MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia bissettii DN127 plasmid cp32-11

Total Repeats: 388

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015903	AGA	2	6	164	169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343126712
2	NC_015903	TAT	2	6	272	277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126712
3	NC_015903	AAC	2	6	343	348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343126712
4	NC_015903	CAA	2	6	449	454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343126712
5	NC_015903	TTA	2	6	499	504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126712
6	NC_015903	CAA	2	6	685	690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343126712
7	NC_015903	CTT	2	6	691	696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343126712
8	NC_015903	AAT	2	6	717	722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126712
9	NC_015903	TCT	2	6	744	749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343126712
10	NC_015903	ATA	2	6	778	783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126712
11	NC_015903	AAT	2	6	855	860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126712
12	NC_015903	TTA	2	6	904	909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126712
13	NC_015903	AGG	2	6	931	936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	343126712
14	NC_015903	ATG	2	6	1024	1029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343126712
15	NC_015903	ATT	2	6	1048	1053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126712
16	NC_015903	AAG	2	6	1110	1115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343126712
17	NC_015903	GAA	2	6	1161	1166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343126712
18	NC_015903	AGT	2	6	1230	1235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343126712
19	NC_015903	TAA	2	6	1241	1246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126712
20	NC_015903	GAG	2	6	1248	1253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	343126712
21	NC_015903	ATT	2	6	1274	1279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126712
22	NC_015903	AGA	2	6	1317	1322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343126713
23	NC_015903	AGC	2	6	1355	1360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	343126713
24	NC_015903	TTC	3	9	1809	1817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343126713
25	NC_015903	TTG	2	6	1841	1846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343126713
26	NC_015903	AGA	2	6	1854	1859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343126713
27	NC_015903	CAA	2	6	2085	2090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343126714
28	NC_015903	GCT	2	6	2099	2104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	343126714
29	NC_015903	TGG	2	6	2153	2158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	343126714
30	NC_015903	CTA	2	6	2164	2169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343126714
31	NC_015903	GAG	2	6	2221	2226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	343126714
32	NC_015903	AAC	2	6	2249	2254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343126714
33	NC_015903	TGG	3	9	2273	2281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	343126714
34	NC_015903	GAT	2	6	2283	2288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343126714
35	NC_015903	AGA	2	6	2510	2515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343126714
36	NC_015903	GCT	2	6	2656	2661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	343126715
37	NC_015903	GAT	2	6	2740	2745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343126715
38	NC_015903	AGA	2	6	2889	2894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343126715
39	NC_015903	TTA	2	6	3137	3142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126715
40	NC_015903	CCA	2	6	3160	3165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	343126715
41	NC_015903	TAG	2	6	3530	3535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343126716
42	NC_015903	ATC	2	6	3553	3558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343126716
43	NC_015903	TGG	3	9	3650	3658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	343126716
44	NC_015903	CTA	2	6	3709	3714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343126716
45	NC_015903	AAT	2	6	3729	3734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126716
46	NC_015903	TAG	2	6	3748	3753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343126716
47	NC_015903	TAA	2	6	3794	3799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126716
48	NC_015903	TAA	2	6	3942	3947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126716
49	NC_015903	ATT	2	6	3971	3976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126717
50	NC_015903	TGA	2	6	3977	3982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343126717
51	NC_015903	ATT	2	6	3985	3990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126717
52	NC_015903	TAT	2	6	4034	4039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126717
53	NC_015903	ACA	2	6	4137	4142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343126717
54	NC_015903	GGT	2	6	4190	4195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	343126717
55	NC_015903	ATT	2	6	4204	4209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126717
56	NC_015903	TAA	3	9	4289	4297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126717
57	NC_015903	AGT	2	6	4332	4337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343126717
58	NC_015903	ATT	2	6	4341	4346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126717
59	NC_015903	ACT	2	6	4436	4441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343126717
60	NC_015903	AGA	2	6	4463	4468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343126717
61	NC_015903	GTG	2	6	4477	4482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	343126717
62	NC_015903	ATG	2	6	4566	4571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343126717
63	NC_015903	GCA	3	9	4617	4625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	343126717
64	NC_015903	TAA	2	6	4688	4693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126717
65	NC_015903	AGA	2	6	4697	4702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343126717
66	NC_015903	TTA	2	6	4768	4773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126717
67	NC_015903	CTA	2	6	4882	4887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343126717
68	NC_015903	ATT	2	6	5258	5263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126718
69	NC_015903	AGT	2	6	5272	5277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343126718
70	NC_015903	GAA	2	6	5284	5289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343126718
71	NC_015903	GGT	2	6	5290	5295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	343126718
72	NC_015903	TGT	2	6	5492	5497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343126719
