MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Streptococcus pseudopneumoniae IS7493 plasmid pDRPIS7493

Total Repeats: 56

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015876	ACT	2	6	49	54	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_015876	TGA	2	6	104	109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015876	TCA	2	6	162	167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_015876	GAG	2	6	186	191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015876	GAA	2	6	372	377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015876	CAA	2	6	388	393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_015876	GTC	2	6	640	645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_015876	AGG	2	6	646	651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015876	GAT	2	6	690	695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015876	TGG	2	6	739	744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015876	GAA	2	6	816	821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015876	GAC	2	6	883	888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_015876	TGT	2	6	908	913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015876	AAG	2	6	976	981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015876	AAG	2	6	1129	1134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015876	TTG	2	6	1346	1351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015876	AGG	2	6	1421	1426	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015876	CTT	2	6	1453	1458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342164904
19	NC_015876	GTT	2	6	1459	1464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	342164904
20	NC_015876	AGT	2	6	1470	1475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342164904
21	NC_015876	TGA	2	6	1641	1646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015876	ACT	2	6	1651	1656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_015876	TTG	3	9	1658	1666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015876	TAT	2	6	2003	2008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342164905
25	NC_015876	GAG	2	6	2020	2025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	342164905
26	NC_015876	TAA	2	6	2130	2135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015876	TAG	2	6	2261	2266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342164906
28	NC_015876	TGA	2	6	2525	2530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342164906
29	NC_015876	AGA	2	6	2589	2594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342164906
30	NC_015876	TGC	2	6	2595	2600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	342164906
31	NC_015876	TTC	2	6	2629	2634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342164906
32	NC_015876	ATT	2	6	2680	2685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342164906
33	NC_015876	TGA	2	6	2687	2692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342164906
34	NC_015876	AGA	2	6	2835	2840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342164906
35	NC_015876	GAA	2	6	2968	2973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342164906
36	NC_015876	AGC	2	6	3116	3121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_015876	TGA	2	6	3129	3134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015876	ATT	2	6	3185	3190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342164907
39	NC_015876	ACC	2	6	3231	3236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	342164907
40	NC_015876	ACT	2	6	3237	3242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342164907
41	NC_015876	ATT	2	6	3246	3251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342164907
42	NC_015876	CCA	2	6	3283	3288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	342164907
43	NC_015876	CTC	2	6	3428	3433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	342164907
44	NC_015876	ACC	2	6	3473	3478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	342164907
45	NC_015876	CCA	2	6	3520	3525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	342164907
46	NC_015876	TGT	2	6	3582	3587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	342164907
47	NC_015876	AGA	2	6	3601	3606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342164907
48	NC_015876	ATT	2	6	3731	3736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342164908
49	NC_015876	ATA	2	6	3812	3817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	342164908
50	NC_015876	TAT	3	9	3822	3830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342164908
51	NC_015876	TAG	2	6	3854	3859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342164908
52	NC_015876	TGT	2	6	3860	3865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	342164908
53	NC_015876	AAT	2	6	3976	3981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	342164908
54	NC_015876	GAA	2	6	4001	4006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015876	GAG	2	6	4436	4441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015876	ATT	2	6	4700	4705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.