MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia bissettii DN127 plasmid cp32-4

Total Repeats: 107

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015904	ATTT	3	12	573	584	25 %	75 %	0 %	0 %	343126759
2	NC_015904	ACAA	2	8	768	775	75 %	0 %	0 %	25 %	343126759
3	NC_015904	ATTA	2	8	944	951	50 %	50 %	0 %	0 %	343126759
4	NC_015904	AATT	2	8	1893	1900	50 %	50 %	0 %	0 %	343126760
5	NC_015904	ATAC	2	8	1928	1935	50 %	25 %	0 %	25 %	343126760
6	NC_015904	AAAG	2	8	2378	2385	75 %	0 %	25 %	0 %	343126761
7	NC_015904	TTTA	2	8	2516	2523	25 %	75 %	0 %	0 %	343126761
8	NC_015904	GCAA	2	8	2676	2683	50 %	0 %	25 %	25 %	343126762
9	NC_015904	ATGT	2	8	3014	3021	25 %	50 %	25 %	0 %	343126762
10	NC_015904	GTAT	2	8	3039	3046	25 %	50 %	25 %	0 %	343126762
11	NC_015904	ATAA	2	8	3121	3128	75 %	25 %	0 %	0 %	343126762
12	NC_015904	CAAT	2	8	3203	3210	50 %	25 %	0 %	25 %	343126762
13	NC_015904	TAAA	2	8	3365	3372	75 %	25 %	0 %	0 %	343126763
14	NC_015904	TTTA	2	8	3892	3899	25 %	75 %	0 %	0 %	343126763
15	NC_015904	ATCA	2	8	4353	4360	50 %	25 %	0 %	25 %	343126764
16	NC_015904	CTAC	2	8	4797	4804	25 %	25 %	0 %	50 %	343126764
17	NC_015904	TCAT	2	8	4844	4851	25 %	50 %	0 %	25 %	343126764
18	NC_015904	TAAG	2	8	5054	5061	50 %	25 %	25 %	0 %	343126765
19	NC_015904	TACT	2	8	5153	5160	25 %	50 %	0 %	25 %	343126765
20	NC_015904	AATG	2	8	5399	5406	50 %	25 %	25 %	0 %	343126765
21	NC_015904	AGCA	2	8	6065	6072	50 %	0 %	25 %	25 %	343126767
22	NC_015904	AGTC	2	8	6529	6536	25 %	25 %	25 %	25 %	343126768
23	NC_015904	AGAA	2	8	7222	7229	75 %	0 %	25 %	0 %	343126769
24	NC_015904	CAAG	2	8	7295	7302	50 %	0 %	25 %	25 %	343126769
25	NC_015904	TAGA	2	8	7647	7654	50 %	25 %	25 %	0 %	343126769
26	NC_015904	ATTT	2	8	8496	8503	25 %	75 %	0 %	0 %	343126771
27	NC_015904	CTTG	2	8	8798	8805	0 %	50 %	25 %	25 %	343126772
28	NC_015904	AATA	2	8	8820	8827	75 %	25 %	0 %	0 %	343126772
29	NC_015904	AATT	2	8	8944	8951	50 %	50 %	0 %	0 %	343126772
30	NC_015904	CAAG	2	8	9613	9620	50 %	0 %	25 %	25 %	343126773
31	NC_015904	TTGG	2	8	10129	10136	0 %	50 %	50 %	0 %	343126773
32	NC_015904	CTTT	2	8	10693	10700	0 %	75 %	0 %	25 %	343126774
33	NC_015904	AGTT	2	8	10887	10894	25 %	50 %	25 %	0 %	343126774
34	NC_015904	GGCA	2	8	11250	11257	25 %	0 %	50 %	25 %	343126775
35	NC_015904	GGCA	2	8	11358	11365	25 %	0 %	50 %	25 %	343126775
36	NC_015904	GAAT	2	8	11908	11915	50 %	25 %	25 %	0 %	343126776
37	NC_015904	GAAT	2	8	11935	11942	50 %	25 %	25 %	0 %	343126776
38	NC_015904	TCAA	2	8	12158	12165	50 %	25 %	0 %	25 %	343126776
39	NC_015904	ATCC	2	8	12379	12386	25 %	25 %	0 %	50 %	343126776
40	NC_015904	AATT	2	8	12437	12444	50 %	50 %	0 %	0 %	343126776
41	NC_015904	GTTT	2	8	12457	12464	0 %	75 %	25 %	0 %	343126776
42	NC_015904	TAAT	2	8	12998	13005	50 %	50 %	0 %	0 %	343126778
43	NC_015904	AGAT	2	8	13677	13684	50 %	25 %	25 %	0 %	343126778
44	NC_015904	AACA	2	8	13706	13713	75 %	0 %	0 %	25 %	343126778
45	NC_015904	TATC	2	8	13888	13895	25 %	50 %	0 %	25 %	343126779
46	NC_015904	AAAC	2	8	14080	14087	75 %	0 %	0 %	25 %	343126779
47	NC_015904	ATTT	2	8	14096	14103	25 %	75 %	0 %	0 %	343126779
48	NC_015904	GAAT	2	8	14630	14637	50 %	25 %	25 %	0 %	343126780
49	NC_015904	TACA	2	8	15014	15021	50 %	25 %	0 %	25 %	343126780
50	NC_015904	TCAA	2	8	15722	15729	50 %	25 %	0 %	25 %	343126782
51	NC_015904	CTAT	2	8	15740	15747	25 %	50 %	0 %	25 %	343126782
52	NC_015904	TAAC	2	8	15810	15817	50 %	25 %	0 %	25 %	343126783
53	NC_015904	AAAC	2	8	16386	16393	75 %	0 %	0 %	25 %	343126784
54	NC_015904	CAAT	2	8	16504	16511	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_015904	AGAT	2	8	16827	16834	50 %	25 %	25 %	0 %	343126785