73	NC_015903	CTC	2	6	5513	5518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	343126719
74	NC_015903	TTA	2	6	5566	5571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126719
75	NC_015903	TGG	2	6	5815	5820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	343126720
76	NC_015903	AGC	2	6	5855	5860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	343126720
77	NC_015903	TAG	2	6	5896	5901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343126720
78	NC_015903	AAT	2	6	5924	5929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126720
79	NC_015903	TAT	2	6	6018	6023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126720
80	NC_015903	GCA	2	6	6092	6097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	343126720
81	NC_015903	TTG	2	6	6105	6110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343126720
82	NC_015903	AAT	2	6	6232	6237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126721
83	NC_015903	GCT	2	6	6292	6297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	343126721
84	NC_015903	ATA	2	6	6307	6312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126721
85	NC_015903	TTA	2	6	6605	6610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126721
86	NC_015903	AGG	2	6	6692	6697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	343126721
87	NC_015903	ATT	2	6	6768	6773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126722
88	NC_015903	TAA	2	6	6814	6819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126722
89	NC_015903	TGC	2	6	6823	6828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	343126722
90	NC_015903	TAA	2	6	6856	6861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126722
91	NC_015903	GAA	2	6	6974	6979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343126722
92	NC_015903	TGT	2	6	7063	7068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343126722
93	NC_015903	TTA	2	6	7071	7076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126722
94	NC_015903	GAT	2	6	7097	7102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343126722
95	NC_015903	TAA	2	6	7129	7134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126722
96	NC_015903	AAT	2	6	7247	7252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126722
97	NC_015903	GCT	2	6	7340	7345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	343126722
98	NC_015903	TTG	2	6	7353	7358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343126722
99	NC_015903	CTT	2	6	7409	7414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343126722
100	NC_015903	ATT	2	6	7520	7525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126722
101	NC_015903	ATA	2	6	7551	7556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126722
102	NC_015903	TAC	2	6	7774	7779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343126722
103	NC_015903	TTG	2	6	7788	7793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343126722
104	NC_015903	TGG	2	6	7871	7876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	343126723
105	NC_015903	ACA	2	6	7920	7925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343126723
106	NC_015903	TAG	2	6	7937	7942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343126723
107	NC_015903	TAA	2	6	7963	7968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126723
108	NC_015903	TGA	2	6	8057	8062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343126723
109	NC_015903	CTA	2	6	8131	8136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343126723
110	NC_015903	ATT	2	6	8139	8144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126723
111	NC_015903	AAG	2	6	8177	8182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343126723
112	NC_015903	TTA	2	6	8272	8277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126724
113	NC_015903	TAT	2	6	8508	8513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126724
114	NC_015903	TTG	2	6	8524	8529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343126724
115	NC_015903	AAT	2	6	8531	8536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126724
116	NC_015903	AAT	2	6	8616	8621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126724
117	NC_015903	TCA	2	6	8691	8696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343126724
118	NC_015903	ATT	2	6	8829	8834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126725
119	NC_015903	GCA	2	6	9018	9023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	343126726
120	NC_015903	AGC	2	6	9719	9724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	343126726
121	NC_015903	TTG	2	6	9742	9747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343126726
122	NC_015903	CGG	2	6	9806	9811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	343126726
123	NC_015903	TTA	2	6	9826	9831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126726
124	NC_015903	ACA	2	6	9906	9911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343126726
125	NC_015903	CAA	2	6	9912	9917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343126726
126	NC_015903	GAA	3	9	9939	9947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343126726
127	NC_015903	AGA	2	6	10001	10006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343126726
128	NC_015903	TGA	2	6	10151	10156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343126726
129	NC_015903	ATA	2	6	10480	10485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126726
130	NC_015903	AAG	2	6	10486	10491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343126726
131	NC_015903	AAT	3	9	10684	10692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126727
132	NC_015903	AAT	2	6	10761	10766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126727
133	NC_015903	TAA	2	6	10775	10780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126727
134	NC_015903	GTT	2	6	10919	10924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343126727
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253	NC_015903	ACA	2	6	20242	20247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343126742
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255	NC_015903	TAT	2	6	20384	20389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126742
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383	NC_015903	CAG	2	6	30141	30146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	343126757
384	NC_015903	TTC	2	6	30147	30152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343126757
385	NC_015903	ATA	2	6	30185	30190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126757
386	NC_015903	ATG	2	6	30197	30202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343126757
387	NC_015903	GCA	2	6	30223	30228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	343126757
388	NC_015903	TGT	2	6	30236	30241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343126757

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.