MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Cyclobacterium marinum DSM 745 chromosome

Total Repeats: 65134

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015914	GTA	3	9	324	332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343082722
2	NC_015914	CTT	2	6	508	513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343082722
3	NC_015914	CTT	2	6	583	588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343082722
4	NC_015914	GAC	2	6	798	803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	343082722
5	NC_015914	GAA	2	6	826	831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343082722
6	NC_015914	TCA	2	6	866	871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343082722
7	NC_015914	ATC	2	6	885	890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343082722
8	NC_015914	TGA	2	6	1111	1116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343082722
9	NC_015914	CAA	2	6	1233	1238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343082722
10	NC_015914	TAT	2	6	1251	1256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343082722
11	NC_015914	GGA	2	6	1383	1388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	343082722
12	NC_015914	CTA	2	6	1502	1507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343082722
13	NC_015914	CTT	2	6	1613	1618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343082723
14	NC_015914	ATC	2	6	1743	1748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343082723
15	NC_015914	CAC	2	6	1887	1892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	343082723
16	NC_015914	GAA	2	6	1991	1996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343082724
17	NC_015914	ATT	2	6	2026	2031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343082724
18	NC_015914	CAT	2	6	2169	2174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343082724
19	NC_015914	ATT	2	6	2283	2288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343082724
20	NC_015914	CTT	2	6	2395	2400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343082724
21	NC_015914	ATT	2	6	2469	2474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343082724
22	NC_015914	CTA	2	6	2495	2500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343082724
23	NC_015914	ATT	2	6	2578	2583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343082725
24	NC_015914	AAT	2	6	2634	2639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343082725
25	NC_015914	AGA	2	6	2675	2680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343082725
26	NC_015914	AGT	2	6	2681	2686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343082725
27	NC_015914	CAA	2	6	2760	2765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343082725
28	NC_015914	CTT	2	6	2943	2948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343082725
29	NC_015914	ACT	2	6	2953	2958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343082725
30	NC_015914	AGA	2	6	2975	2980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343082725
31	NC_015914	TCA	2	6	3178	3183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343082725
32	NC_015914	CAA	3	9	3203	3211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343082725
33	NC_015914	CAG	2	6	3218	3223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	343082725
34	NC_015914	AGT	2	6	3226	3231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343082725
35	NC_015914	ATC	2	6	3247	3252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343082726
36	NC_015914	AGG	2	6	3261	3266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	343082726
37	NC_015914	CAA	2	6	3337	3342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343082726
38	NC_015914	GCA	2	6	3359	3364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	343082726
39	NC_015914	TCA	2	6	3369	3374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343082726
40	NC_015914	AGA	2	6	3375	3380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343082726
41	NC_015914	ATG	2	6	3437	3442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343082726
42	NC_015914	TCA	2	6	3461	3466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343082726
43	NC_015914	AAG	2	6	3626	3631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343082726
44	NC_015914	GTT	2	6	3720	3725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343082727
45	NC_015914	TTC	2	6	3748	3753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343082727
46	NC_015914	TCA	2	6	3803	3808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343082727
47	NC_015914	CTG	2	6	3825	3830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	343082727
48	NC_015914	TCA	2	6	3953	3958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343082727
49	NC_015914	ACA	2	6	4041	4046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343082727
50	NC_015914	AAT	2	6	4224	4229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343082728
51	NC_015914	AAT	2	6	4617	4622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343082728
52	NC_015914	TCT	2	6	4676	4681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343082729
53	NC_015914	AAT	2	6	4702	4707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343082729
54	NC_015914	CCA	2	6	4747	4752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	343082729
55	NC_015914	TAA	2	6	4809	4814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343082729
56	NC_015914	TAA	2	6	4819	4824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343082729
57	NC_015914	TCC	2	6	4849	4854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	343082729
58	NC_015914	ATT	2	6	4877	4882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343082729
59	NC_015914	AGA	2	6	4898	4903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343082729
60	NC_015914	GCT	2	6	4919	4924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	343082729
61	NC_015914	GAG	2	6	5017	5022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	343082729
62	NC_015914	ACC	3	9	5039	5047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	343082729
63	NC_015914	GCT	2	6	5096	5101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	343082729
64	NC_015914	AGC	2	6	5143	5148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	343082729
65	NC_015914	TCA	2	6	5258	5263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343082729
66	NC_015914	ATT	2	6	5314	5319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343082729
67	NC_015914	ACT	2	6	5339	5344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343082729
68	NC_015914	ACC	2	6	5453	5458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	343082729
69	NC_015914	CAA	2	6	5532	5537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343082729
70	NC_015914	CTT	2	6	5616	5621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343082729
71	NC_015914	GCA	2	6	5720	5725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	343082729
72	NC_015914	TTC	2	6	5752	5757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343082729
73	NC_015914	TTA	2	6	5775	5780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343082729
74	NC_015914	AAG	2	6	5797	5802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343082729
75	NC_015914	GGA	2	6	5877	5882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	343082730
76	NC_015914	TAT	2	6	5937	5942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343082730
77	NC_015914	ACC	2	6	5986	5991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	343082730
78	NC_015914	TCA	2	6	6004	6009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343082730
