MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Arthromitus sp. SFB-mouse-Japan

Total Repeats: 837

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015913	TATAAA	2	12	2068	2079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	342731688
2	NC_015913	ATGATA	2	12	2987	2998	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	342731689
3	NC_015913	AAATAT	2	12	3411	3422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	342731689
4	NC_015913	TAATGG	2	12	4472	4483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342731691
5	NC_015913	AATAAA	2	12	4760	4771	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	342731691
6	NC_015913	AAATAT	2	12	10969	10980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	342731695
7	NC_015913	GATTTT	2	12	11105	11116	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	342731695
8	NC_015913	AAATTT	2	12	12806	12817	50 %	50 %	0 %	0 %	342731696
9	NC_015913	CCTTAT	2	12	13670	13681	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	342731696
10	NC_015913	TGAATT	2	12	15460	15471	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	342731696
11	NC_015913	TAAGAA	2	12	15760	15771	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	342731696
12	NC_015913	AATGGA	2	12	15875	15886	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	342731696
13	NC_015913	ATGAGG	2	12	16631	16642	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	342731697
14	NC_015913	TATGAT	2	12	19132	19143	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	342731697
15	NC_015913	TATCTG	2	12	19169	19180	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	342731697
16	NC_015913	ATATAA	2	12	21034	21045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	342731699
17	NC_015913	ATTTTA	2	12	26284	26295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342731705
18	NC_015913	TGATAT	2	12	29983	29994	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	342731707
19	NC_015913	ATAACT	2	12	31311	31322	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	342731709
20	NC_015913	TATAAA	2	12	31706	31717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	342731710
21	NC_015913	TTAAGT	2	12	32458	32469	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	342731710
22	NC_015913	TATAAA	2	12	33195	33206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	342731711
23	NC_015913	AGAGGA	2	12	33847	33858	50 %	0 %	50 %	0 %	342731711
24	NC_015913	AGATTT	2	12	36008	36019	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	342731714
25	NC_015913	AAGGAT	2	12	39043	39054	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	342731716
26	NC_015913	GTCTCC	2	12	60316	60327	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	342731728
27	NC_015913	AATTTA	2	12	61180	61191	50 %	50 %	0 %	0 %	342731729
28	NC_015913	AATAAG	2	12	61434	61445	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	342731729
29	NC_015913	ATTATA	2	12	64456	64467	50 %	50 %	0 %	0 %	342731731
30	NC_015913	GTTCAT	2	12	67698	67709	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	342731734
31	NC_015913	TATAAA	2	12	78298	78309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	342731746
32	NC_015913	CATATA	2	12	78683	78694	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	342731747
33	NC_015913	TATAAA	2	12	81303	81314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	342731751
34	NC_015913	TAGAGA	2	12	81514	81525	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	342731751
35	NC_015913	TTACCT	2	12	81819	81830	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	342731751
36	NC_015913	ATAATT	2	12	81877	81888	50 %	50 %	0 %	0 %	342731751
37	NC_015913	TAATGA	2	12	85518	85529	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	342731754
38	NC_015913	TTAATA	2	12	89298	89309	50 %	50 %	0 %	0 %	342731756
39	NC_015913	TCTGGA	2	12	91372	91383	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	342731757
40	NC_015913	ATGAAA	2	12	93447	93458	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	342731758
41	NC_015913	GATTTG	2	12	94523	94534	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	342731759
42	NC_015913	AGATAA	2	12	96056	96067	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	342731760
43	NC_015913	GATAGT	2	12	103055	103066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342731766
44	NC_015913	TAAATT	2	12	103228	103239	50 %	50 %	0 %	0 %	342731766
45	NC_015913	ATGTTA	2	12	107071	107082	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	342731767
46	NC_015913	CTGATA	2	12	112268	112279	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	342731771
47	NC_015913	CTTTTT	2	12	112381	112392	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	342731771
48	NC_015913	TAGAAA	2	12	112757	112768	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	342731772
49	NC_015913	TAGATA	2	12	113581	113592	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	342731772
50	NC_015913	AAAGAA	2	12	114291	114302	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	342731773
51	NC_015913	AGACCA	2	12	117519	117530	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	342731775
52	NC_015913	TAGCAA	2	12	118748	118759	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	342731778
53	NC_015913	AAACTA	2	12	120705	120716	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	342731784
54	NC_015913	AGTACA	2	12	123883	123894	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	342731788
