MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Borrelia bissettii DN127 plasmid cp26

Total Repeats: 39

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015907	TCAAT	2	10	294	303	40 %	40 %	0 %	20 %	343126946
2	NC_015907	AGAAT	2	10	1077	1086	60 %	20 %	20 %	0 %	343126948
3	NC_015907	TTAAT	2	10	2193	2202	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015907	TAAAA	2	10	3665	3674	80 %	20 %	0 %	0 %	343126950
5	NC_015907	TATAA	2	10	4010	4019	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015907	TTTTA	2	10	4324	4333	20 %	80 %	0 %	0 %	343126951
7	NC_015907	AAAAT	2	10	4813	4822	80 %	20 %	0 %	0 %	343126953
8	NC_015907	ATTAG	2	10	5061	5070	40 %	40 %	20 %	0 %	343126953
9	NC_015907	GAAAA	2	10	5347	5356	80 %	0 %	20 %	0 %	343126953
10	NC_015907	TAAAA	2	10	6298	6307	80 %	20 %	0 %	0 %	343126954
11	NC_015907	AAAAT	2	10	6494	6503	80 %	20 %	0 %	0 %	343126954
12	NC_015907	AATTT	2	10	6635	6644	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015907	ACTTT	2	10	7759	7768	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_015907	TATGC	2	10	10436	10445	20 %	40 %	20 %	20 %	343126959
15	NC_015907	CCAAC	2	10	11008	11017	40 %	0 %	0 %	60 %	343126960
16	NC_015907	ACAAA	2	10	11089	11098	80 %	0 %	0 %	20 %	343126960
17	NC_015907	TTTTA	2	10	11862	11871	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015907	TAATT	2	10	12017	12026	40 %	60 %	0 %	0 %	343126961
19	NC_015907	ATTTA	2	10	13535	13544	40 %	60 %	0 %	0 %	343126961
20	NC_015907	GATTT	2	10	15559	15568	20 %	60 %	20 %	0 %	343126963
21	NC_015907	TTAAA	2	10	16364	16373	60 %	40 %	0 %	0 %	343126963
22	NC_015907	ATTAA	2	10	16680	16689	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015907	ATTTT	2	10	19305	19314	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015907	AAATT	2	10	19322	19331	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015907	TCTTT	2	10	19465	19474	0 %	80 %	0 %	20 %	343126966
26	NC_015907	TAGTA	2	10	20549	20558	40 %	40 %	20 %	0 %	343126966
27	NC_015907	TTATA	2	10	21823	21832	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015907	TTAAA	2	10	22567	22576	60 %	40 %	0 %	0 %	343126970
29	NC_015907	AAGAT	2	10	22753	22762	60 %	20 %	20 %	0 %	343126970
30	NC_015907	TTTTA	2	10	22963	22972	20 %	80 %	0 %	0 %	343126970
31	NC_015907	ATAAA	2	10	23087	23096	80 %	20 %	0 %	0 %	343126970
32	NC_015907	TAAAG	2	10	23149	23158	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015907	ATAAA	2	10	23467	23476	80 %	20 %	0 %	0 %	343126971
34	NC_015907	GATTT	2	10	23884	23893	20 %	60 %	20 %	0 %	343126971
35	NC_015907	ATTTA	2	10	24544	24553	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015907	TAAAT	2	10	24561	24570	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015907	AAATT	2	10	24615	24624	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015907	GAAGA	2	10	26138	26147	60 %	0 %	40 %	0 %	343126972
39	NC_015907	CCAAT	2	10	26456	26465	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.