MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia bissettii DN127 plasmid cp32-3

Total Repeats: 100

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015908	ATTT	3	12	573	584	25 %	75 %	0 %	0 %	343126974
2	NC_015908	ACAA	2	8	768	775	75 %	0 %	0 %	25 %	343126974
3	NC_015908	AATT	2	8	1893	1900	50 %	50 %	0 %	0 %	343126975
4	NC_015908	ATAC	2	8	1928	1935	50 %	25 %	0 %	25 %	343126975
5	NC_015908	AAAG	2	8	2378	2385	75 %	0 %	25 %	0 %	343126976
6	NC_015908	TTTA	2	8	2516	2523	25 %	75 %	0 %	0 %	343126976
7	NC_015908	GCAA	2	8	2676	2683	50 %	0 %	25 %	25 %	343126977
8	NC_015908	ATGT	2	8	3014	3021	25 %	50 %	25 %	0 %	343126977
9	NC_015908	GTAT	2	8	3039	3046	25 %	50 %	25 %	0 %	343126977
10	NC_015908	CAAT	2	8	3203	3210	50 %	25 %	0 %	25 %	343126977
11	NC_015908	TAAA	2	8	3365	3372	75 %	25 %	0 %	0 %	343126978
12	NC_015908	TTTA	2	8	3892	3899	25 %	75 %	0 %	0 %	343126978
13	NC_015908	ATCA	2	8	4353	4360	50 %	25 %	0 %	25 %	343126979
14	NC_015908	CTAC	2	8	4797	4804	25 %	25 %	0 %	50 %	343126979
15	NC_015908	TCAT	2	8	4844	4851	25 %	50 %	0 %	25 %	343126979
16	NC_015908	AAGC	2	8	5055	5062	50 %	0 %	25 %	25 %	343126980
17	NC_015908	TACT	2	8	5153	5160	25 %	50 %	0 %	25 %	343126980
18	NC_015908	AATG	2	8	5399	5406	50 %	25 %	25 %	0 %	343126980
19	NC_015908	AGCA	2	8	6065	6072	50 %	0 %	25 %	25 %	343126982
20	NC_015908	AGTC	2	8	6529	6536	25 %	25 %	25 %	25 %	343126983
21	NC_015908	AGAA	2	8	7222	7229	75 %	0 %	25 %	0 %	343126984
22	NC_015908	CAAG	2	8	7295	7302	50 %	0 %	25 %	25 %	343126984
23	NC_015908	TAGA	2	8	7647	7654	50 %	25 %	25 %	0 %	343126984
24	NC_015908	ATTT	2	8	8497	8504	25 %	75 %	0 %	0 %	343126986
25	NC_015908	TGAG	2	8	8601	8608	25 %	25 %	50 %	0 %	343126986
26	NC_015908	CTTG	2	8	8799	8806	0 %	50 %	25 %	25 %	343126987
27	NC_015908	AATT	2	8	8945	8952	50 %	50 %	0 %	0 %	343126987
28	NC_015908	GTAA	2	8	9425	9432	50 %	25 %	25 %	0 %	343126988
29	NC_015908	TATG	2	8	9457	9464	25 %	50 %	25 %	0 %	343126988
30	NC_015908	AAAT	2	8	9487	9494	75 %	25 %	0 %	0 %	343126988
31	NC_015908	AACT	2	8	9786	9793	50 %	25 %	0 %	25 %	343126988
32	NC_015908	AGGG	2	8	9882	9889	25 %	0 %	75 %	0 %	343126988
33	NC_015908	TAAT	2	8	10946	10953	50 %	50 %	0 %	0 %	343126989
34	NC_015908	ATTC	2	8	11659	11666	25 %	50 %	0 %	25 %	343126990
35	NC_015908	TCAA	2	8	12166	12173	50 %	25 %	0 %	25 %	343126991
36	NC_015908	CAGT	2	8	12411	12418	25 %	25 %	25 %	25 %	343126991
37	NC_015908	AATT	2	8	12439	12446	50 %	50 %	0 %	0 %	343126991
38	NC_015908	TAAT	2	8	13000	13007	50 %	50 %	0 %	0 %	343126993
39	NC_015908	CAAA	2	8	13623	13630	75 %	0 %	0 %	25 %	343126993
40	NC_015908	AGAT	2	8	13679	13686	50 %	25 %	25 %	0 %	343126993
41	NC_015908	AACA	2	8	13708	13715	75 %	0 %	0 %	25 %	343126993
42	NC_015908	TATC	2	8	13890	13897	25 %	50 %	0 %	25 %	343126994
43	NC_015908	AAAC	2	8	14082	14089	75 %	0 %	0 %	25 %	343126994
44	NC_015908	ATTT	2	8	14098	14105	25 %	75 %	0 %	0 %	343126994
45	NC_015908	ATTG	2	8	14770	14777	25 %	50 %	25 %	0 %	343126995
46	NC_015908	TCAA	2	8	15722	15729	50 %	25 %	0 %	25 %	343126997
47	NC_015908	CTAT	2	8	15740	15747	25 %	50 %	0 %	25 %	343126997
48	NC_015908	TAAC	2	8	15810	15817	50 %	25 %	0 %	25 %	343126998
49	NC_015908	AAAC	2	8	16386	16393	75 %	0 %	0 %	25 %	343126999
50	NC_015908	TATT	2	8	16574	16581	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015908	ACAA	2	8	16759	16766	75 %	0 %	0 %	25 %	343127000
