MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Borrelia bissettii DN127 plasmid cp9

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015911	CAAC	2	8	167	174	50 %	0 %	0 %	50 %	343127106
2	NC_015911	ATAA	2	8	244	251	75 %	25 %	0 %	0 %	343127106
3	NC_015911	AATA	2	8	478	485	75 %	25 %	0 %	0 %	343127106
4	NC_015911	AAAT	2	8	1097	1104	75 %	25 %	0 %	0 %	343127106
5	NC_015911	TAGA	2	8	1244	1251	50 %	25 %	25 %	0 %	343127106
6	NC_015911	ATCA	2	8	1460	1467	50 %	25 %	0 %	25 %	343127107
7	NC_015911	AGAT	2	8	1694	1701	50 %	25 %	25 %	0 %	343127107
8	NC_015911	ATAA	2	8	2310	2317	75 %	25 %	0 %	0 %	343127108
9	NC_015911	TAGA	2	8	2482	2489	50 %	25 %	25 %	0 %	343127108
10	NC_015911	TCTT	2	8	4645	4652	0 %	75 %	0 %	25 %	343127111
11	NC_015911	AAAC	2	8	4805	4812	75 %	0 %	0 %	25 %	343127111
12	NC_015911	ATTT	2	8	4820	4827	25 %	75 %	0 %	0 %	343127111
13	NC_015911	TTAA	2	8	4984	4991	50 %	50 %	0 %	0 %	343127111
14	NC_015911	GTAA	2	8	6835	6842	50 %	25 %	25 %	0 %	343127113
15	NC_015911	AAAT	2	8	6848	6855	75 %	25 %	0 %	0 %	343127113
16	NC_015911	AAAT	2	8	8391	8398	75 %	25 %	0 %	0 %	343127115
17	NC_015911	CATT	2	8	8634	8641	25 %	50 %	0 %	25 %	343127116
18	NC_015911	AAGA	2	8	8721	8728	75 %	0 %	25 %	0 %	343127117
19	NC_015911	ATCT	2	8	8762	8769	25 %	50 %	0 %	25 %	343127117
20	NC_015911	CCAT	2	8	9474	9481	25 %	25 %	0 %	50 %	343127117
21	NC_015911	GTTT	2	8	9773	9780	0 %	75 %	25 %	0 %	343127117

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.