MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Streptococcus pseudopneumoniae IS7493 chromosome

Total Repeats: 6384

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015875	GAAA	2	8	3	10	75 %	0 %	25 %	0 %	342162672
2	NC_015875	AAGA	2	8	44	51	75 %	0 %	25 %	0 %	342162672
3	NC_015875	TGAT	2	8	1301	1308	25 %	50 %	25 %	0 %	342162672
4	NC_015875	AATC	2	8	1337	1344	50 %	25 %	0 %	25 %	342162672
5	NC_015875	ATAA	2	8	1503	1510	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015875	ATTT	2	8	1546	1553	25 %	75 %	0 %	0 %	342162673
7	NC_015875	ACTT	2	8	2514	2521	25 %	50 %	0 %	25 %	342162673
8	NC_015875	GATT	2	8	2522	2529	25 %	50 %	25 %	0 %	342162673
9	NC_015875	TTAG	2	8	2923	2930	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015875	AACT	2	8	3157	3164	50 %	25 %	0 %	25 %	342162675
11	NC_015875	CAAA	2	8	3680	3687	75 %	0 %	0 %	25 %	342162675
12	NC_015875	CTTG	2	8	3848	3855	0 %	50 %	25 %	25 %	342162675
13	NC_015875	ACTT	2	8	3864	3871	25 %	50 %	0 %	25 %	342162675
14	NC_015875	AAAT	2	8	4181	4188	75 %	25 %	0 %	0 %	342162676
15	NC_015875	TTGA	2	8	4262	4269	25 %	50 %	25 %	0 %	342162676
16	NC_015875	ATGA	2	8	4385	4392	50 %	25 %	25 %	0 %	342162676
17	NC_015875	ATCT	2	8	4963	4970	25 %	50 %	0 %	25 %	342162677
18	NC_015875	GATT	2	8	5130	5137	25 %	50 %	25 %	0 %	342162677
19	NC_015875	GAAA	2	8	5395	5402	75 %	0 %	25 %	0 %	342162677
20	NC_015875	GTCA	2	8	5469	5476	25 %	25 %	25 %	25 %	342162677
21	NC_015875	TCAA	2	8	5895	5902	50 %	25 %	0 %	25 %	342162677
22	NC_015875	GTCG	2	8	7499	7506	0 %	25 %	50 %	25 %	342162677
23	NC_015875	ATCA	2	8	7552	7559	50 %	25 %	0 %	25 %	342162677
24	NC_015875	GAAA	2	8	8021	8028	75 %	0 %	25 %	0 %	342162677
25	NC_015875	AAGA	2	8	8177	8184	75 %	0 %	25 %	0 %	342162677
26	NC_015875	AAGA	2	8	8246	8253	75 %	0 %	25 %	0 %	342162677
27	NC_015875	GAAA	2	8	9160	9167	75 %	0 %	25 %	0 %	342162681
28	NC_015875	TATT	2	8	9196	9203	25 %	75 %	0 %	0 %	342162681
29	NC_015875	TAAA	2	8	9327	9334	75 %	25 %	0 %	0 %	342162681
30	NC_015875	TCAG	2	8	9403	9410	25 %	25 %	25 %	25 %	342162681
31	NC_015875	GAAG	2	8	9545	9552	50 %	0 %	50 %	0 %	342162681
32	NC_015875	ATTC	2	8	9663	9670	25 %	50 %	0 %	25 %	342162681
33	NC_015875	ATCA	2	8	9713	9720	50 %	25 %	0 %	25 %	342162681
34	NC_015875	TTCT	2	8	10260	10267	0 %	75 %	0 %	25 %	342162681
35	NC_015875	CTAT	2	8	10752	10759	25 %	50 %	0 %	25 %	342162682
36	NC_015875	CTTA	2	8	10907	10914	25 %	50 %	0 %	25 %	342162682
37	NC_015875	ATTT	2	8	11306	11313	25 %	75 %	0 %	0 %	342162682
38	NC_015875	TTTA	2	8	11445	11452	25 %	75 %	0 %	0 %	342162682
39	NC_015875	AGAA	2	8	12159	12166	75 %	0 %	25 %	0 %	342162683
40	NC_015875	TTAA	2	8	12197	12204	50 %	50 %	0 %	0 %	342162684
41	NC_015875	ATTA	2	8	12296	12303	50 %	50 %	0 %	0 %	342162684
42	NC_015875	ACCA	2	8	12354	12361	50 %	0 %	0 %	50 %	342162684
43	NC_015875	TGCT	2	8	12879	12886	0 %	50 %	25 %	25 %	342162684
44	NC_015875	GTTC	2	8	12977	12984	0 %	50 %	25 %	25 %	342162684
45	NC_015875	TTGA	2	8	13115	13122	25 %	50 %	25 %	0 %	342162684
46	NC_015875	GATG	2	8	13123	13130	25 %	25 %	50 %	0 %	342162684
47	NC_015875	TTGG	2	8	13232	13239	0 %	50 %	50 %	0 %	342162684
48	NC_015875	TGAA	2	8	13374	13381	50 %	25 %	25 %	0 %	342162684
49	NC_015875	AAGA	2	8	13472	13479	75 %	0 %	25 %	0 %	342162684