52	NC_015908	CAAT	2	8	17045	17052	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_015908	AGAT	2	8	17281	17288	50 %	25 %	25 %	0 %	343127001
54	NC_015908	AGAT	2	8	17335	17342	50 %	25 %	25 %	0 %	343127001
55	NC_015908	AGAT	2	8	17476	17483	50 %	25 %	25 %	0 %	343127001
56	NC_015908	ATAG	2	8	17511	17518	50 %	25 %	25 %	0 %	343127001
57	NC_015908	AACT	2	8	19889	19896	50 %	25 %	0 %	25 %	343127004
58	NC_015908	AAGA	3	12	20110	20121	75 %	0 %	25 %	0 %	343127004
59	NC_015908	GAAA	2	8	20303	20310	75 %	0 %	25 %	0 %	343127004
60	NC_015908	AGAA	2	8	20347	20354	75 %	0 %	25 %	0 %	343127004
61	NC_015908	GAAA	2	8	20502	20509	75 %	0 %	25 %	0 %	343127004
62	NC_015908	TTTA	2	8	21222	21229	25 %	75 %	0 %	0 %	343127005
63	NC_015908	ATTT	2	8	21796	21803	25 %	75 %	0 %	0 %	343127006
64	NC_015908	ATTT	2	8	21826	21833	25 %	75 %	0 %	0 %	343127006
65	NC_015908	TAAA	2	8	21985	21992	75 %	25 %	0 %	0 %	343127006
66	NC_015908	TAAA	2	8	22701	22708	75 %	25 %	0 %	0 %	343127008
67	NC_015908	TAAT	2	8	22806	22813	50 %	50 %	0 %	0 %	343127008
68	NC_015908	ATAG	2	8	22892	22899	50 %	25 %	25 %	0 %	343127008
69	NC_015908	ATAG	2	8	22925	22932	50 %	25 %	25 %	0 %	343127008
70	NC_015908	ATAG	2	8	22958	22965	50 %	25 %	25 %	0 %	343127008
71	NC_015908	ATAG	2	8	22991	22998	50 %	25 %	25 %	0 %	343127008
72	NC_015908	ATAG	2	8	23024	23031	50 %	25 %	25 %	0 %	343127008
73	NC_015908	TTAT	2	8	23355	23362	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015908	ATTA	2	8	23439	23446	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015908	TAAA	2	8	23578	23585	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015908	GATA	2	8	23913	23920	50 %	25 %	25 %	0 %	343127009
77	NC_015908	TGTT	2	8	24181	24188	0 %	75 %	25 %	0 %	343127009
78	NC_015908	GATG	2	8	24201	24208	25 %	25 %	50 %	0 %	343127009
79	NC_015908	AGAT	2	8	24911	24918	50 %	25 %	25 %	0 %	343127009
80	NC_015908	AAAG	2	8	25021	25028	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015908	TTTA	2	8	25148	25155	25 %	75 %	0 %	0 %	343127010
82	NC_015908	TAAA	2	8	25648	25655	75 %	25 %	0 %	0 %	343127011
83	NC_015908	ATTT	2	8	25663	25670	25 %	75 %	0 %	0 %	343127011
84	NC_015908	ACCA	2	8	26017	26024	50 %	0 %	0 %	50 %	343127011
85	NC_015908	TAAA	2	8	26090	26097	75 %	25 %	0 %	0 %	343127011
86	NC_015908	AAGA	2	8	26449	26456	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015908	TATT	2	8	26646	26653	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015908	AATC	2	8	27670	27677	50 %	25 %	0 %	25 %	343127012
89	NC_015908	ATGA	2	8	28393	28400	50 %	25 %	25 %	0 %	343127013
90	NC_015908	CATT	2	8	28920	28927	25 %	50 %	0 %	25 %	343127014
91	NC_015908	TAAA	2	8	29002	29009	75 %	25 %	0 %	0 %	343127014
92	NC_015908	AGTT	2	8	29029	29036	25 %	50 %	25 %	0 %	343127014
93	NC_015908	CAAA	2	8	29207	29214	75 %	0 %	0 %	25 %	343127015
94	NC_015908	AAAT	2	8	29245	29252	75 %	25 %	0 %	0 %	343127015
95	NC_015908	AATT	2	8	29296	29303	50 %	50 %	0 %	0 %	343127015
96	NC_015908	TGAT	2	8	29610	29617	25 %	50 %	25 %	0 %	343127015
97	NC_015908	AGCA	2	8	29971	29978	50 %	0 %	25 %	25 %	343127015
98	NC_015908	AAAT	2	8	29997	30004	75 %	25 %	0 %	0 %	343127015
99	NC_015908	TACA	2	8	30201	30208	50 %	25 %	0 %	25 %	343127015
100	NC_015908	TTAC	2	8	30363	30370	25 %	50 %	0 %	25 %	343127015

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.