MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Borrelia bissettii DN127 plasmid cp32-11

Total Repeats: 83

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015903	ATTT	3	12	573	584	25 %	75 %	0 %	0 %	343126712
2	NC_015903	ACAA	2	8	768	775	75 %	0 %	0 %	25 %	343126712
3	NC_015903	AATT	2	8	1893	1900	50 %	50 %	0 %	0 %	343126713
4	NC_015903	ATAC	2	8	1928	1935	50 %	25 %	0 %	25 %	343126713
5	NC_015903	AAAG	2	8	2378	2385	75 %	0 %	25 %	0 %	343126714
6	NC_015903	TTTA	2	8	2516	2523	25 %	75 %	0 %	0 %	343126714
7	NC_015903	GCAA	2	8	2676	2683	50 %	0 %	25 %	25 %	343126715
8	NC_015903	ATGT	2	8	3014	3021	25 %	50 %	25 %	0 %	343126715
9	NC_015903	GTAT	2	8	3039	3046	25 %	50 %	25 %	0 %	343126715
10	NC_015903	ATAA	2	8	3121	3128	75 %	25 %	0 %	0 %	343126715
11	NC_015903	CAAT	2	8	3203	3210	50 %	25 %	0 %	25 %	343126715
12	NC_015903	TAAA	2	8	3365	3372	75 %	25 %	0 %	0 %	343126716
13	NC_015903	TTTA	2	8	3892	3899	25 %	75 %	0 %	0 %	343126716
14	NC_015903	ATCA	2	8	4353	4360	50 %	25 %	0 %	25 %	343126717
15	NC_015903	AGTA	2	8	4785	4792	50 %	25 %	25 %	0 %	343126717
16	NC_015903	CTAC	2	8	4797	4804	25 %	25 %	0 %	50 %	343126717
17	NC_015903	TCAT	2	8	4844	4851	25 %	50 %	0 %	25 %	343126717
18	NC_015903	AATG	2	8	5399	5406	50 %	25 %	25 %	0 %	343126718
19	NC_015903	AGCA	2	8	6065	6072	50 %	0 %	25 %	25 %	343126720
20	NC_015903	AGTC	2	8	6529	6536	25 %	25 %	25 %	25 %	343126721
21	NC_015903	AGAA	2	8	7222	7229	75 %	0 %	25 %	0 %	343126722
22	NC_015903	CAAG	2	8	7295	7302	50 %	0 %	25 %	25 %	343126722
23	NC_015903	CCCA	2	8	8242	8249	25 %	0 %	0 %	75 %	343126723
24	NC_015903	ATTT	2	8	8498	8505	25 %	75 %	0 %	0 %	343126724
25	NC_015903	CTTG	2	8	8800	8807	0 %	50 %	25 %	25 %	343126725
26	NC_015903	TAAT	2	8	10561	10568	50 %	50 %	0 %	0 %	343126726
27	NC_015903	TGTT	2	8	10570	10577	0 %	75 %	25 %	0 %	343126726
28	NC_015903	TTGG	2	8	10607	10614	0 %	50 %	50 %	0 %	343126726
29	NC_015903	TTGA	2	8	10622	10629	25 %	50 %	25 %	0 %	343126726
30	NC_015903	AGAA	2	8	10736	10743	75 %	0 %	25 %	0 %	343126727
31	NC_015903	GGCA	2	8	11607	11614	25 %	0 %	50 %	25 %	343126728
32	NC_015903	ACAA	2	8	11954	11961	75 %	0 %	0 %	25 %	343126728
33	NC_015903	TCAA	2	8	12514	12521	50 %	25 %	0 %	25 %	343126729
34	NC_015903	AATT	2	8	12778	12785	50 %	50 %	0 %	0 %	343126729
35	NC_015903	GTTT	2	8	12798	12805	0 %	75 %	25 %	0 %	343126729
36	NC_015903	TAAT	2	8	13339	13346	50 %	50 %	0 %	0 %	343126731
37	NC_015903	CAAA	2	8	13962	13969	75 %	0 %	0 %	25 %	343126731
38	NC_015903	AGAT	2	8	14018	14025	50 %	25 %	25 %	0 %	343126731
39	NC_015903	AACA	2	8	14047	14054	75 %	0 %	0 %	25 %	343126731
40	NC_015903	TATC	2	8	14229	14236	25 %	50 %	0 %	25 %	343126732
41	NC_015903	AAAC	2	8	14421	14428	75 %	0 %	0 %	25 %	343126732
