MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia bissettii DN127 plasmid cp32-7

Total Repeats: 401

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015910	AGA	2	6	164	169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127061
2	NC_015910	TAT	2	6	272	277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127061
3	NC_015910	AAC	2	6	343	348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127061
4	NC_015910	CAA	2	6	449	454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127061
5	NC_015910	TTA	2	6	499	504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127061
6	NC_015910	CAA	2	6	685	690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127061
7	NC_015910	CTT	2	6	691	696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127061
8	NC_015910	AAT	2	6	717	722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127061
9	NC_015910	TCT	2	6	744	749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127061
10	NC_015910	ATA	2	6	778	783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127061
11	NC_015910	AAT	2	6	855	860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127061
12	NC_015910	TTA	2	6	904	909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127061
13	NC_015910	AGG	2	6	931	936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	343127061
14	NC_015910	ATG	2	6	1024	1029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127061
15	NC_015910	ATT	2	6	1048	1053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127061
16	NC_015910	GAA	2	6	1161	1166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127061
17	NC_015910	AGT	2	6	1230	1235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127061
18	NC_015910	TAA	2	6	1241	1246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127061
19	NC_015910	GAG	2	6	1248	1253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	343127061
20	NC_015910	ATT	2	6	1274	1279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127061
21	NC_015910	AGA	2	6	1317	1322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127062
22	NC_015910	AGC	2	6	1355	1360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	343127062
23	NC_015910	TTC	3	9	1809	1817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127062
24	NC_015910	TTG	2	6	1841	1846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343127062
25	NC_015910	AGA	2	6	1854	1859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127062
26	NC_015910	CAA	2	6	2085	2090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127063
27	NC_015910	CTA	2	6	2164	2169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127063
28	NC_015910	GTA	2	6	2170	2175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127063
29	NC_015910	AAC	2	6	2249	2254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127063
30	NC_015910	TGG	3	9	2273	2281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	343127063
31	NC_015910	GAT	2	6	2283	2288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127063
32	NC_015910	ATA	2	6	2392	2397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127063
33	NC_015910	TAA	2	6	2565	2570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127063
34	NC_015910	GCT	2	6	2655	2660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	343127064
35	NC_015910	GAT	2	6	2739	2744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127064
36	NC_015910	AGA	2	6	2888	2893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127064
37	NC_015910	TTA	2	6	3136	3141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127064
38	NC_015910	CCA	2	6	3159	3164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	343127064
39	NC_015910	ATC	2	6	3552	3557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127065
40	NC_015910	TGG	3	9	3649	3657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	343127065
41	NC_015910	CTA	2	6	3708	3713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127065
42	NC_015910	AAT	2	6	3728	3733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127065
43	NC_015910	TAG	2	6	3747	3752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127065
44	NC_015910	TAA	2	6	3793	3798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127065
45	NC_015910	TAA	2	6	3941	3946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127065
46	NC_015910	ATT	2	6	3970	3975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127066
47	NC_015910	TGA	2	6	3976	3981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127066
48	NC_015910	ATT	2	6	3984	3989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127066
49	NC_015910	TAT	2	6	4033	4038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127066
50	NC_015910	ACA	2	6	4136	4141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127066
51	NC_015910	GGT	2	6	4189	4194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	343127066
52	NC_015910	ATT	2	6	4203	4208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127066
53	NC_015910	TAA	3	9	4288	4296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127066
54	NC_015910	AGT	2	6	4331	4336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127066
55	NC_015910	ATT	2	6	4340	4345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127066
56	NC_015910	ACT	2	6	4435	4440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127066
57	NC_015910	AGA	2	6	4462	4467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127066
58	NC_015910	GTG	2	6	4476	4481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	343127066
59	NC_015910	ATG	2	6	4565	4570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127066
60	NC_015910	GCA	3	9	4616	4624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	343127066
61	NC_015910	TAA	2	6	4687	4692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127066
62	NC_015910	AGA	2	6	4696	4701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127066
63	NC_015910	TTA	2	6	4767	4772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127066
64	NC_015910	CTA	2	6	4881	4886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127066
65	NC_015910	GAA	3	9	4983	4991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127067
66	NC_015910	ATT	2	6	5257	5262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127067
67	NC_015910	AGT	2	6	5271	5276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127067
68	NC_015910	GAA	2	6	5283	5288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127067
69	NC_015910	GGT	2	6	5289	5294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	343127067
70	NC_015910	TGT	2	6	5491	5496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343127068
71	NC_015910	TTC	2	6	5512	5517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127068
72	NC_015910	TTA	2	6	5565	5570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127068
73	NC_015910	TGG	2	6	5814	5819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	343127069
74	NC_015910	AGC	2	6	5854	5859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	343127069
