MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia bissettii DN127 plasmid cp32-4

Total Repeats: 396

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015904	AGA	2	6	164	169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343126759
2	NC_015904	TAT	2	6	272	277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126759
3	NC_015904	AAC	2	6	343	348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343126759
4	NC_015904	CAA	2	6	449	454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343126759
5	NC_015904	CAA	2	6	685	690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343126759
6	NC_015904	CTT	2	6	691	696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343126759
7	NC_015904	AAT	2	6	717	722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126759
8	NC_015904	TCT	2	6	744	749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343126759
9	NC_015904	AAT	2	6	855	860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126759
10	NC_015904	TTA	2	6	904	909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126759
11	NC_015904	AGG	2	6	931	936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	343126759
12	NC_015904	ATG	2	6	1024	1029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343126759
13	NC_015904	ATT	2	6	1048	1053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126759
14	NC_015904	GAA	2	6	1161	1166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343126759
15	NC_015904	AGT	2	6	1230	1235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343126759
16	NC_015904	TAA	2	6	1241	1246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126759
17	NC_015904	GAG	2	6	1248	1253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	343126759
18	NC_015904	ATT	2	6	1274	1279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126759
19	NC_015904	AGA	2	6	1317	1322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343126760
20	NC_015904	AGC	2	6	1355	1360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	343126760
21	NC_015904	TTC	3	9	1809	1817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343126760
22	NC_015904	TTG	2	6	1841	1846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343126760
23	NC_015904	AGA	2	6	1854	1859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343126760
24	NC_015904	CAA	2	6	2085	2090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343126761
25	NC_015904	GCT	2	6	2099	2104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	343126761
26	NC_015904	TGG	2	6	2153	2158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	343126761
27	NC_015904	CTA	2	6	2164	2169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343126761
28	NC_015904	GAG	2	6	2221	2226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	343126761
29	NC_015904	AAC	2	6	2249	2254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343126761
30	NC_015904	TGG	3	9	2273	2281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	343126761
31	NC_015904	GAT	2	6	2283	2288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343126761
32	NC_015904	AGA	2	6	2510	2515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343126761
33	NC_015904	GAT	2	6	2740	2745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343126762
34	NC_015904	AGA	2	6	2889	2894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343126762
35	NC_015904	TTA	2	6	3137	3142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126762
36	NC_015904	CCA	2	6	3160	3165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	343126762
37	NC_015904	TAG	2	6	3530	3535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343126763
38	NC_015904	ATC	2	6	3553	3558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343126763
39	NC_015904	TGG	3	9	3650	3658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	343126763
40	NC_015904	CTA	2	6	3709	3714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343126763
41	NC_015904	AAT	2	6	3729	3734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126763
42	NC_015904	TAG	2	6	3748	3753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343126763
43	NC_015904	TAA	2	6	3794	3799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126763
44	NC_015904	TAA	2	6	3942	3947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126763
45	NC_015904	ATT	2	6	3971	3976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126764
46	NC_015904	TGA	2	6	3977	3982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343126764
47	NC_015904	ATT	2	6	3985	3990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126764
48	NC_015904	TAT	2	6	4034	4039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126764
49	NC_015904	ACA	2	6	4137	4142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343126764
50	NC_015904	GGT	2	6	4190	4195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	343126764
51	NC_015904	ATT	2	6	4204	4209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126764
52	NC_015904	TAA	3	9	4289	4297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126764
53	NC_015904	AGT	2	6	4332	4337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343126764
54	NC_015904	ATT	2	6	4341	4346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126764
55	NC_015904	ACT	2	6	4436	4441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343126764
56	NC_015904	AGA	2	6	4463	4468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343126764
57	NC_015904	GTG	2	6	4477	4482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	343126764
58	NC_015904	ATG	2	6	4566	4571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343126764
59	NC_015904	GCA	3	9	4617	4625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	343126764
60	NC_015904	TAA	2	6	4688	4693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126764
61	NC_015904	AGA	2	6	4697	4702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343126764
62	NC_015904	TTA	2	6	4768	4773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126764
63	NC_015904	CTA	2	6	4882	4887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343126764
64	NC_015904	GAA	3	9	4984	4992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343126765
65	NC_015904	GTT	2	6	5197	5202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343126765
66	NC_015904	ATT	2	6	5258	5263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126765
67	NC_015904	GAA	2	6	5284	5289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343126765
68	NC_015904	GGT	2	6	5290	5295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	343126765
69	NC_015904	TGT	2	6	5492	5497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343126766
70	NC_015904	TTC	2	6	5513	5518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343126766
71	NC_015904	TTA	2	6	5566	5571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126766
72	NC_015904	TGG	2	6	5815	5820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	343126767
73	NC_015904	AGC	2	6	5855	5860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	343126767
74	NC_015904	TAG	2	6	5896	5901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343126767
75	NC_015904	AAT	2	6	5924	5929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126767
76	NC_015904	TAT	2	6	6018	6023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126767
77	NC_015904	GCA	2	6	6092	6097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	343126767
78	NC_015904	TTG	2	6	6105	6110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343126767
