MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Borrelia bissettii DN127 plasmid cp32-4

Total Repeats: 36

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015904	ATTAA	2	10	1780	1789	60 %	40 %	0 %	0 %	343126760
2	NC_015904	AATTA	2	10	2566	2575	60 %	40 %	0 %	0 %	343126761
3	NC_015904	AAGAG	2	10	3406	3415	60 %	0 %	40 %	0 %	343126763
4	NC_015904	GCAAA	2	10	3870	3879	60 %	0 %	20 %	20 %	343126763
5	NC_015904	TTTTG	2	10	4859	4868	0 %	80 %	20 %	0 %	343126764
6	NC_015904	GAAAA	2	10	6921	6930	80 %	0 %	20 %	0 %	343126769
7	NC_015904	AAAAC	2	10	8309	8318	80 %	0 %	0 %	20 %	343126771
8	NC_015904	AAGAA	2	10	9246	9255	80 %	0 %	20 %	0 %	343126773
9	NC_015904	CAAAA	2	10	9483	9492	80 %	0 %	0 %	20 %	343126773
10	NC_015904	GAAAA	2	10	10342	10351	80 %	0 %	20 %	0 %	343126774
11	NC_015904	GAAAG	2	10	10378	10387	60 %	0 %	40 %	0 %	343126774
12	NC_015904	AATCT	2	10	12252	12261	40 %	40 %	0 %	20 %	343126776
13	NC_015904	AACTT	2	10	12726	12735	40 %	40 %	0 %	20 %	343126777
14	NC_015904	GAAAA	2	10	13362	13371	80 %	0 %	20 %	0 %	343126778
15	NC_015904	AAAGT	2	10	13384	13393	60 %	20 %	20 %	0 %	343126778
16	NC_015904	AGAAA	2	10	14150	14159	80 %	0 %	20 %	0 %	343126779
17	NC_015904	ATTAA	2	10	15229	15238	60 %	40 %	0 %	0 %	343126781
18	NC_015904	AGTAA	2	10	15866	15875	60 %	20 %	20 %	0 %	343126783
19	NC_015904	TTGTT	2	10	16120	16129	0 %	80 %	20 %	0 %	343126784
20	NC_015904	TATGT	2	10	16230	16239	20 %	60 %	20 %	0 %	343126784
21	NC_015904	TAATA	2	10	17654	17663	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015904	TTAAA	2	10	18906	18915	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015904	TTAAT	2	10	18952	18961	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015904	ATTAT	2	10	19026	19035	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015904	ATTGA	2	10	20897	20906	40 %	40 %	20 %	0 %	343126790
26	NC_015904	ATATA	2	10	22108	22117	60 %	40 %	0 %	0 %	343126792
27	NC_015904	TTTTA	2	10	22750	22759	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015904	TCAAT	2	10	22794	22803	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_015904	GAGTT	2	10	24081	24090	20 %	40 %	40 %	0 %	343126793
30	NC_015904	AATAA	2	10	24524	24533	80 %	20 %	0 %	0 %	343126794
31	NC_015904	AATTT	2	10	25955	25964	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015904	GCGTT	2	10	26118	26127	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_015904	TTGTT	2	10	26182	26191	0 %	80 %	20 %	0 %	343126796
34	NC_015904	AAGAA	2	10	26353	26362	80 %	0 %	20 %	0 %	343126796
35	NC_015904	AGATA	2	10	27300	27309	60 %	20 %	20 %	0 %	343126797
36	NC_015904	TTACA	2	10	30361	30370	40 %	40 %	0 %	20 %	343126800

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.