MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Borrelia bissettii DN127 plasmid cp32-quad

Total Repeats: 40

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015906	GTAAAA	2	12	3329	3340	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	343126849
2	NC_015906	ATGAAA	2	12	3362	3373	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	343126849
3	NC_015906	AGTTAA	2	12	4633	4644	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	343126853
4	NC_015906	ATAATT	2	12	10615	10626	50 %	50 %	0 %	0 %	343126861
5	NC_015906	ATAATT	2	12	12212	12223	50 %	50 %	0 %	0 %	343126862
6	NC_015906	AAGTAA	2	12	14364	14375	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015906	TACTGA	2	12	15276	15287	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	343126865
8	NC_015906	TTTAAT	2	12	16233	16244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126867
9	NC_015906	AAATCA	2	12	16309	16320	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	343126867
10	NC_015906	TATCAG	2	12	18471	18482	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_015906	TTACTT	2	12	19418	19429	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_015906	ATTTAA	2	12	19480	19491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015906	ATTTGT	2	12	22041	22052	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015906	GGGTAT	2	12	23825	23836	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015906	CAAGAA	2	12	24230	24241	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_015906	GAACAA	2	12	24251	24262	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_015906	TCATTA	2	12	25152	25163	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	343126882
18	NC_015906	TTGCTT	2	12	28166	28177	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	343126887
19	NC_015906	ATTCTG	2	12	29852	29863	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	343126889
20	NC_015906	AACTTT	2	12	30204	30215	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	343126889
21	NC_015906	TTACTT	2	12	31487	31498	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_015906	ATTTGT	2	12	34581	34592	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015906	TGGCCC	2	12	39134	39145	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	343126900
24	NC_015906	TCATTA	2	12	39608	39619	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	343126901
25	NC_015906	TTCTGT	2	12	43099	43110	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	343126908
26	NC_015906	TCAATG	2	12	43174	43185	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	343126909
27	NC_015906	ATTAAG	2	12	43746	43757	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	343126909
28	NC_015906	TTTTTG	2	12	44287	44298	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015906	TCAAGT	2	12	45418	45429	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	343126913
30	NC_015906	TCAAAT	2	12	45457	45468	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	343126913
31	NC_015906	GCTTGT	2	12	45700	45711	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	343126913
32	NC_015906	TTGCTT	2	12	49666	49677	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	343126920
33	NC_015906	TAAACA	2	12	50009	50020	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	343126920
34	NC_015906	ATAAAA	2	12	51254	51265	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015906	ATAGAT	2	12	56889	56900	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	343126932
36	NC_015906	ACAAAT	2	12	58899	58910	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_015906	AAGTAA	2	12	61647	61658	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015906	ACAAGA	2	12	62137	62148	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	343126939
39	NC_015906	TACTAA	2	12	62572	62583	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	343126939
40	NC_015906	AAAGCA	2	12	64853	64864	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	343126943

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.