MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia bissettii DN127 plasmid cp32-6

Total Repeats: 364

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015905	AGA	2	6	164	169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343126802
2	NC_015905	TAT	2	6	272	277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126802
3	NC_015905	AAC	2	6	343	348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343126802
4	NC_015905	CAA	2	6	449	454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343126802
5	NC_015905	CAA	2	6	685	690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343126802
6	NC_015905	CTT	2	6	691	696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343126802
7	NC_015905	AAT	2	6	717	722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126802
8	NC_015905	TCT	2	6	744	749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343126802
9	NC_015905	AAT	2	6	855	860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126802
10	NC_015905	TTA	2	6	904	909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126802
11	NC_015905	AGG	2	6	931	936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	343126802
12	NC_015905	ATG	2	6	1024	1029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343126802
13	NC_015905	ATT	2	6	1048	1053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126802
14	NC_015905	GAA	2	6	1161	1166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343126802
15	NC_015905	AGT	2	6	1230	1235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343126802
16	NC_015905	TAA	2	6	1241	1246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126802
17	NC_015905	GAG	2	6	1248	1253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	343126802
18	NC_015905	ATT	2	6	1274	1279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126802
19	NC_015905	AGA	2	6	1326	1331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343126803
20	NC_015905	AGA	2	6	1350	1355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343126803
21	NC_015905	GCA	2	6	1356	1361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	343126803
22	NC_015905	TTC	3	9	1809	1817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343126803
23	NC_015905	TTG	2	6	1841	1846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343126803
24	NC_015905	AGA	2	6	1854	1859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343126803
25	NC_015905	CAA	2	6	2085	2090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343126804
26	NC_015905	CTA	2	6	2164	2169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343126804
27	NC_015905	GAG	2	6	2221	2226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	343126804
28	NC_015905	AAC	2	6	2249	2254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343126804
29	NC_015905	TGG	3	9	2273	2281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	343126804
30	NC_015905	GAT	2	6	2283	2288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343126804
31	NC_015905	AGA	2	6	2510	2515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343126804
32	NC_015905	GCT	2	6	2656	2661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	343126805
33	NC_015905	GAT	2	6	2740	2745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343126805
34	NC_015905	AGA	2	6	2889	2894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343126805
35	NC_015905	TAG	2	6	3027	3032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343126805
36	NC_015905	TTA	2	6	3137	3142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126805
37	NC_015905	TGG	3	9	3150	3158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	343126805
38	NC_015905	ACC	2	6	3159	3164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	343126805
39	NC_015905	ACA	2	6	3381	3386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343126806
40	NC_015905	TGG	3	9	3648	3656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	343126807
41	NC_015905	CTA	2	6	3707	3712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343126807
42	NC_015905	AAT	2	6	3727	3732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126807
43	NC_015905	TAG	2	6	3746	3751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343126807
44	NC_015905	TAA	2	6	3792	3797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126807
45	NC_015905	TAA	2	6	3940	3945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126807
46	NC_015905	ATT	2	6	3969	3974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126808
47	NC_015905	TGA	2	6	3975	3980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343126808
48	NC_015905	ATT	2	6	3983	3988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126808
49	NC_015905	TAT	2	6	4032	4037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126808
50	NC_015905	ACA	2	6	4135	4140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343126808
51	NC_015905	GGT	2	6	4188	4193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	343126808
52	NC_015905	ATT	2	6	4202	4207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126808
53	NC_015905	TAA	3	9	4287	4295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126808
54	NC_015905	AGT	2	6	4330	4335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343126808
55	NC_015905	ATT	2	6	4339	4344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126808
56	NC_015905	ACT	2	6	4434	4439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343126808
57	NC_015905	AGA	2	6	4461	4466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343126808
58	NC_015905	GTG	2	6	4475	4480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	343126808
59	NC_015905	ATG	2	6	4564	4569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343126808
60	NC_015905	GCA	3	9	4615	4623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	343126808
61	NC_015905	TAA	2	6	4686	4691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126808
62	NC_015905	AGA	2	6	4695	4700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343126808
63	NC_015905	TTA	2	6	4766	4771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126808
64	NC_015905	CTA	2	6	4880	4885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343126808
65	NC_015905	GAA	3	9	4982	4990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343126809