42	NC_015903	ATTT	2	8	14437	14444	25 %	75 %	0 %	0 %	343126732
43	NC_015903	ATTG	2	8	15109	15116	25 %	50 %	25 %	0 %	343126733
44	NC_015903	ATCA	2	8	15994	16001	50 %	25 %	0 %	25 %	343126735
45	NC_015903	TCAA	2	8	16061	16068	50 %	25 %	0 %	25 %	343126735
46	NC_015903	CTAT	2	8	16079	16086	25 %	50 %	0 %	25 %	343126735
47	NC_015903	TAAC	2	8	16149	16156	50 %	25 %	0 %	25 %	343126736
48	NC_015903	AAAC	2	8	16725	16732	75 %	0 %	0 %	25 %	343126737
49	NC_015903	AGAT	2	8	17133	17140	50 %	25 %	25 %	0 %	343126738
50	NC_015903	ATAG	2	8	17288	17295	50 %	25 %	25 %	0 %	343126738
51	NC_015903	CAAA	2	8	17981	17988	75 %	0 %	0 %	25 %	343126739
52	NC_015903	AGAA	2	8	20119	20126	75 %	0 %	25 %	0 %	343126742
53	NC_015903	GAAA	2	8	20274	20281	75 %	0 %	25 %	0 %	343126742
54	NC_015903	AACA	2	8	20970	20977	75 %	0 %	0 %	25 %	343126743
55	NC_015903	TTTA	2	8	20994	21001	25 %	75 %	0 %	0 %	343126743
56	NC_015903	AAAT	2	8	21587	21594	75 %	25 %	0 %	0 %	343126744
57	NC_015903	TAGC	2	8	21733	21740	25 %	25 %	25 %	25 %	343126744
58	NC_015903	AAAG	2	8	22243	22250	75 %	0 %	25 %	0 %	343126745
59	NC_015903	AAAG	2	8	22312	22319	75 %	0 %	25 %	0 %	343126745
60	NC_015903	ATAG	2	8	22642	22649	50 %	25 %	25 %	0 %	343126746
61	NC_015903	CAAA	2	8	23457	23464	75 %	0 %	0 %	25 %	343126747
62	NC_015903	GAAA	2	8	23595	23602	75 %	0 %	25 %	0 %	343126747
63	NC_015903	GATA	2	8	23678	23685	50 %	25 %	25 %	0 %	343126747
64	NC_015903	TGTT	2	8	23946	23953	0 %	75 %	25 %	0 %	343126747
65	NC_015903	TGGT	2	8	23968	23975	0 %	50 %	50 %	0 %	343126747
66	NC_015903	AGAT	2	8	24676	24683	50 %	25 %	25 %	0 %	343126747
67	NC_015903	ATAA	2	8	25400	25407	75 %	25 %	0 %	0 %	343126749
68	NC_015903	ACCA	2	8	25782	25789	50 %	0 %	0 %	50 %	343126749
69	NC_015903	GTTT	2	8	25802	25809	0 %	75 %	25 %	0 %	343126749
70	NC_015903	ATAA	2	8	27494	27501	75 %	25 %	0 %	0 %	343126753
71	NC_015903	TTCA	2	8	27603	27610	25 %	50 %	0 %	25 %	343126753
72	NC_015903	GCAT	2	8	28703	28710	25 %	25 %	25 %	25 %	343126755
73	NC_015903	TAAA	2	8	28748	28755	75 %	25 %	0 %	0 %	343126755
74	NC_015903	CAAG	2	8	28773	28780	50 %	0 %	25 %	25 %	343126755
75	NC_015903	CAAA	2	8	28953	28960	75 %	0 %	0 %	25 %	343126756
76	NC_015903	AAAT	2	8	28991	28998	75 %	25 %	0 %	0 %	343126756
77	NC_015903	AATT	2	8	29042	29049	50 %	50 %	0 %	0 %	343126756
78	NC_015903	TAGC	2	8	29149	29156	25 %	25 %	25 %	25 %	343126756
79	NC_015903	TGAT	2	8	29356	29363	25 %	50 %	25 %	0 %	343126756
80	NC_015903	AGCA	2	8	29717	29724	50 %	0 %	25 %	25 %	343126756
81	NC_015903	AAAT	2	8	29743	29750	75 %	25 %	0 %	0 %	343126756
82	NC_015903	TACA	2	8	29948	29955	50 %	25 %	0 %	25 %	343126757
83	NC_015903	TTAC	2	8	30110	30117	25 %	50 %	0 %	25 %	343126757

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.