50	NC_015875	TCTA	2	8	13648	13655	25 %	50 %	0 %	25 %	342162684
51	NC_015875	TGGC	2	8	13677	13684	0 %	25 %	50 %	25 %	342162684
52	NC_015875	AACA	2	8	13881	13888	75 %	0 %	0 %	25 %	342162684
53	NC_015875	TGAA	2	8	13923	13930	50 %	25 %	25 %	0 %	342162684
54	NC_015875	ATGA	2	8	14117	14124	50 %	25 %	25 %	0 %	342162684
55	NC_015875	GAGG	2	8	14545	14552	25 %	0 %	75 %	0 %	342162685
56	NC_015875	AAAC	2	8	14604	14611	75 %	0 %	0 %	25 %	342162685
57	NC_015875	AGAA	2	8	15813	15820	75 %	0 %	25 %	0 %	342162689
58	NC_015875	ATTG	2	8	15923	15930	25 %	50 %	25 %	0 %	342162689
59	NC_015875	ATCA	2	8	15941	15948	50 %	25 %	0 %	25 %	342162689
60	NC_015875	AAAC	2	8	16506	16513	75 %	0 %	0 %	25 %	342162691
61	NC_015875	CTTT	2	8	16595	16602	0 %	75 %	0 %	25 %	342162691
62	NC_015875	TTGA	2	8	16690	16697	25 %	50 %	25 %	0 %	342162691
63	NC_015875	TACA	2	8	17311	17318	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_015875	CTAT	2	8	17729	17736	25 %	50 %	0 %	25 %	342162694
65	NC_015875	AAAT	2	8	18936	18943	75 %	25 %	0 %	0 %	342162697
66	NC_015875	ATGA	2	8	19057	19064	50 %	25 %	25 %	0 %	342162698
67	NC_015875	AGAT	2	8	19772	19779	50 %	25 %	25 %	0 %	342162698
68	NC_015875	CTAT	2	8	20512	20519	25 %	50 %	0 %	25 %	342162699
69	NC_015875	TTTG	2	8	20633	20640	0 %	75 %	25 %	0 %	342162699
70	NC_015875	TTCT	2	8	20989	20996	0 %	75 %	0 %	25 %	342162699
71	NC_015875	ATGA	2	8	21301	21308	50 %	25 %	25 %	0 %	342162700
72	NC_015875	TAGA	2	8	21888	21895	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015875	GCAG	2	8	22483	22490	25 %	0 %	50 %	25 %	342162701
74	NC_015875	ACTT	2	8	22523	22530	25 %	50 %	0 %	25 %	342162701
75	NC_015875	TGAA	2	8	22635	22642	50 %	25 %	25 %	0 %	342162701
76	NC_015875	ATCT	2	8	22777	22784	25 %	50 %	0 %	25 %	342162701
77	NC_015875	AAGC	2	8	24702	24709	50 %	0 %	25 %	25 %	342162702
78	NC_015875	CAGA	2	8	25502	25509	50 %	0 %	25 %	25 %	342162703
79	NC_015875	AATA	2	8	25517	25524	75 %	25 %	0 %	0 %	342162703
80	NC_015875	TTAT	2	8	27179	27186	25 %	75 %	0 %	0 %	342162709
81	NC_015875	ATCA	2	8	27379	27386	50 %	25 %	0 %	25 %	342162709
82	NC_015875	TTAA	2	8	27941	27948	50 %	50 %	0 %	0 %	342162710
83	NC_015875	AGGA	2	8	28689	28696	50 %	0 %	50 %	0 %	342162712
84	NC_015875	AATG	2	8	28700	28707	50 %	25 %	25 %	0 %	342162712
85	NC_015875	TCTT	2	8	29005	29012	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_015875	TTTG	2	8	30568	30575	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015875	GTTT	2	8	30747	30754	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015875	GAAG	2	8	30974	30981	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015875	ATTG	2	8	31414	31421	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015875	GAAA	2	8	32140	32147	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015875	GGAT	2	8	32432	32439	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015875	CAAT	2	8	32639	32646	50 %	25 %	0 %	25 %	342162713
93	NC_015875	ATGG	2	8	32860	32867	25 %	25 %	50 %	0 %	342162713
94	NC_015875	TACC	2	8	33232	33239	25 %	25 %	0 %	50 %	342162714
95	NC_015875	ATGG	2	8	33317	33324	25 %	25 %	50 %	0 %	342162714
96	NC_015875	GAAA	2	8	33483	33490	75 %	0 %	25 %	0 %	342162714
97	NC_015875	GGTC	2	8	33716	33723	0 %	25 %	50 %	25 %	342162714