56	NC_015904	GAAA	2	8	17539	17546	75 %	0 %	25 %	0 %	343126786
57	NC_015904	ATAA	2	8	17609	17616	75 %	25 %	0 %	0 %	343126786
58	NC_015904	TCTT	2	8	17718	17725	0 %	75 %	0 %	25 %	343126787
59	NC_015904	AACA	2	8	19113	19120	75 %	0 %	0 %	25 %	343126788
60	NC_015904	AACT	2	8	19304	19311	50 %	25 %	0 %	25 %	343126788
61	NC_015904	AAGA	3	12	19525	19536	75 %	0 %	25 %	0 %	343126788
62	NC_015904	AGAA	2	8	19762	19769	75 %	0 %	25 %	0 %	343126788
63	NC_015904	AAAT	2	8	19804	19811	75 %	25 %	0 %	0 %	343126788
64	NC_015904	GAAA	2	8	19917	19924	75 %	0 %	25 %	0 %	343126788
65	NC_015904	AAAT	2	8	20491	20498	75 %	25 %	0 %	0 %	343126789
66	NC_015904	TTTA	2	8	20636	20643	25 %	75 %	0 %	0 %	343126789
67	NC_015904	AATA	2	8	20968	20975	75 %	25 %	0 %	0 %	343126790
68	NC_015904	AATG	2	8	21220	21227	50 %	25 %	25 %	0 %	343126790
69	NC_015904	AGAA	2	8	21251	21258	75 %	0 %	25 %	0 %	343126790
70	NC_015904	TGAT	2	8	21714	21721	25 %	50 %	25 %	0 %	343126791
71	NC_015904	AGAT	2	8	22341	22348	50 %	25 %	25 %	0 %	343126792
72	NC_015904	AGAT	2	8	22362	22369	50 %	25 %	25 %	0 %	343126792
73	NC_015904	AGAT	2	8	22395	22402	50 %	25 %	25 %	0 %	343126792
74	NC_015904	ATAG	2	8	22472	22479	50 %	25 %	25 %	0 %	343126792
75	NC_015904	ATAG	2	8	22505	22512	50 %	25 %	25 %	0 %	343126792
76	NC_015904	TATT	2	8	22898	22905	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015904	GAAA	2	8	23289	23296	75 %	0 %	25 %	0 %	343126793
78	NC_015904	GATA	2	8	23372	23379	50 %	25 %	25 %	0 %	343126793
79	NC_015904	AATA	2	8	23579	23586	75 %	25 %	0 %	0 %	343126793
80	NC_015904	GATG	2	8	23660	23667	25 %	25 %	50 %	0 %	343126793
81	NC_015904	AGAA	2	8	24201	24208	75 %	0 %	25 %	0 %	343126793
82	NC_015904	AGAT	2	8	24373	24380	50 %	25 %	25 %	0 %	343126793
83	NC_015904	AAAG	2	8	24483	24490	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015904	ATAA	2	8	25097	25104	75 %	25 %	0 %	0 %	343126795
85	NC_015904	TTTA	2	8	25126	25133	25 %	75 %	0 %	0 %	343126795
86	NC_015904	ACCA	2	8	25479	25486	50 %	0 %	0 %	50 %	343126795
87	NC_015904	AATT	2	8	25528	25535	50 %	50 %	0 %	0 %	343126795
88	NC_015904	TGCA	2	8	25843	25850	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_015904	GTGG	2	8	25867	25874	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015904	AAGA	2	8	25911	25918	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015904	TATT	2	8	26108	26115	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015904	AAGA	2	8	27091	27098	75 %	0 %	25 %	0 %	343126797
93	NC_015904	AAGA	2	8	27230	27237	75 %	0 %	25 %	0 %	343126797
94	NC_015904	ATAA	2	8	27730	27737	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015904	TTTA	2	8	27878	27885	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015904	AATA	2	8	28492	28499	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015904	GCAT	2	8	28939	28946	25 %	25 %	25 %	25 %	343126799
98	NC_015904	TAAA	2	8	28984	28991	75 %	25 %	0 %	0 %	343126799
99	NC_015904	CAAA	2	8	29189	29196	75 %	0 %	0 %	25 %	343126800
100	NC_015904	AAAT	2	8	29227	29234	75 %	25 %	0 %	0 %	343126800
101	NC_015904	AATT	2	8	29278	29285	50 %	50 %	0 %	0 %	343126800
102	NC_015904	TAGC	2	8	29385	29392	25 %	25 %	25 %	25 %	343126800
103	NC_015904	TGAT	2	8	29592	29599	25 %	50 %	25 %	0 %	343126800
104	NC_015904	AGCA	2	8	29953	29960	50 %	0 %	25 %	25 %	343126800
105	NC_015904	AAAT	2	8	29979	29986	75 %	25 %	0 %	0 %	343126800
106	NC_015904	TACA	2	8	30183	30190	50 %	25 %	0 %	25 %	343126800
107	NC_015904	TTAC	2	8	30345	30352	25 %	50 %	0 %	25 %	343126800

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.