66	NC_015905	ATT	2	6	5256	5261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126809
67	NC_015905	AGT	2	6	5270	5275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343126809
68	NC_015905	GAA	2	6	5282	5287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343126809
69	NC_015905	GGT	2	6	5288	5293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	343126809
70	NC_015905	TGT	2	6	5490	5495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343126810
71	NC_015905	TTC	2	6	5511	5516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343126810
72	NC_015905	TTA	2	6	5564	5569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126810
73	NC_015905	TGG	2	6	5813	5818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	343126811
74	NC_015905	AGC	2	6	5853	5858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	343126811
75	NC_015905	TAG	2	6	5894	5899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343126811
76	NC_015905	AAT	2	6	5922	5927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126811
77	NC_015905	TAT	2	6	6016	6021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126811
78	NC_015905	GCA	2	6	6090	6095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	343126811
79	NC_015905	TTG	2	6	6103	6108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343126811
80	NC_015905	AAT	2	6	6230	6235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126812
81	NC_015905	ATA	2	6	6305	6310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126812
82	NC_015905	TTA	2	6	6603	6608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126812
83	NC_015905	AGG	2	6	6690	6695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	343126812
84	NC_015905	ATT	2	6	6766	6771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126813
85	NC_015905	TAA	2	6	6812	6817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126813
86	NC_015905	TGC	2	6	6821	6826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	343126813
87	NC_015905	TAA	2	6	6854	6859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126813
88	NC_015905	GAA	2	6	6972	6977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343126813
89	NC_015905	TGT	2	6	7061	7066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343126813
90	NC_015905	GAT	2	6	7086	7091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343126813
91	NC_015905	GAT	2	6	7095	7100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343126813
92	NC_015905	TAA	2	6	7127	7132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126813
93	NC_015905	AAT	2	6	7245	7250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126813
94	NC_015905	GCT	2	6	7338	7343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	343126813
95	NC_015905	TTG	2	6	7351	7356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343126813
96	NC_015905	CTT	2	6	7407	7412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343126813
97	NC_015905	AAG	2	6	7447	7452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343126813
98	NC_015905	ATT	2	6	7518	7523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126813
99	NC_015905	TAC	2	6	7772	7777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343126813
100	NC_015905	TGG	2	6	7869	7874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	343126814
101	NC_015905	CAA	2	6	7919	7924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343126814
102	NC_015905	TAG	2	6	7935	7940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343126814
103	NC_015905	TAA	2	6	7961	7966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126814
104	NC_015905	TGA	2	6	8055	8060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343126814
105	NC_015905	ATT	2	6	8137	8142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126814
106	NC_015905	GAA	2	6	8164	8169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343126814
107	NC_015905	AAG	2	6	8175	8180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343126814
108	NC_015905	TTA	2	6	8270	8275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126815
109	NC_015905	TAT	2	6	8506	8511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126815
110	NC_015905	TTG	2	6	8522	8527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343126815
111	NC_015905	AAT	2	6	8529	8534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126815
112	NC_015905	AAT	2	6	8614	8619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126815
113	NC_015905	TCA	2	6	8689	8694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343126815
114	NC_015905	ATT	2	6	8827	8832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126816
115	NC_015905	ATG	2	6	8884	8889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343126816
116	NC_015905	TGC	2	6	9015	9020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	343126817
117	NC_015905	AGC	2	6	9348	9353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	343126817
118	NC_015905	TTG	2	6	9371	9376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343126817
119	NC_015905	GAA	3	9	9568	9576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343126817
120	NC_015905	AGA	2	6	9630	9635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343126817
121	NC_015905	GCA	2	6	9769	9774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	343126817
122	NC_015905	TGA	2	6	9780	9785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343126817
123	NC_015905	CTG	2	6	10034	10039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	343126817
124	NC_015905	ATA	2	6	10109	10114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126817
125	NC_015905	AAG	2	6	10115	10120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343126817
126	NC_015905	TAT	2	6	10155	10160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126817
127	NC_015905	AAT	2	6	10313	10318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126818
128	NC_015905	AAC	2	6	10372	10377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343126818
129	NC_015905	GTT	2	6	10515	10520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343126818
130	NC_015905	ATT	2	6	10539	10544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126818
131	NC_015905	AAT	2	6	10579	10584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126818
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.