98	NC_015875	GAAA	2	8	33874	33881	75 %	0 %	25 %	0 %	342162714
99	NC_015875	CAAG	2	8	34147	34154	50 %	0 %	25 %	25 %	342162714
100	NC_015875	ATCA	2	8	34169	34176	50 %	25 %	0 %	25 %	342162714
101	NC_015875	CAGT	2	8	34283	34290	25 %	25 %	25 %	25 %	342162714
102	NC_015875	GCTT	2	8	35294	35301	0 %	50 %	25 %	25 %	342162715
103	NC_015875	ATTC	2	8	35484	35491	25 %	50 %	0 %	25 %	342162715
104	NC_015875	AATT	2	8	35748	35755	50 %	50 %	0 %	0 %	342162715
105	NC_015875	AATC	2	8	35904	35911	50 %	25 %	0 %	25 %	342162715
106	NC_015875	GCTT	2	8	36491	36498	0 %	50 %	25 %	25 %	342162715
107	NC_015875	AGAA	2	8	37659	37666	75 %	0 %	25 %	0 %	342162716
108	NC_015875	AGGC	2	8	38080	38087	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
109	NC_015875	GACA	2	8	38350	38357	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_015875	ACAA	2	8	38726	38733	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_015875	CAAG	2	8	39081	39088	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_015875	TAGC	2	8	39214	39221	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_015875	CAAA	2	8	40017	40024	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_015875	TGGT	2	8	40047	40054	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015875	AACT	2	8	40333	40340	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_015875	TCGG	2	8	40485	40492	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_015875	GGAA	2	8	40776	40783	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015875	TGGA	2	8	40830	40837	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015875	CAGA	2	8	40846	40853	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_015875	CTTA	2	8	41065	41072	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_015875	GGCT	2	8	41222	41229	0 %	25 %	50 %	25 %	342162717
122	NC_015875	GAAT	2	8	41326	41333	50 %	25 %	25 %	0 %	342162717
123	NC_015875	CAAT	2	8	41344	41351	50 %	25 %	0 %	25 %	342162718
124	NC_015875	ATGG	2	8	41589	41596	25 %	25 %	50 %	0 %	342162718
125	NC_015875	CAAC	2	8	41757	41764	50 %	0 %	0 %	50 %	342162718
126	NC_015875	AAGA	2	8	41781	41788	75 %	0 %	25 %	0 %	342162718
127	NC_015875	GCTG	2	8	42232	42239	0 %	25 %	50 %	25 %	342162720
128	NC_015875	AAAG	2	8	42303	42310	75 %	0 %	25 %	0 %	342162720
129	NC_015875	GCAG	2	8	42832	42839	25 %	0 %	50 %	25 %	342162722
130	NC_015875	GAAA	2	8	42982	42989	75 %	0 %	25 %	0 %	342162722
131	NC_015875	TCCA	2	8	43253	43260	25 %	25 %	0 %	50 %	342162723
132	NC_015875	TTTG	2	8	43521	43528	0 %	75 %	25 %	0 %	342162723
133	NC_015875	GGGT	2	8	44051	44058	0 %	25 %	75 %	0 %	342162724
134	NC_015875	CAAG	2	8	44340	44347	50 %	0 %	25 %	25 %	342162725
135	NC_015875	GTTG	2	8	44483	44490	0 %	50 %	50 %	0 %	342162725
136	NC_015875	ACGA	2	8	44795	44802	50 %	0 %	25 %	25 %	342162726
137	NC_015875	AAGA	2	8	44826	44833	75 %	0 %	25 %	0 %	342162726
138	NC_015875	TAAA	2	8	45164	45171	75 %	25 %	0 %	0 %	342162727
139	NC_015875	AGTT	2	8	46756	46763	25 %	50 %	25 %	0 %	342162732
140	NC_015875	AGCT	2	8	46884	46891	25 %	25 %	25 %	25 %	342162732
141	NC_015875	AGAC	2	8	47041	47048	50 %	0 %	25 %	25 %	342162732
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143	NC_015875	AAAC	2	8	47180	47187	75 %	0 %	0 %	25 %	342162733
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