MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Cyclobacterium marinum DSM 745 chromosome

Total Repeats: 341

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015914	ATTTAT	2	12	23803	23814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015914	AGGTGT	2	12	114500	114511	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015914	TGTTAT	2	12	114612	114623	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015914	AAGAAT	2	12	142901	142912	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015914	ATTCCT	2	12	153321	153332	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_015914	CATTTT	2	12	161114	161125	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_015914	AAAATT	2	12	216465	216476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015914	TCCTTT	2	12	241337	241348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_015914	TTTTTA	2	12	248071	248082	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015914	CTTTTA	2	12	248454	248465	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_015914	ATCAAG	2	12	249019	249030	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_015914	ATTGCA	2	12	281168	281179	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_015914	ATTGCA	2	12	281190	281201	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_015914	TTTGGG	2	12	292257	292268	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015914	ATCCTT	2	12	312333	312344	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_015914	AACTTT	2	12	325439	325450	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_015914	AGATTT	2	12	331422	331433	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015914	TTCTAC	2	12	342639	342650	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_015914	AAGAGA	2	12	351782	351793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015914	TAACAA	2	12	355368	355379	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_015914	TTTATC	2	12	385079	385090	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_015914	CATAAT	2	12	385429	385440	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_015914	TAATTT	2	12	385929	385940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015914	CTTTTT	2	12	407960	407971	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_015914	TTTAAT	2	12	473904	473915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015914	ATAAAA	2	12	477958	477969	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015914	TTTTTA	2	12	477980	477991	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015914	AAATGA	2	12	489516	489527	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015914	TTTAAA	2	12	504005	504016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015914	TCAAAA	2	12	511121	511132	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_015914	CCAAAA	2	12	528060	528071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_015914	TTGCAA	2	12	531901	531912	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_015914	TACCTC	2	12	543034	543045	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_015914	GTTACT	2	12	580986	580997	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_015914	TGAATT	2	12	592812	592823	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015914	CTACCT	2	12	661753	661764	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_015914	AAAAGC	2	12	663568	663579	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_015914	TTTTTA	2	12	677371	677382	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015914	GAGACA	2	12	677873	677884	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_015914	ATTTTA	2	12	678566	678577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015914	CTTTTT	2	12	693034	693045	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_015914	ATTTAG	2	12	710020	710031	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015914	TAAATT	2	12	740517	740528	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015914	TAAAAT	2	12	753324	753335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015914	CCTTTG	2	12	759056	759067	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_015914	GCTATT	2	12	768841	768852	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_015914	TTGCAA	2	12	799379	799390	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_015914	TATTTC	2	12	808047	808058	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_015914	TTTCAA	2	12	839920	839931	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_015914	AAATAT	2	12	862720	862731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015914	AAATAT	2	12	918512	918523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015914	TCAAAA	2	12	956311	956322	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_015914	AAACAC	2	12	965717	965728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_015914	TAAAGT	2	12	976346	976357	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015914	CATTTT	2	12	977716	977727	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_015914	ATTAAA	2	12	985818	985829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015914	ATAGAA	2	12	997768	997779	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015914	TGGTAT	2	12	1025571	1025582	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015914	TCCATT	2	12	1025583	1025594	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_015914	TTTCAA	2	12	1031650	1031661	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_015914	AATTGT	2	12	1035402	1035413	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015914	AACCTT	2	12	1044599	1044610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_015914	AATATA	2	12	1085324	1085335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015914	TTAAAA	2	12	1085381	1085392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015914	AAATTG	2	12	1091469	1091480	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015914	TAAATA	2	12	1110520	1110531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015914	ATGCAA	2	12	1147948	1147959	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_015914	ATTAGA	2	12	1198313	1198324	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015914	TAGGAA	2	12	1200408	1200419	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015914	GATTTT	2	12	1202422	1202433	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015914	TGTCCT	2	12	1207615	1207626	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_015914	TTTAAC	2	12	1233401	1233412	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_015914	TATTTT	2	12	1242782	1242793	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015914	AATCAA	2	12	1263695	1263706	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_015914	TTAAAA	2	12	1277120	1277131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015914	