MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia bissettii DN127 plasmid cp32-5

Total Repeats: 108

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015909	ATTT	3	12	573	584	25 %	75 %	0 %	0 %	343127017
2	NC_015909	ACAA	2	8	768	775	75 %	0 %	0 %	25 %	343127017
3	NC_015909	AATT	2	8	1893	1900	50 %	50 %	0 %	0 %	343127018
4	NC_015909	ATAC	2	8	1928	1935	50 %	25 %	0 %	25 %	343127018
5	NC_015909	AAAG	2	8	2378	2385	75 %	0 %	25 %	0 %	343127019
6	NC_015909	TTTA	2	8	2516	2523	25 %	75 %	0 %	0 %	343127019
7	NC_015909	GCAA	2	8	2675	2682	50 %	0 %	25 %	25 %	343127020
8	NC_015909	ATGT	2	8	3013	3020	25 %	50 %	25 %	0 %	343127020
9	NC_015909	GTAT	2	8	3038	3045	25 %	50 %	25 %	0 %	343127020
10	NC_015909	ATAA	2	8	3120	3127	75 %	25 %	0 %	0 %	343127020
11	NC_015909	CAAT	2	8	3202	3209	50 %	25 %	0 %	25 %	343127020
12	NC_015909	TAAA	2	8	3364	3371	75 %	25 %	0 %	0 %	343127021
13	NC_015909	ATCA	2	8	4350	4357	50 %	25 %	0 %	25 %	343127023
14	NC_015909	AGTA	2	8	4782	4789	50 %	25 %	25 %	0 %	343127023
15	NC_015909	CTAC	2	8	4794	4801	25 %	25 %	0 %	50 %	343127023
16	NC_015909	TCAT	2	8	4841	4848	25 %	50 %	0 %	25 %	343127023
17	NC_015909	AAGC	2	8	5052	5059	50 %	0 %	25 %	25 %	343127024
18	NC_015909	TACT	2	8	5150	5157	25 %	50 %	0 %	25 %	343127024
19	NC_015909	AATG	2	8	5396	5403	50 %	25 %	25 %	0 %	343127024
20	NC_015909	AGCA	2	8	6062	6069	50 %	0 %	25 %	25 %	343127026
21	NC_015909	AGTC	2	8	6526	6533	25 %	25 %	25 %	25 %	343127027
22	NC_015909	AGAA	2	8	7219	7226	75 %	0 %	25 %	0 %	343127028
23	NC_015909	CAAG	2	8	7292	7299	50 %	0 %	25 %	25 %	343127028
24	NC_015909	CCCA	2	8	8239	8246	25 %	0 %	0 %	75 %	343127029
25	NC_015909	ATTT	2	8	8495	8502	25 %	75 %	0 %	0 %	343127030
26	NC_015909	TGAG	2	8	8599	8606	25 %	25 %	50 %	0 %	343127030
27	NC_015909	CTTG	2	8	8797	8804	0 %	50 %	25 %	25 %	343127031
28	NC_015909	GAAA	2	8	9598	9605	75 %	0 %	25 %	0 %	343127032
29	NC_015909	TTGA	2	8	10250	10257	25 %	50 %	25 %	0 %	343127032
30	NC_015909	GGCA	2	8	11202	11209	25 %	0 %	50 %	25 %	343127034
31	NC_015909	TATT	2	8	11537	11544	25 %	75 %	0 %	0 %	343127034
32	NC_015909	ACAA	2	8	11549	11556	75 %	0 %	0 %	25 %	343127034
33	NC_015909	TCAA	2	8	12109	12116	50 %	25 %	0 %	25 %	343127035
34	NC_015909	CAGT	2	8	12354	12361	25 %	25 %	25 %	25 %	343127035
35	NC_015909	AATT	2	8	12382	12389	50 %	50 %	0 %	0 %	343127035
36	NC_015909	TAAT	2	8	12434	12441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015909	TAAT	2	8	12943	12950	50 %	50 %	0 %	0 %	343127037
38	NC_015909	AGAT	2	8	13622	13629	50 %	25 %	25 %	0 %	343127037
39	NC_015909	AACA	2	8	13651	13658	75 %	0 %	0 %	25 %	343127037
40	NC_015909	TATC	2	8	13833	13840	25 %	50 %	0 %	25 %	343127038
41	NC_015909	AAAC	2	8	14025	14032	75 %	0 %	0 %	25 %	343127038
42	NC_015909	ATTT	2	8	14041	14048	25 %	75 %	0 %	0 %	343127038
43	NC_015909	GAAT	2	8	14575	14582	50 %	25 %	25 %	0 %	343127039
44	NC_015909	AAAT	2	8	14794	14801	75 %	25 %	0 %	0 %	343127039
45	NC_015909	ACAT	2	8	15056	15063	50 %	25 %	0 %	25 %	343127039
46	NC_015909	TCAA	2	8	15680	15687	50 %	25 %	0 %	25 %	343127041
47	NC_015909	CTAT	2	8	15698	15705	25 %	50 %	0 %	25 %	343127041
48	NC_015909	TAAC	2	8	15768	15775	50 %	25 %	0 %	25 %	343127042
49	NC_015909	CAAT	2	8	16462	16469	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_015909	ATAG	2	8	16799	16806	50 %	25 %	25 %	0 %	343127044
51	NC_015909	ATAG	2	8	17474	17481	50 %	25 %	25 %	0 %	343127045
52	NC_015909	TTTG	2	8	18536	18543	0 %	75 %	25 %	0 %	343127046
53	NC_015909	AGTA	2	8	18904	18911	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015909	GAAA	2	8	18929	18936	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015909	AACT	2	8	19170	19177	50 %	25 %	0 %	25 %	343127048
