MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia bissettii DN127 plasmid cp9

Total Repeats: 33

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015911	CAAC	2	8	167	174	50 %	0 %	0 %	50 %	343127106
2	NC_015911	ATAA	2	8	244	251	75 %	25 %	0 %	0 %	343127106
3	NC_015911	AATA	2	8	478	485	75 %	25 %	0 %	0 %	343127106
4	NC_015911	AAAT	2	8	1097	1104	75 %	25 %	0 %	0 %	343127106
5	NC_015911	TAGA	2	8	1244	1251	50 %	25 %	25 %	0 %	343127106
6	NC_015911	ATCA	2	8	1460	1467	50 %	25 %	0 %	25 %	343127107
7	NC_015911	AGAT	2	8	1694	1701	50 %	25 %	25 %	0 %	343127107
8	NC_015911	ATAA	2	8	2310	2317	75 %	25 %	0 %	0 %	343127108
9	NC_015911	TAGA	2	8	2482	2489	50 %	25 %	25 %	0 %	343127108
10	NC_015911	TATT	2	8	3497	3504	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015911	CTAT	2	8	4528	4535	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_015911	TCTT	2	8	4645	4652	0 %	75 %	0 %	25 %	343127111
13	NC_015911	AAAC	2	8	4805	4812	75 %	0 %	0 %	25 %	343127111
14	NC_015911	ATTT	2	8	4820	4827	25 %	75 %	0 %	0 %	343127111
15	NC_015911	TTAA	2	8	4984	4991	50 %	50 %	0 %	0 %	343127111
16	NC_015911	TAAA	2	8	6307	6314	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015911	TAAA	2	8	6345	6352	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015911	ATTA	2	8	6484	6491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015911	TTAT	2	8	6640	6647	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015911	TTTA	2	8	6649	6656	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015911	ACAA	2	8	6698	6705	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_015911	GTAA	2	8	6835	6842	50 %	25 %	25 %	0 %	343127113
23	NC_015911	AAAT	2	8	6848	6855	75 %	25 %	0 %	0 %	343127113
24	NC_015911	TACT	2	8	7007	7014	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_015911	TTTG	2	8	7771	7778	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015911	AAAT	2	8	8391	8398	75 %	25 %	0 %	0 %	343127115
27	NC_015911	CATT	2	8	8634	8641	25 %	50 %	0 %	25 %	343127116
28	NC_015911	AAGA	2	8	8721	8728	75 %	0 %	25 %	0 %	343127117
29	NC_015911	ATCT	2	8	8762	8769	25 %	50 %	0 %	25 %	343127117
30	NC_015911	CCAT	2	8	9474	9481	25 %	25 %	0 %	50 %	343127117
31	NC_015911	GTTT	2	8	9773	9780	0 %	75 %	25 %	0 %	343127117
32	NC_015911	AATA	2	8	10011	10018	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015911	TTAG	2	8	10100	10107	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.