MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Borrelia bissettii DN127 plasmid cp32-4

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015904	CTGATA	2	12	2984	2995	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	343126762
2	NC_015904	ACAAGC	2	12	4965	4976	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	343126765
3	NC_015904	GAATTT	2	12	5206	5217	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	343126765
4	NC_015904	TGAACT	2	12	5244	5255	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	343126765
5	NC_015904	AATGGA	2	12	6896	6907	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	343126769
6	NC_015904	CCCCTA	2	12	10166	10177	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	343126773
7	NC_015904	ACCTAA	2	12	10182	10193	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	343126773
8	NC_015904	AATCAA	2	12	10204	10215	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	343126773
9	NC_015904	CTTAAT	2	12	13117	13128	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	343126778
10	NC_015904	CATTGA	2	12	13689	13700	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	343126778
11	NC_015904	ACAGAA	2	12	13764	13775	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	343126779
12	NC_015904	AGTTAA	2	12	16268	16279	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	343126784
13	NC_015904	AATTTA	2	12	16847	16858	50 %	50 %	0 %	0 %	343126785
14	NC_015904	TAATGA	2	12	17269	17280	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	343126786
15	NC_015904	AAACAA	2	12	23152	23163	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	343126793
16	NC_015904	AAAGAA	2	12	27127	27138	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	343126797
17	NC_015904	CTAAAG	2	12	27170	27181	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	343126797
18	NC_015904	AGAAAA	2	12	27183	27194	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	343126797
19	NC_015904	AAGAGA	2	12	27195	27206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343126797
20	NC_015904	GAAAGA	3	18	27232	27249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343126797
21	NC_015904	AAAGCA	2	12	29140	29151	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	343126799

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.