55	NC_015913	AGATGA	2	12	124303	124314	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	342731788
56	NC_015913	ATAAGA	2	12	128178	128189	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	342731790
57	NC_015913	TGAAAT	2	12	129863	129874	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	342731792
58	NC_015913	TTTGGA	2	12	135233	135244	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	342731799
59	NC_015913	GCTAAA	2	12	137372	137383	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	342731802
60	NC_015913	TGAGTT	2	12	137852	137863	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	342731803
61	NC_015913	TAAATT	2	12	138756	138767	50 %	50 %	0 %	0 %	342731804
62	NC_015913	GTACAA	2	12	139423	139434	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	342731805
63	NC_015913	TTTAAT	2	12	140797	140808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342731808
64	NC_015913	AGGTAC	2	12	140946	140957	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	342731808
65	NC_015913	TTAGTG	2	12	144305	144316	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	342731814
66	NC_015913	GATAAG	2	12	147812	147823	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	342731816
67	NC_015913	AAAGCT	2	12	148322	148333	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	342731816
68	NC_015913	ATTAAT	2	12	148877	148888	50 %	50 %	0 %	0 %	342731818
69	NC_015913	TAAAAA	2	12	154938	154949	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	342731824
70	NC_015913	TTTTAA	2	12	156526	156537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342731829
71	NC_015913	ATTGAA	2	12	157832	157843	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	342731831
72	NC_015913	AATTTA	2	12	157865	157876	50 %	50 %	0 %	0 %	342731831
73	NC_015913	AATTTA	2	12	160693	160704	50 %	50 %	0 %	0 %	342731833
74	NC_015913	ATAAAA	2	12	161814	161825	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	342731833
75	NC_015913	TTTATT	2	12	162513	162524	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	342731834
76	NC_015913	ATTTAT	2	12	168564	168575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342731839
77	NC_015913	TTATAT	2	12	169384	169395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342731840
78	NC_015913	ATTTTG	2	12	173077	173088	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	342731844
79	NC_015913	TTTAAT	2	12	177063	177074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342731849
80	NC_015913	TTGATT	2	12	180689	180700	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	342731852
81	NC_015913	AAATAT	2	12	181356	181367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	342731853
82	NC_015913	ATATTT	2	12	184430	184441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342731856
83	NC_015913	ATTTTT	2	12	184850	184861	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	342731857
84	NC_015913	GTATTT	2	12	190392	190403	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	342731858
85	NC_015913	TAATTA	2	12	190858	190869	50 %	50 %	0 %	0 %	342731858
86	NC_015913	TAAAAA	2	12	190907	190918	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	342731858
87	NC_015913	TTTTAA	2	12	194091	194102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342731861
88	NC_015913	TACTTT	2	12	196012	196023	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	342731864
89	NC_015913	GGTATA	2	12	204017	204028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342731870
90	NC_015913	TTAAAT	2	12	205721	205732	50 %	50 %	0 %	0 %	342731871
91	NC_015913	TCCAAC	2	12	209027	209038	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	342731875
92	NC_015913	GGAATT	2	12	209933	209944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342731876
93	NC_015913	ACAAAG	2	12	214803	214814	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	342731880
94	NC_015913	ATTGAT	2	12	214976	214987	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	342731880
95	NC_015913	ATTTCT	2	12	215411	215422	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	342731881
96	NC_015913	TAAAGA	2	12	216958	216969	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	342731884
97	NC_015913	GACCAG	2	12	222056	222067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	342731886
98	NC_015913	ATTAAC	2	12	223662	223673	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	342731886
99	NC_015913	AGAAGG	2	12	227267	227278	50 %	0 %	50 %	0 %	342731887
100	NC_015913	TTTATA	2	12	228244	228255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342731889
101	NC_015913	AATGGT	2	12	229192	229203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342731890
102	NC_015913	CCAGGA	2	12	230156	230167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	342731891
103	NC_015913	TGATAG	2	12	230875	230886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342731891
104	NC_015913	TATGAA	2	12	232417	232428	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	342731892
105	NC_015913	AATAAG	2	12	232901	232912	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	342731892
106	NC_015913	TATATT	2	12	236130	236141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342731895
107	NC_015913	ATTTAG	2	12	243869	243880	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	342731903
108	NC_015913	GAGGAT	2	12	245775	245786	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	342731905
