MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Borrelia bissettii DN127 plasmid lp17

Total Repeats: 83

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015915	AT	3	6	397	402	50 %	50 %	0 %	0 %	343127119
2	NC_015915	AT	4	8	494	501	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015915	AT	3	6	738	743	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015915	TA	3	6	744	749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015915	AT	3	6	1049	1054	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015915	AT	3	6	1609	1614	50 %	50 %	0 %	0 %	343127120
7	NC_015915	TA	3	6	1769	1774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015915	AT	5	10	1839	1848	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015915	TA	3	6	1876	1881	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015915	AT	3	6	3512	3517	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015915	AT	3	6	3767	3772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015915	AT	3	6	3864	3869	50 %	50 %	0 %	0 %	343127122
13	NC_015915	AT	3	6	4201	4206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015915	TA	3	6	4594	4599	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015915	TA	3	6	4625	4630	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015915	AT	3	6	4733	4738	50 %	50 %	0 %	0 %	343127124
17	NC_015915	AT	3	6	6132	6137	50 %	50 %	0 %	0 %	343127125
18	NC_015915	AT	3	6	6492	6497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015915	TA	3	6	6934	6939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015915	AT	3	6	6943	6948	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015915	AG	3	6	7334	7339	50 %	0 %	50 %	0 %	343127126
22	NC_015915	AT	5	10	8175	8184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015915	AT	3	6	8340	8345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015915	CT	3	6	8920	8925	0 %	50 %	0 %	50 %	343127127
25	NC_015915	AC	3	6	9381	9386	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_015915	GC	3	6	9632	9637	0 %	0 %	50 %	50 %	343127128
27	NC_015915	AT	3	6	9840	9845	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015915	TA	3	6	9945	9950	50 %	50 %	0 %	0 %	343127129
29	NC_015915	AC	3	6	10061	10066	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_015915	TC	3	6	10734	10739	0 %	50 %	0 %	50 %	343127131
31	NC_015915	AT	3	6	10973	10978	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015915	GA	3	6	12072	12077	50 %	0 %	50 %	0 %	343127133
33	NC_015915	TA	3	6	12742	12747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015915	TA	3	6	13031	13036	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015915	AT	3	6	13431	13436	50 %	50 %	0 %	0 %	343127134
36	NC_015915	AT	3	6	13715	13720	50 %	50 %	0 %	0 %	343127134
37	NC_015915	AC	3	6	14063	14068	50 %	0 %	0 %	50 %	343127134
38	NC_015915	CT	3	6	16049	16054	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_015915	AT	3	6	16103	16108	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015915	AT	3	6	16183	16188	50 %	50 %	0 %	0 %	343127137
41	NC_015915	AT	3	6	16935	16940	50 %	50 %	0 %	0 %	343127138
42	NC_015915	TA	3	6	17015	17020	50 %	50 %	0 %	0 %	343127138
43	NC_015915	AT	3	6	17799	17804	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015915	CA	3	6	17831	17836	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_015915	AT	3	6	18063	18068	50 %	50 %	0 %	0 %	343127139
46	NC_015915	TA	3	6	18582	18587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015915	AT	3	6	19102	19107	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015915	AT	4	8	19895	19902	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015915	AT	4	8	19926	19933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015915	AG	3	6	20029	20034	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015915	TA	3	6	20431	20436	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015915	TA	3	6	20521	20526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015915	TA	3	6	20534	20539	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015915	AT	3	6	20905	20910	50 %	50 %	0 %	0 %	343127142
55	NC_015915	AT	3	6	20926	20931	50 %	50 %	0 %	0 %	343127142
56	NC_015915	AT	3	6	20947	20952	50 %	50 %	0 %	0 %	343127142
57	NC_015915	AT	3	6	20968	20973	50 %	50 %	0 %	0 %	343127142
58	NC_015915	AT	3	6	20989	20994	50 %	50 %	0 %	0 %	343127142
59	NC_015915	AT	3	6	21010	21015	50 %	50 %	0 %	0 %	343127142
60	NC_015915	AT	3	6	21031	21036	50 %	50 %	0 %	0 %	343127142
61	NC_015915	AT	3	6	21052	21057	50 %	50 %	0 %	0 %	343127142
62	NC_015915	AT	3	6	21073	21078	50 %	50 %	0 %	0 %	343127142
63	NC_015915	AT	3	6	21094	21099	50 %	50 %	0 %	0 %	343127142
64	NC_015915	AT	3	6	21115	21120	50 %	50 %	0 %	0 %	343127142
65	NC_015915	AT	3	6	21136	21141	50 %	50 %	0 %	0 %	343127142
66	NC_015915	AT	3	6	21157	21162	50 %	50 %	0 %	0 %	343127142
67	NC_015915	AT	3	6	21178	21183	50 %	50 %	0 %	0 %	343127142
68	NC_015915	AT	3	6	21199	21204	50 %	50 %	0 %	0 %	343127142
69	NC_015915	TG	3	6	21648	21653	0 %	50 %	50 %	0 %	343127143
70	NC_015915	AT	3	6	22209	22214	50 %	50 %	0 %	0 %	343127144
71	NC_015915	AT	3	6	22344	22349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015915	TA	3	6	22435	22440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015915	AT	3	6	22672	22677	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015915	AT	3	6	22699	22704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015915	TA	3	6	23553	23558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015915	AT	3	6	23688	23693	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015915	TA	3	6	24102	24107	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015915	AT	3	6	24635	24640	50 %	50 %	0 %	0 %	343127147
79	NC_015915	GT	3	6	25220	25225	0 %	50 %	50 %	0 %	343127148
80	NC_015915	AT	3	6	25597	25602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015915	AT	3	6	25775	25780	50 %	50 %	0 %	0 %	343127150
82	NC_015915	AT	3	6	25829	25834	50 %	50 %	0 %	0 %	343127150
83	NC_015915	AT	3	6	26671	26676	50 %	50 %	0 %	0 %	343127151

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.