8905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127127
120	NC_015915	AAT	2	6	9015	9020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015915	TGA	2	6	9170	9175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015915	GAA	2	6	9183	9188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015915	ATG	2	6	9217	9222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015915	GAA	2	6	9228	9233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015915	TGA	2	6	9239	9244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015915	AGA	2	6	9281	9286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015915	ATT	2	6	9347	9352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015915	CTA	2	6	9400	9405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_015915	AGA	2	6	9419	9424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015915	AAG	2	6	9666	9671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127128
131	NC_015915	ATT	2	6	9718	9723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015915	ATA	2	6	9746	9751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015915	TAT	2	6	10080	10085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015915	ATT	2	6	10157	10162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015915	AAT	2	6	10199	10204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015915	CTT	2	6	10240	10245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_015915	CTT	2	6	10379	10384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127130
138	NC_015915	ACA	2	6	10422	10427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127130
139	NC_015915	AAT	2	6	10461	10466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127130
140	NC_015915	CAT	2	6	10500	10505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_015915	ATT	2	6	10511	10516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015915	TTA	3	9	10541	10549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015915	CCA	2	6	10555	10560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
144	NC_015915	TTA	2	6	10630	10635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015915	TCA	2	6	10687	10692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127131
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147	NC_015915	ACC	2	6	10823	10828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
148	NC_015915	TAA	2	6	10845	10850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015915	ATG	2	6	10858	10863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015915	ATA	2	6	10874	10879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_015915	GCT	2	6	10896	10901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_015915	TAA	2	6	11007	11012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_015915	GAT	2	6	11110	11115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127132
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159	NC_015915	TTA	2	6	11204	11209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127132
160	NC_015915	ATA	2	6	11282	11287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127132
161	NC_015915	ATA	2	6	11456	11461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_015915	ATT	2	6	11566	11571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_015915	ATT	2	6	11709	11714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127133
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176	NC_015915	AAG	2	6	12460	12465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127133
177	NC_015915	TAA	2	6	12553	12558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
178	NC_015915	ATA	2	6	12871	12876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
179	NC_015915	ATT	2	6	12917	12922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_015915	ATT	2	6	12995	13000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_015915	ATT	2	6	13085	13090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_015915	GAG	2	6	13115	13120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
184	NC_015915	TAA	3	9	13128	13136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_015915	TTA	2	6	13168	13173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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258	NC_015915	AAG	2	6	18442	18447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
259	NC_015915	TAT	2	6	18456	18461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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261	NC_015915	ATT	2	6	18488	18493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
262	NC_015915	TTA	2	6	18639	18644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
263	NC_015915	ATT	2	6	18645	18650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
264	NC_015915	TGT	2	6	18739	18744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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266	NC_015915	TAT	2	6	18892	18897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
267	NC_015915	ATT	2	6	19136	19141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
268	NC_015915	TAA	4	12	19142	19153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
269	NC_015915	TCC	2	6	19197	19202	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	343127140
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277	NC_015915	ATT	2	6	19864	19869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
278	NC_015915	TAT	2	6	19880	19885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
279	NC_015915	TGT	2	6	19976	19981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
280	NC_015915	TAA	2	6	20071	20076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
281	NC_015915	ATT	2	6	20080	20085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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321	NC_015915	TAA	2	6	22871	22876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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333	NC_015915	ATT	2	6	23509	23514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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335	NC_015915	TAA	2	6	23570	23575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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372	NC_015915	TGC	2	6	27093	27098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.