MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia bissettii DN127 plasmid cp26

Total Repeats: 94

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015907	AAAT	2	8	624	631	75 %	25 %	0 %	0 %	343126947
2	NC_015907	CAAT	2	8	1003	1010	50 %	25 %	0 %	25 %	343126948
3	NC_015907	AATT	2	8	1450	1457	50 %	50 %	0 %	0 %	343126948
4	NC_015907	AATT	2	8	1690	1697	50 %	50 %	0 %	0 %	343126948
5	NC_015907	AAAT	2	8	1784	1791	75 %	25 %	0 %	0 %	343126948
6	NC_015907	TAAA	2	8	2377	2384	75 %	25 %	0 %	0 %	343126949
7	NC_015907	TTCT	2	8	2477	2484	0 %	75 %	0 %	25 %	343126950
8	NC_015907	AAAC	2	8	2569	2576	75 %	0 %	0 %	25 %	343126950
9	NC_015907	TAAT	2	8	3836	3843	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015907	TAAT	2	8	3938	3945	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015907	TAAA	2	8	4060	4067	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015907	TTAA	2	8	4391	4398	50 %	50 %	0 %	0 %	343126951
13	NC_015907	TTGC	2	8	4594	4601	0 %	50 %	25 %	25 %	343126952
14	NC_015907	AATG	2	8	4695	4702	50 %	25 %	25 %	0 %	343126952
15	NC_015907	AAGG	2	8	4757	4764	50 %	0 %	50 %	0 %	343126952
16	NC_015907	GAAA	2	8	4772	4779	75 %	0 %	25 %	0 %	343126953
17	NC_015907	ATAA	2	8	5151	5158	75 %	25 %	0 %	0 %	343126953
18	NC_015907	ATAA	2	8	5860	5867	75 %	25 %	0 %	0 %	343126953
19	NC_015907	GCTT	2	8	6241	6248	0 %	50 %	25 %	25 %	343126954
20	NC_015907	AAAT	2	8	6914	6921	75 %	25 %	0 %	0 %	343126955
21	NC_015907	ATTA	2	8	8065	8072	50 %	50 %	0 %	0 %	343126956
22	NC_015907	TACT	2	8	8113	8120	25 %	50 %	0 %	25 %	343126956
23	NC_015907	ATAA	2	8	8126	8133	75 %	25 %	0 %	0 %	343126956
24	NC_015907	AAAT	2	8	8409	8416	75 %	25 %	0 %	0 %	343126956
25	NC_015907	AAAT	2	8	8676	8683	75 %	25 %	0 %	0 %	343126956
26	NC_015907	ATAA	2	8	8873	8880	75 %	25 %	0 %	0 %	343126957
27	NC_015907	ATTT	2	8	8961	8968	25 %	75 %	0 %	0 %	343126957
28	NC_015907	AGAA	2	8	9199	9206	75 %	0 %	25 %	0 %	343126957
29	NC_015907	CAAG	2	8	9412	9419	50 %	0 %	25 %	25 %	343126958
30	NC_015907	ATAA	2	8	9532	9539	75 %	25 %	0 %	0 %	343126958
31	NC_015907	TAAA	2	8	10113	10120	75 %	25 %	0 %	0 %	343126959
32	NC_015907	GAAA	2	8	10198	10205	75 %	0 %	25 %	0 %	343126959
33	NC_015907	ATAG	2	8	10385	10392	50 %	25 %	25 %	0 %	343126959
34	NC_015907	AATT	2	8	10410	10417	50 %	50 %	0 %	0 %	343126959
35	NC_015907	AAAT	2	8	10621	10628	75 %	25 %	0 %	0 %	343126959
36	NC_015907	TACA	2	8	10680	10687	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_015907	ATTA	2	8	10911	10918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015907	AATT	2	8	10923	10930	50 %	50 %	0 %	0 %	343126960
39	NC_015907	TAAT	2	8	11106	11113	50 %	50 %	0 %	0 %	343126960
40	NC_015907	ATTA	2	8	11508	11515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015907	ATTT	2	8	11714	11721	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015907	TTTA	2	8	11722	11729	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015907	TTAT	2	8	12027	12034	25 %	75 %	0 %	0 %	343126961
44	NC_015907	GAAA	2	8	13380	13387	75 %	0 %	25 %	0 %	343126961
45	NC_015907	AATT	2	8	13592	13599	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015907	ATTA	2	8	13694	13701	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015907	TTTA	2	8	13848	13855	25 %	75 %	0 %	0 %	343126962