79	NC_015914	TCC	2	6	6269	6274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	343082730
80	NC_015914	ATT	2	6	6328	6333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343082730
81	NC_015914	CCT	2	6	6361	6366	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	343082730
82	NC_015914	TAA	2	6	6375	6380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343082730
83	NC_015914	ACA	2	6	6496	6501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343082730
84	NC_015914	ACC	2	6	6582	6587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	343082731
85	NC_015914	ATC	2	6	6853	6858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343082731
86	NC_015914	ATT	2	6	6894	6899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343082731
87	NC_015914	GAT	2	6	7088	7093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343082731
88	NC_015914	CAG	2	6	7256	7261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	343082731
89	NC_015914	TCT	2	6	7279	7284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343082731
90	NC_015914	ATT	2	6	7290	7295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343082731
91	NC_015914	CAT	2	6	7530	7535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343082731
92	NC_015914	AAT	2	6	7599	7604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343082731
93	NC_015914	TGG	2	6	7606	7611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	343082731
94	NC_015914	TTA	2	6	7667	7672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343082731
95	NC_015914	TAC	2	6	7691	7696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343082731
96	NC_015914	TAA	2	6	7742	7747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343082732
97	NC_015914	TAA	2	6	7948	7953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343082732
98	NC_015914	ATT	2	6	8030	8035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343082732
99	NC_015914	AAT	3	9	8036	8044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343082732
100	NC_015914	GAA	2	6	8214	8219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343082732
101	NC_015914	CAA	2	6	8246	8251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343082732
102	NC_015914	AAT	2	6	8318	8323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343082732
103	NC_015914	ATA	2	6	8385	8390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343082732
104	NC_015914	TTC	2	6	8510	8515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343082732
105	NC_015914	TAA	2	6	8581	8586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343082732
106	NC_015914	CTC	2	6	8740	8745	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	343082732
107	NC_015914	ACC	2	6	8787	8792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	343082732
108	NC_015914	ATA	2	6	8922	8927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343082732
109	NC_015914	AGT	2	6	8985	8990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343082732
110	NC_015914	AAG	2	6	9149	9154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343082733
111	NC_015914	CCA	2	6	9161	9166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	343082733
112	NC_015914	ATT	2	6	9292	9297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343082733
113	NC_015914	TTA	3	9	9344	9352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343082733
114	NC_015914	GAT	2	6	9632	9637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343082734
115	NC_015914	AGG	2	6	9659	9664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	343082734
116	NC_015914	TCC	2	6	9770	9775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	343082734
117	NC_015914	GCA	2	6	9783	9788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	343082734
118	NC_015914	ATC	2	6	9828	9833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343082734
119	NC_015914	ATG	2	6	9864	9869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343082734
120	NC_015914	GTA	2	6	9999	10004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343082734
121	NC_015914	AGC	2	6	10031	10036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	343082734
122	NC_015914	ATC	2	6	10098	10103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343082734
123	NC_015914	CTA	2	6	10111	10116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343082734
124	NC_015914	TGG	2	6	10181	10186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	343082734
125	NC_015914	CAA	2	6	10229	10234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343082734
126	NC_015914	TGT	2	6	10241	10246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343082734
127	NC_015914	AGA	2	6	10281	10286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343082734
128	NC_015914	GAT	2	6	10320	10325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343082734
129	NC_015914	TAT	2	6	10346	10351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343082734
130	NC_015914	TTG	2	6	10369	10374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343082734
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251	NC_015914	CAT	2	6	20511	20516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343082741
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254	NC_015914	CTA	2	6	20718	20723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343082741
255	NC_015914	TGC	3	9	20728	20736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	343082741
256	NC_015914	ACT	2	6	20753	20758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343082741
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258	NC_015914	ACA	2	6	21370	21375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343082742
259	NC_015914	TAA	2	6	21401	21406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343082742
260	NC_015914	GCA	2	6	21582	21587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	343082742
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262	NC_015914	ACT	2	6	21615	21620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343082742
263	NC_015914	AAT	2	6	21649	21654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343082742
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271	NC_015914	TGA	2	6	22264	22269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343082742
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284	NC_015914	TTC	2	6	23150	23155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343082743
285	NC_015914	CTT	2	6	23182	23187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343082743
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374	NC_015914	ATG	2	6	30122	30127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343082748
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378	NC_015914	CCA	2	6	30312	30317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	343082748
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493	NC_015914	GCA	2	6	41823	41828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	343082760
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496	NC_015914	CAA	2	6	42124	42129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343082760
497	NC_015914	ATA	2	6	42738	42743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343082761
498	NC_015914	CAC	2	6	43160	43165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	343082761
499	NC_015914	TGG	2	6	43340	43345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	343082762
500	NC_015914	GCT	2	6	43448	43453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	343082762

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