MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Borrelia bissettii DN127 plasmid cp32-3

Total Repeats: 32

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015908	ATTAA	2	10	1780	1789	60 %	40 %	0 %	0 %	343126975
2	NC_015908	AATTA	2	10	2566	2575	60 %	40 %	0 %	0 %	343126976
3	NC_015908	AAGAG	2	10	3406	3415	60 %	0 %	40 %	0 %	343126978
4	NC_015908	GCAAA	2	10	3870	3879	60 %	0 %	20 %	20 %	343126978
5	NC_015908	TTTTG	2	10	4859	4868	0 %	80 %	20 %	0 %	343126979
6	NC_015908	GAAAA	2	10	6921	6930	80 %	0 %	20 %	0 %	343126984
7	NC_015908	AAAAC	2	10	8310	8319	80 %	0 %	0 %	20 %	343126986
8	NC_015908	AAGAA	2	10	9247	9256	80 %	0 %	20 %	0 %	343126988
9	NC_015908	GAAAA	2	10	10346	10355	80 %	0 %	20 %	0 %	343126989
10	NC_015908	GAAAG	2	10	10382	10391	60 %	0 %	40 %	0 %	343126989
11	NC_015908	GTTAG	2	10	11327	11336	20 %	40 %	40 %	0 %	343126990
12	NC_015908	ATAAA	2	10	11514	11523	80 %	20 %	0 %	0 %	343126990
13	NC_015908	TTAAA	2	10	11859	11868	60 %	40 %	0 %	0 %	343126990
14	NC_015908	AATCT	2	10	12260	12269	40 %	40 %	0 %	20 %	343126991
15	NC_015908	AACTT	2	10	12728	12737	40 %	40 %	0 %	20 %	343126992
16	NC_015908	GAAAA	2	10	13364	13373	80 %	0 %	20 %	0 %	343126993
17	NC_015908	AAAGT	2	10	13386	13395	60 %	20 %	20 %	0 %	343126993
18	NC_015908	AGAAA	2	10	14152	14161	80 %	0 %	20 %	0 %	343126994
19	NC_015908	ATCCC	2	10	15114	15123	20 %	20 %	0 %	60 %	343126995
20	NC_015908	ATTAA	2	10	15229	15238	60 %	40 %	0 %	0 %	343126996
21	NC_015908	AGTAA	2	10	15866	15875	60 %	20 %	20 %	0 %	343126998
22	NC_015908	TTGTT	2	10	16120	16129	0 %	80 %	20 %	0 %	343126999
23	NC_015908	TATGT	2	10	16230	16239	20 %	60 %	20 %	0 %	343126999
24	NC_015908	TAATT	2	10	16644	16653	40 %	60 %	0 %	0 %	343127000
25	NC_015908	AAAGA	2	10	16888	16897	80 %	0 %	20 %	0 %	343127000
26	NC_015908	ATAAA	2	10	18031	18040	80 %	20 %	0 %	0 %	343127002
27	NC_015908	CAAAA	2	10	22462	22471	80 %	0 %	0 %	20 %	343127007
28	NC_015908	TCTAT	2	10	23163	23172	20 %	60 %	0 %	20 %	343127008
29	NC_015908	GAGTT	2	10	24619	24628	20 %	40 %	40 %	0 %	343127009
30	NC_015908	AATAA	2	10	25062	25071	80 %	20 %	0 %	0 %	343127010
31	NC_015908	ATTTT	2	10	28336	28345	20 %	80 %	0 %	0 %	343127013
32	NC_015908	TTACA	2	10	30379	30388	40 %	40 %	0 %	20 %	343127015

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.