ATTTCG	2	12	1296139	1296150	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_015914	TAAAAA	2	12	1346732	1346743	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015914	CTATGA	2	12	1368005	1368016	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_015914	ATTGAA	2	12	1385656	1385667	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015914	TTTTCA	2	12	1396735	1396746	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_015914	TAAAAC	2	12	1440056	1440067	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_015914	TTTATT	2	12	1485052	1485063	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015914	ATCCCT	2	12	1487671	1487682	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_015914	CATCCA	2	12	1489312	1489323	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_015914	CTTTTT	2	12	1514965	1514976	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_015914	AAAAAC	2	12	1536369	1536380	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_015914	TAAAGT	2	12	1565777	1565788	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015914	GTTTTT	2	12	1633919	1633930	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015914	AAATTA	2	12	1639670	1639681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015914	AAATTA	2	12	1641312	1641323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015914	CGACAG	2	12	1648545	1648556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_015914	ATTCTT	2	12	1687450	1687461	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_015914	TTCCTA	2	12	1692052	1692063	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_015914	TTCCTA	2	12	1694189	1694200	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_015914	AAATTA	2	12	1696186	1696197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015914	CCCTAA	2	12	1696601	1696612	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_015914	AAACAA	2	12	1717585	1717596	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_015914	TAAAAT	2	12	1730942	1730953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015914	GAAACA	2	12	1763012	1763023	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_015914	GGAATT	2	12	1771729	1771740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015914	ATTTTT	2	12	1774911	1774922	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015914	AATTTT	2	12	1811667	1811678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015914	AGCTGC	2	12	1839253	1839264	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_015914	CTGTCG	2	12	1857683	1857694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_015914	CAGGCT	2	12	1859917	1859928	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_015914	AGCCAA	2	12	1888280	1888291	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_015914	TTTTAG	2	12	1906342	1906353	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015914	GAAACA	2	12	1919426	1919437	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_015914	AATAAA	2	12	1944151	1944162	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015914	TATTAA	2	12	1999260	1999271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015914	TAACCT	2	12	2034918	2034929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_015914	TAGTTT	2	12	2040429	2040440	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015914	AATAAA	2	12	2053138	2053149	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015914	AAAATT	2	12	2075007	2075018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015914	AAATTT	2	12	2090793	2090804	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015914	GGTGAA	2	12	2106126	2106137	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015914	ACAATA	2	12	2106751	2106762	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_015914	TTCTTT	2	12	2129837	2129848	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_015914	TATTTT	2	12	2134021	2134032	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015914	TAATTT	2	12	2197440	2197451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015914	GGTTTA	2	12	2210597	2210608	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015914	TATTTT	2	12	2232153	2232164	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015914	TTAAAA	2	12	2238667	2238678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015914	TTTGAT	2	12	2244764	2244775	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015914	TTCTAT	2	12	2245826	2245837	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_015914	TAGGAA	2	12	2249571	2249582	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015914	ACCAAA	2	12	2287563	2287574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_015914	AATATA	2	12	2287663	2287674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015914	CAATAA	2	12	2288793	2288804	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_015914	CCAAAT	2	12	2292125	2292136	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_015914	AAAATA	2	12	2302068	2302079	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015914	ATTAAA	2	12	2356339	2356350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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251	NC_015914	TATATT	2	12	4594075	4594086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
252	NC_015914	TTGATT	2	12	4596296	4596307	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
253	NC_015914	TTAAAA	2	12	4624484	4624495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
254	NC_015914	CTATTT	2	12	4670345	4670356	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
255	NC_015914	AATTAA	2	12	4690353	4690364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
256	NC_015914	ATGATA	2	12	4700737	4700748	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
257	NC_015914	TTATTT	2	12	4707941	4707952	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
258	NC_015914	AGTATT	2	12	4766052	4766063	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
259	NC_015914	TATACT	2	12	4788360	4788371	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
260	NC_015914	TTTTTC	2	12	4792820	4792831	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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272	NC_015914	TAGGTG	2	12	4971912	4971923	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
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276	NC_015914	AATAAA	2	12	5064978	5064989	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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281	NC_015914	TGAAGC	2	12	5249959	5249970	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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285	NC_015914	TTATCA	2	12	5446205	5446216	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.