109	NC_015913	CAGGTA	2	12	246244	246255	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	342731905
110	NC_015913	AATTTA	2	12	247061	247072	50 %	50 %	0 %	0 %	342731906
111	NC_015913	TGAGAT	2	12	247222	247233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342731906
112	NC_015913	TTTCAT	2	12	250094	250105	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	342731907
113	NC_015913	TAGTGG	2	12	254060	254071	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	342731911
114	NC_015913	TATATT	2	12	256224	256235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342731912
115	NC_015913	ATAAGA	2	12	270889	270900	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	342731926
116	NC_015913	TTGAGA	2	12	272408	272419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342731929
117	NC_015913	TTAAGG	2	12	272756	272767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342731929
118	NC_015913	TATAAT	2	12	275552	275563	50 %	50 %	0 %	0 %	342731930
119	NC_015913	TTAAAA	2	12	277367	277378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	342731932
120	NC_015913	TTTATT	2	12	277874	277885	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	342731934
121	NC_015913	AAAATA	2	12	278050	278061	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	342731934
122	NC_015913	ATTTTG	2	12	279096	279107	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	342731936
123	NC_015913	ACTTGC	2	12	280386	280397	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	342731937
124	NC_015913	ATATGG	2	12	283044	283055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342731940
125	NC_015913	ATTTAA	2	12	284590	284601	50 %	50 %	0 %	0 %	342731941
126	NC_015913	GATTTA	2	12	286412	286423	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	342731943
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130	NC_015913	TGTATC	2	12	292646	292657	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	342731948
131	NC_015913	AAGACT	2	12	292980	292991	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	342731948
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134	NC_015913	GTTAAA	2	12	295369	295380	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	342731951
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140	NC_015913	TATTAA	2	12	321105	321116	50 %	50 %	0 %	0 %	342731960
141	NC_015913	AGTTTG	2	12	321637	321648	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	342731961
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161	NC_015913	GTAACT	2	12	365190	365201	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	342732007
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232	NC_015913	GATTTT	2	12	483658	483669	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	342732131
233	NC_015913	TCCTGA	2	12	486512	486523	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	342732132
234	NC_015913	AGATTC	2	12	487183	487194	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	342732133
235	NC_015913	TATTTA	2	12	492196	492207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342732138
236	NC_015913	TAAAAA	2	12	504272	504283	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	342732144
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238	NC_015913	AATATA	2	12	507099	507110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	342732147
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342	NC_015913	CAATAG	2	12	731320	731331	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	342732358
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349	NC_015913	TTGATA	2	12	749584	749595	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	342732372
350	NC_015913	TTAAAT	2	12	751504	751515	50 %	50 %	0 %	0 %	342732374
351	NC_015913	AGATAA	2	12	751786	751797	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	342732374
352	NC_015913	ATCTTC	2	12	754247	754258	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	342732378
353	NC_015913	TAATAT	2	12	758124	758135	50 %	50 %	0 %	0 %	342732382
354	NC_015913	GATTTA	2	12	761193	761204	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	342732384
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464	NC_015913	CCTAAA	2	12	963516	963527	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	342732565
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467	NC_015913	CCAAAT	2	12	969271	969282	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	342732569
468	NC_015913	TTGATC	2	12	971727	971738	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	342732571
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470	NC_015913	TTTCTC	2	12	972872	972883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342732572
471	NC_015913	ACACAA	2	12	975409	975420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	342732574
472	NC_015913	TACCAT	2	12	976006	976017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342732575
473	NC_015913	AGATGT	2	12	976508	976519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342732576
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477	NC_015913	AAAATA	2	12	990974	990985	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	342732589
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499	NC_015913	TAGCTT	2	12	1030378	1030389	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	342732627
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