56	NC_015909	GAAA	2	8	19560	19567	75 %	0 %	25 %	0 %	343127048
57	NC_015909	AGAA	2	8	19604	19611	75 %	0 %	25 %	0 %	343127048
58	NC_015909	AAAT	2	8	19646	19653	75 %	25 %	0 %	0 %	343127048
59	NC_015909	GAAA	2	8	19759	19766	75 %	0 %	25 %	0 %	343127048
60	NC_015909	TTTA	2	8	20212	20219	25 %	75 %	0 %	0 %	343127049
61	NC_015909	TTTA	2	8	20479	20486	25 %	75 %	0 %	0 %	343127049
62	NC_015909	GATA	2	8	20679	20686	50 %	25 %	25 %	0 %	343127050
63	NC_015909	TGGA	2	8	21321	21328	25 %	25 %	50 %	0 %	343127050
64	NC_015909	TAAA	2	8	21409	21416	75 %	25 %	0 %	0 %	343127051
65	NC_015909	AAAG	2	8	21726	21733	75 %	0 %	25 %	0 %	343127051
66	NC_015909	CAAA	2	8	21752	21759	75 %	0 %	0 %	25 %	343127051
67	NC_015909	TAAA	2	8	21989	21996	75 %	25 %	0 %	0 %	343127052
68	NC_015909	TAAT	2	8	22094	22101	50 %	50 %	0 %	0 %	343127052
69	NC_015909	AGAT	2	8	22145	22152	50 %	25 %	25 %	0 %	343127052
70	NC_015909	AGAT	2	8	22166	22173	50 %	25 %	25 %	0 %	343127052
71	NC_015909	ATAG	2	8	22201	22208	50 %	25 %	25 %	0 %	343127052
72	NC_015909	ATAG	2	8	22276	22283	50 %	25 %	25 %	0 %	343127052
73	NC_015909	ATAG	2	8	22309	22316	50 %	25 %	25 %	0 %	343127052
74	NC_015909	ATAG	2	8	22342	22349	50 %	25 %	25 %	0 %	343127052
75	NC_015909	ATAG	2	8	22375	22382	50 %	25 %	25 %	0 %	343127052
76	NC_015909	TATT	2	8	22768	22775	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015909	CAAA	2	8	23027	23034	75 %	0 %	0 %	25 %	343127053
78	NC_015909	GATA	2	8	23248	23255	50 %	25 %	25 %	0 %	343127053
79	NC_015909	TGTT	2	8	23516	23523	0 %	75 %	25 %	0 %	343127053
80	NC_015909	TGGT	2	8	23538	23545	0 %	50 %	50 %	0 %	343127053
81	NC_015909	AGAA	2	8	24074	24081	75 %	0 %	25 %	0 %	343127053
82	NC_015909	AGAT	2	8	24246	24253	50 %	25 %	25 %	0 %	343127053
83	NC_015909	AAAG	2	8	24356	24363	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015909	AAAT	2	8	24968	24975	75 %	25 %	0 %	0 %	343127055
85	NC_015909	TTTA	2	8	24999	25006	25 %	75 %	0 %	0 %	343127055
86	NC_015909	ACCA	2	8	25352	25359	50 %	0 %	0 %	50 %	343127055
87	NC_015909	GTTT	2	8	25372	25379	0 %	75 %	25 %	0 %	343127055
88	NC_015909	GCAA	2	8	25717	25724	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_015909	AAGA	2	8	25784	25791	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015909	TATT	2	8	25981	25988	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015909	GTTT	2	8	26059	26066	0 %	75 %	25 %	0 %	343127056
92	NC_015909	AGAA	2	8	26575	26582	75 %	0 %	25 %	0 %	343127056
93	NC_015909	AGAA	2	8	26623	26630	75 %	0 %	25 %	0 %	343127056
94	NC_015909	AGAA	2	8	26662	26669	75 %	0 %	25 %	0 %	343127056
95	NC_015909	ATAA	2	8	27136	27143	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015909	AAAT	2	8	27173	27180	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015909	TTTA	2	8	27285	27292	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015909	AATA	2	8	27899	27906	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015909	TAAA	2	8	28391	28398	75 %	25 %	0 %	0 %	343127058
100	NC_015909	CAAA	2	8	28596	28603	75 %	0 %	0 %	25 %	343127059
101	NC_015909	AAAT	2	8	28634	28641	75 %	25 %	0 %	0 %	343127059
102	NC_015909	AATT	2	8	28685	28692	50 %	50 %	0 %	0 %	343127059
103	NC_015909	TAGC	2	8	28792	28799	25 %	25 %	25 %	25 %	343127059
104	NC_015909	TGAT	2	8	28999	29006	25 %	50 %	25 %	0 %	343127059
105	NC_015909	AGCA	2	8	29360	29367	50 %	0 %	25 %	25 %	343127059
106	NC_015909	AAAT	2	8	29386	29393	75 %	25 %	0 %	0 %	343127059
107	NC_015909	TACA	2	8	29590	29597	50 %	25 %	0 %	25 %	343127059
108	NC_015909	TTAC	2	8	29752	29759	25 %	50 %	0 %	25 %	343127059

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.