75	NC_015910	TAG	2	6	5895	5900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127069
76	NC_015910	AAT	2	6	5923	5928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127069
77	NC_015910	TAT	2	6	6017	6022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127069
78	NC_015910	GCA	2	6	6091	6096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	343127069
79	NC_015910	TTG	2	6	6104	6109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343127069
80	NC_015910	AAT	2	6	6231	6236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127070
81	NC_015910	GCT	2	6	6291	6296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	343127070
82	NC_015910	ATA	2	6	6306	6311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127070
83	NC_015910	TTA	2	6	6604	6609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127070
84	NC_015910	AGG	2	6	6691	6696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	343127070
85	NC_015910	ATT	2	6	6767	6772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127071
86	NC_015910	TAA	2	6	6813	6818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127071
87	NC_015910	GCC	2	6	6823	6828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	343127071
88	NC_015910	TAA	2	6	6855	6860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127071
89	NC_015910	GAA	2	6	6973	6978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127071
90	NC_015910	TGT	2	6	7062	7067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343127071
91	NC_015910	GAT	2	6	7096	7101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127071
92	NC_015910	TAA	2	6	7128	7133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127071
93	NC_015910	AAT	2	6	7246	7251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127071
94	NC_015910	GCT	2	6	7339	7344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	343127071
95	NC_015910	TTG	2	6	7352	7357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343127071
96	NC_015910	CTT	2	6	7408	7413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127071
97	NC_015910	AAG	2	6	7448	7453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127071
98	NC_015910	ATT	2	6	7519	7524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127071
99	NC_015910	TAC	2	6	7773	7778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127071
100	NC_015910	TGG	2	6	7871	7876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	343127072
101	NC_015910	CAA	2	6	7921	7926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127072
102	NC_015910	TAG	2	6	7937	7942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127072
103	NC_015910	TAA	2	6	7963	7968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127072
104	NC_015910	TGA	2	6	8057	8062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127072
105	NC_015910	ACA	2	6	8071	8076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127072
106	NC_015910	ATT	2	6	8139	8144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127072
107	NC_015910	AAG	2	6	8177	8182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127072
108	NC_015910	CTG	2	6	8188	8193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	343127072
109	NC_015910	ACA	2	6	8251	8256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127072
110	NC_015910	TTA	2	6	8272	8277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127073
111	NC_015910	TTA	2	6	8507	8512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127073
112	NC_015910	TTG	2	6	8524	8529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343127073
113	NC_015910	AAT	2	6	8531	8536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127073
114	NC_015910	AAT	2	6	8616	8621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127073
115	NC_015910	TCA	2	6	8691	8696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127073
116	NC_015910	ATT	2	6	8829	8834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127074
117	NC_015910	CAA	2	6	9022	9027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127075
118	NC_015910	AGC	2	6	9350	9355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	343127075
119	NC_015910	TTG	2	6	9373	9378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343127075
120	NC_015910	TGG	2	6	9437	9442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	343127075
121	NC_015910	AGA	2	6	9500	9505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127075
122	NC_015910	AAC	2	6	9522	9527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127075
123	NC_015910	AAG	2	6	9607	9612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127075
124	NC_015910	AAG	2	6	9673	9678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127075
125	NC_015910	CAA	2	6	9697	9702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127075
126	NC_015910	AGC	2	6	9707	9712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	343127075
127	NC_015910	TTG	2	6	9733	9738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343127075
128	NC_015910	GTT	2	6	9762	9767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343127075
129	NC_015910	TAA	2	6	9925	9930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127075
130	NC_015910	CTA	2	6	10220	10225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127075
131	NC_015910	ATT	2	6	10240	10245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127075
132	NC_015910	AAT	2	6	10263	10268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127075
133	NC_015910	TGA	2	6	10280	10285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127075
134	NC_015910	AAT	3	9	10344	10352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127076
135	NC_015910	GAA	2	6	10371	10376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127076
136	NC_015910	AAC	2	6	10436	10441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127076
137	NC_015910	GTT	2	6	10579	10584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343127076
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141	NC_015910	TGA	2	6	10889	10894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127076
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383	NC_015910	CTT	2	6	29781	29786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127104
384	NC_015910	GGA	2	6	29859	29864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	343127104
385	NC_015910	GTA	2	6	29896	29901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127104
386	NC_015910	TAT	2	6	29993	29998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127104
387	NC_015910	ATC	2	6	30016	30021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127104
388	NC_015910	ATA	2	6	30052	30057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127104
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390	NC_015910	TGA	2	6	30323	30328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127104
391	NC_015910	TAT	2	6	30333	30338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127104
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.