79	NC_015904	AAT	2	6	6232	6237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126768
80	NC_015904	GCT	2	6	6292	6297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	343126768
81	NC_015904	ATA	2	6	6307	6312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126768
82	NC_015904	TTA	2	6	6605	6610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126768
83	NC_015904	AGG	2	6	6692	6697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	343126768
84	NC_015904	ATT	2	6	6768	6773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126769
85	NC_015904	TAA	2	6	6814	6819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126769
86	NC_015904	GCC	2	6	6824	6829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	343126769
87	NC_015904	TAA	2	6	6856	6861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126769
88	NC_015904	GAA	2	6	6974	6979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343126769
89	NC_015904	TGT	2	6	7063	7068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343126769
90	NC_015904	GAT	2	6	7097	7102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343126769
91	NC_015904	TAA	2	6	7129	7134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126769
92	NC_015904	AAT	2	6	7247	7252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126769
93	NC_015904	GCT	2	6	7340	7345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	343126769
94	NC_015904	TTG	2	6	7353	7358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343126769
95	NC_015904	CTT	2	6	7409	7414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343126769
96	NC_015904	AAG	2	6	7449	7454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343126769
97	NC_015904	ATT	2	6	7520	7525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126769
98	NC_015904	TAA	2	6	7659	7664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126769
99	NC_015904	TAC	2	6	7774	7779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343126769
100	NC_015904	TGG	2	6	7871	7876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	343126770
101	NC_015904	CAA	2	6	7921	7926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343126770
102	NC_015904	TAA	2	6	7963	7968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126770
103	NC_015904	TGA	2	6	8057	8062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343126770
104	NC_015904	ACA	2	6	8071	8076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343126770
105	NC_015904	CTA	2	6	8131	8136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343126770
106	NC_015904	ATT	2	6	8139	8144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126770
107	NC_015904	AAG	2	6	8177	8182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343126770
108	NC_015904	CTG	2	6	8188	8193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	343126770
109	NC_015904	ACA	2	6	8251	8256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343126770
110	NC_015904	TTA	2	6	8505	8510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126771
111	NC_015904	TTG	2	6	8522	8527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343126771
112	NC_015904	AAT	2	6	8529	8534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126771
113	NC_015904	AAT	2	6	8614	8619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126771
114	NC_015904	ATC	2	6	8688	8693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343126771
115	NC_015904	TGC	2	6	9015	9020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	343126773
116	NC_015904	GTA	2	6	9092	9097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343126773
117	NC_015904	AGA	2	6	9262	9267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343126773
118	NC_015904	AGC	2	6	9348	9353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	343126773
119	NC_015904	TTG	2	6	9371	9376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343126773
120	NC_015904	GGA	2	6	9436	9441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	343126773
121	NC_015904	GAA	2	6	9472	9477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343126773
122	NC_015904	AGA	2	6	9597	9602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343126773
123	NC_015904	GTG	2	6	9710	9715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	343126773
124	NC_015904	ACT	2	6	9786	9791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343126773
125	NC_015904	AGA	2	6	9822	9827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343126773
126	NC_015904	GAT	2	6	9885	9890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343126773
127	NC_015904	CTG	2	6	9941	9946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	343126773
128	NC_015904	ACT	2	6	10000	10005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343126773
129	NC_015904	GTT	2	6	10078	10083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343126773
130	NC_015904	ATT	2	6	10139	10144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126773
131	NC_015904	GAA	2	6	10147	10152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343126773
132	NC_015904	AAT	3	9	10330	10338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126774
133	NC_015904	AAT	2	6	10407	10412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126774
134	NC_015904	TAA	2	6	10421	10426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126774
135	NC_015904	TAT	2	6	10591	10596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126774
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137	NC_015904	TGA	2	6	10875	10880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343126774
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140	NC_015904	CGA	2	6	11172	11177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	343126775
141	NC_015904	TTA	2	6	11323	11328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126775
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153	NC_015904	TAA	2	6	12538	12543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126777
154	NC_015904	TTG	2	6	12555	12560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343126777
155	NC_015904	GAA	2	6	12569	12574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343126777
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158	NC_015904	TAA	2	6	12741	12746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126777
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165	NC_015904	GGT	2	6	13039	13044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	343126778
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255	NC_015904	ATA	2	6	20109	20114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126788
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382	NC_015904	TAT	2	6	29755	29760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126800
383	NC_015904	ATC	2	6	29778	29783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343126800
384	NC_015904	ATA	2	6	29814	29819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126800
385	NC_015904	CAT	2	6	29916	29921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343126800
386	NC_015904	TGA	2	6	30085	30090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343126800
387	NC_015904	TAT	2	6	30095	30100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126800
388	NC_015904	TGG	2	6	30226	30231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	343126800
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390	NC_015904	AAC	2	6	30325	30330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343126800
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.