48	NC_015907	ATTT	2	8	13920	13927	25 %	75 %	0 %	0 %	343126962
49	NC_015907	TGCA	2	8	14657	14664	25 %	25 %	25 %	25 %	343126962
50	NC_015907	TTCA	2	8	15495	15502	25 %	50 %	0 %	25 %	343126963
51	NC_015907	AATT	2	8	16001	16008	50 %	50 %	0 %	0 %	343126963
52	NC_015907	TGGA	2	8	16077	16084	25 %	25 %	50 %	0 %	343126963
53	NC_015907	ATTT	2	8	16211	16218	25 %	75 %	0 %	0 %	343126963
54	NC_015907	AAAT	2	8	16601	16608	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015907	ATAA	2	8	16824	16831	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015907	GCTA	2	8	17424	17431	25 %	25 %	25 %	25 %	343126964
57	NC_015907	TTAA	2	8	17484	17491	50 %	50 %	0 %	0 %	343126964
58	NC_015907	AAGA	2	8	17556	17563	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015907	AATT	2	8	17607	17614	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015907	TGAA	2	8	17802	17809	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015907	AATA	2	8	17934	17941	75 %	25 %	0 %	0 %	343126965
62	NC_015907	TAAA	2	8	17942	17949	75 %	25 %	0 %	0 %	343126965
63	NC_015907	AATT	2	8	18144	18151	50 %	50 %	0 %	0 %	343126965
64	NC_015907	AATA	2	8	18223	18230	75 %	25 %	0 %	0 %	343126965
65	NC_015907	GAAA	2	8	18236	18243	75 %	0 %	25 %	0 %	343126965
66	NC_015907	AAAT	2	8	18478	18485	75 %	25 %	0 %	0 %	343126965
67	NC_015907	TAAA	2	8	18753	18760	75 %	25 %	0 %	0 %	343126965
68	NC_015907	ATTC	2	8	18994	19001	25 %	50 %	0 %	25 %	343126965
69	NC_015907	GATT	2	8	19277	19284	25 %	50 %	25 %	0 %	343126965
70	NC_015907	ATAA	2	8	19406	19413	75 %	25 %	0 %	0 %	343126966
71	NC_015907	GTAG	2	8	19793	19800	25 %	25 %	50 %	0 %	343126966
72	NC_015907	AAAT	2	8	19943	19950	75 %	25 %	0 %	0 %	343126966
73	NC_015907	CCAA	2	8	20253	20260	50 %	0 %	0 %	50 %	343126966
74	NC_015907	AATT	2	8	21155	21162	50 %	50 %	0 %	0 %	343126967
75	NC_015907	TAGA	2	8	21239	21246	50 %	25 %	25 %	0 %	343126967
76	NC_015907	TAAA	2	8	21425	21432	75 %	25 %	0 %	0 %	343126968
77	NC_015907	ACTA	2	8	21525	21532	50 %	25 %	0 %	25 %	343126968
78	NC_015907	AATT	2	8	21573	21580	50 %	50 %	0 %	0 %	343126968
79	NC_015907	AGGA	2	8	21839	21846	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015907	ATCT	2	8	22154	22161	25 %	50 %	0 %	25 %	343126969
81	NC_015907	ATTT	2	8	22339	22346	25 %	75 %	0 %	0 %	343126969
82	NC_015907	TAAA	2	8	22835	22842	75 %	25 %	0 %	0 %	343126970
83	NC_015907	CAAA	2	8	22935	22942	75 %	0 %	0 %	25 %	343126970
84	NC_015907	ATTT	2	8	23026	23033	25 %	75 %	0 %	0 %	343126970
85	NC_015907	TAAA	2	8	23159	23166	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015907	CAAA	2	8	23622	23629	75 %	0 %	0 %	25 %	343126971
87	NC_015907	TAAT	2	8	24483	24490	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015907	ATTA	2	8	24751	24758	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015907	TAAT	3	12	24762	24773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015907	TAGC	2	8	24980	24987	25 %	25 %	25 %	25 %	343126972
91	NC_015907	TACA	2	8	25156	25163	50 %	25 %	0 %	25 %	343126972
92	NC_015907	TCTT	2	8	25322	25329	0 %	75 %	0 %	25 %	343126972
93	NC_015907	AAAT	2	8	25616	25623	75 %	25 %	0 %	0 %	343126972
94	NC_015907	TACA	2	8	26247	26254	50 %	25 %	0 %	25 %	343126972

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.