MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus pseudopneumoniae IS7493 chromosome

Total Repeats: 111

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015875	ACCAAG	2	12	22086	22097	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_015875	GTTTTG	2	12	38569	38580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015875	AGGTTG	2	12	39457	39468	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015875	AAAAAC	2	12	39624	39635	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_015875	TTCTAT	2	12	127461	127472	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_015875	TAAAAT	2	12	135689	135700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015875	TAAAAA	2	12	152801	152812	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015875	TAACAC	2	12	194560	194571	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_015875	ATAAAA	2	12	210687	210698	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015875	AGCTTT	2	12	290567	290578	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_015875	GTGATA	2	12	321440	321451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015875	GCAGTT	2	12	381518	381529	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_015875	AACTTG	2	12	398915	398926	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_015875	GAAAAA	2	12	403991	404002	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015875	TCTTTT	2	12	418419	418430	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_015875	ATGTTG	2	12	432575	432586	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015875	AGAAAT	2	12	486157	486168	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015875	AAAATC	2	12	488131	488142	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_015875	TCTTTT	2	12	489779	489790	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_015875	GCTTGC	2	12	517416	517427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_015875	TACAAA	2	12	519054	519065	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_015875	TAGATA	2	12	530013	530024	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015875	TCTTTT	2	12	570247	570258	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_015875	TATAAA	2	12	611094	611105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015875	TACTTG	2	12	615382	615393	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_015875	AGGAAA	2	12	615420	615431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015875	CTGTAA	2	12	616630	616641	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_015875	AAAGTT	2	12	622721	622732	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015875	ACTTCT	2	12	640457	640468	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_015875	GGACAC	2	12	687323	687334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_015875	GTTCTG	2	12	696601	696612	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_015875	TTTTCT	2	12	751603	751614	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_015875	AAAATC	2	12	777551	777562	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_015875	TTTTCA	2	12	777961	777972	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_015875	ATTTTC	2	12	795217	795228	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_015875	TTCGGG	2	12	836555	836566	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_015875	TATAAA	2	12	875709	875720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015875	GCAATC	2	12	883331	883342	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_015875	ATTTTT	2	12	896477	896488	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015875	TCCTAT	2	12	902041	902052	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_015875	TATAAA	2	12	906916	906927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015875	AAAATT	2	12	907052	907063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015875	TGTTGC	2	12	917376	917387	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_015875	AGAGGA	2	12	918828	918839	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015875	CTATTT	2	12	943057	943068	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_015875	AAAAAG	2	12	943106	943117	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015875	CTACTC	2	12	952384	952395	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_015875	ATTTTT	2	12	967665	967676	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015875	GAAGTA	2	12	980701	980712	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015875	TGGCGA	2	12	1011068	1011079	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_015875	GAGGGG	2	12	1013157	1013168	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015875	CAGGCT	2	12	1022478	1022489	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_015875	TAAAAA	2	12	1022629	1022640	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015875	AGAATT	2	12	1070573	1070584	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015875	TTTTTG	2	12	1092529	1092540	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015875	GTTTGT	2	12	1102881	1102892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015875	GTTGAA	2	12	1124071	1124082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015875	TATTAC	2	12	1146790	1146801	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_015875	CACTAT	2	12	1244910	1244921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_015875	TAGGTA	2	12	1288052	1288063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015875	TACTAA	2	12	1299256	1299267	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_015875	TCTTAT	2	12	1309548	1309559	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_015875	TTAATA	2	12	1342683	1342694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015875	ATTAAA	2	12	1348027	1348038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015875	TTTTAT	2	12	1356791	1356802	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015875	GTTTGT	2	12	1379957	1379968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015875	AAATTT	2	12	1419106	1419117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015875	TCTTTT	2	12	1527069	1527080	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_015875	CCGTTT	2	12	1527208	1527219	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_015875	ATTTGT	2	12	1546419	1546430	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015875	AACAAA	2	12	1556398	1556409	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_015875	TTAAAA	2	12	1584420	1584431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015875	AAAGTC	2	12	1599766	1599777	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_015875	AAGGTT	2	12	1601089	1601100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015875	TTCTTG	2	12	1601985	1601996	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_015875	CACTTC	2	12	1634328	1634339	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_015875	GTTATC	2	12	1638495	1638506	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_015875	TCCATT	2	12	1638645	1638656	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_015875	GAACAT	2	12	1653114	1653125	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_015875	AAATTG	2	12	1666284	1666295	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015875	AAAGCA	2	12	1690610	1690621	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_015875	TTATCT	2	12	1696545	1696556	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_015875	TAGGTA	2	12	1736462	1736473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015875	CCTCAA	2	12	1736940	1736951	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_015875	CCCGAA	2	12	1775197	1775208	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
86	NC_015875	TAATCA	2	12	1795458	1795469	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_015875	TCATTA	2	12	1813019	1813030	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_015875	TAATCA	2	12	1830324	1830335	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_015875	TGGGCT	2	12	1839819	1839830	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_015875	ATTCCT	2	12	1860834	1860845	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_015875	ATAAAT	2	12	1891668	1891679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015875	ATTGTT	2	12	1893436	1893447	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015875	AGAGAA	2	12	1901753	1901764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015875	ACTGCT	2	12	2039114	2039125	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_015875	TCTTTT	2	12	2043585	2043596	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_015875	AATAAA	2	12	2068038	2068049	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015875	TATTTT	2	12	2072650	2072661	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015875	TATTAG	2	12	2078257	2078268	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015875	CACTTC	2	12	2078288	2078299	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_015875	TTCCTT	2	12	2081376	2081387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_015875	CCGTTT	2	12	2083599	2083610	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_015875	CCTGTT	2	12	2083682	2083693	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_015875	TAGCAA	2	12	2084397	2084408	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_015875	CATCTG	2	12	2084646	2084657	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_015875	AAGCCT	2	12	2088136	2088147	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_015875	GTTTTT	2	12	2088954	2088965	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015875	GAAATA	2	12	2106276	2106287	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015875	ATAGAG	2	12	2111240	2111251	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015875	AACTTG	2	12	2145130	2145141	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_015875	ACCTTG	2	12	2148102	2148113	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_015875	TTTTTA	2	12	2161753	2161764	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.