MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus pseudopneumoniae IS7493 chromosome

Total Repeats: 1061

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015875	ATAA	2	8	1503	1510	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015875	TTAG	2	8	2923	2930	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015875	TACA	2	8	17311	17318	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_015875	TAGA	2	8	21888	21895	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015875	TCTT	2	8	29005	29012	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_015875	TTTG	2	8	30568	30575	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015875	GTTT	2	8	30747	30754	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015875	GAAG	2	8	30974	30981	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015875	ATTG	2	8	31414	31421	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015875	GAAA	2	8	32140	32147	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015875	GGAT	2	8	32432	32439	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015875	AGGC	2	8	38080	38087	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_015875	GACA	2	8	38350	38357	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_015875	ACAA	2	8	38726	38733	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_015875	CAAG	2	8	39081	39088	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_015875	TAGC	2	8	39214	39221	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_015875	CAAA	2	8	40017	40024	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_015875	TGGT	2	8	40047	40054	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015875	AACT	2	8	40333	40340	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_015875	TCGG	2	8	40485	40492	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_015875	GGAA	2	8	40776	40783	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015875	TGGA	2	8	40830	40837	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015875	CAGA	2	8	40846	40853	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_015875	CTTA	2	8	41065	41072	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_015875	AGGA	2	8	51645	51652	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015875	CAAG	2	8	57268	57275	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_015875	AGGA	2	8	57751	57758	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015875	ATTA	2	8	64109	64116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015875	ATGT	2	8	64591	64598	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015875	AATA	2	8	66721	66728	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015875	AGAA	2	8	69690	69697	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015875	TTGA	2	8	70570	70577	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015875	AATA	2	8	71673	71680	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015875	TAGA	2	8	72578	72585	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015875	TCTA	2	8	77603	77610	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_015875	AATC	2	8	85690	85697	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_015875	AAAG	2	8	85712	85719	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015875	TAAA	2	8	86644	86651	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015875	TAAG	2	8	90360	90367	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015875	TAAG	2	8	90486	90493	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015875	AAAG	2	8	90499	90506	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015875	AAAG	2	8	90625	90632	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015875	GAAG	2	8	91221	91228	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015875	ATAA	2	8	91714	91721	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015875	ATTT	2	8	92458	92465	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015875	AATA	2	8	93575	93582	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015875	AAAG	2	8	97337	97344	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015875	TGGT	2	8	98426	98433	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015875	ATTT	2	8	99247	99254	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015875	TCTA	2	8	100682	100689	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_015875	TTTA	2	8	100837	100844	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015875	ATTT	2	8	100966	100973	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015875	ACAT	2	8	101066	101073	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_015875	GGGA	2	8	104211	104218	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015875	TTTG	2	8	104249	104256	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015875	TGAC	2	8	104348	104355	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_015875	TAAA	2	8	109036	109043	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015875	TATT	2	8	116501	116508	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015875	TTTC	2	8	118560	118567	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_015875	AACG	2	8	118605	118612	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_015875	AATT	2	8	128508	128515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015875	GTTT	2	8	134592	134599	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015875	TTGA	2	8	137677	137684	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015875	AAGG	2	8	140631	140638	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015875	AGTC	2	8	140668	140675	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_015875	AAAT	2	8	143060	143067	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015875	CTTT	2	8	143121	143128	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_015875	AAGA	2	8	146881	146888	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015875	AGGT	2	8	150289	150296	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015875	TGAT	2	8	150392	150399	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015875	CTAG	2	8	150586	150593	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_015875	TATC	2	8	150637	150644	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_015875	TTTG	2	8	150686	150693	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015875	ATTC	2	8	154323	154330	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_015875	TGTT	2	8	157960	157967	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015875	ATTC	2	8	158809	158816	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_015875	AAAT	2	8	159120	159127	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015875	ATAA	2	8	159163	159170	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015875	GTTT	2	8	160253	160260	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015875	TTAG	2	8	162482	162489	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015875	ACAT	2	8	164389	164396	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_015875	AAAG	2	8	164407	164414	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015875	AGAA	2	8	171702	171709	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015875	ATGA	2	8	172855	172862	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015875	ATAG	2	8	176722	176729	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015875	TCCC	2	8	177948	177955	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
87	NC_015875	GTTC	2	8	180740	180747	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_015875	AAAT	2	8	185247	185254	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015875	GAAG	2	8	185827	185834	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015875	AATT	2	8	185919	185926	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015875	ATAA	2	8	186062	186069	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015875	AATC	2	8	186074	186081	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_015875	TGCT	2	8	189205	189212	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_015875	AGGA	2	8	189401	189408	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015875	TTTA	2	8	192038	192045	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015875	TAGC	2	8	192118	192125	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_015875	GCAA	2	8	195565	195572	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_015875	AAAG	2	8	199649	199656	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015875	CAGA	2	8	201022	201029	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_015875	ATCA	2	8	201956	201963	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_015875	TAAA	2	8	203384	203391	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015875	AAAG	2	8	207198	207205	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015875	AGAT	2	8	210709	210716	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015875	GGCT	2	8	213470	213477	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_015875	CTAT	2	8	215673	215680	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_015875	GAAA	2	8	217152	217159	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015875	GCAG	2	8	217179	217186	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
108	NC_015875	AGAT	2	8	218339	218346	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015875	ATGA	2	8	224448	224455	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015875	CATT	2	8	224648	224655	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_015875	GCTG	2	8	226823	226830	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_015875	AAAG	2	8	228563	228570	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015875	TAAA	2	8	236248	236255	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015875	TATG	2	8	238755	238762	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015875	ACAA	2	8	239474	239481	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_015875	ATAG	2	8	244710	244717	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015875	AAAT	2	8	244742	244749	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015875	TTTA	2	8	244793	244800	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015875	AGCG	2	8	245763	245770	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
120	NC_015875	AAAT	2	8	247846	247853	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015875	ATAA	2	8	249647	249654	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015875	TTTC	2	8	257054	257061	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_015875	CATA	2	8	269422	269429	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_015875	TAAA	2	8	269462	269469	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015875	AATG	2	8	269505	269512	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015875	AAAC	2	8	270106	270113	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_015875	TCTG	2	8	270314	270321	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_015875	GTCT	2	8	270425	270432	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_015875	AGCT	2	8	272502	272509	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_015875	AGAA	2	8	274415	274422	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015875	GGTA	2	8	278436	278443	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015875	AGAA	2	8	278894	278901	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015875	AAAT	2	8	279486	279493	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015875	AGGG	2	8	284322	284329	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015875	AGAA	2	8	286141	286148	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015875	GCAT	2	8	286163	286170	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_015875	ACAA	2	8	296459	296466	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_015875	TAAA	2	8	309017	309024	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015875	TTTA	2	8	309091	309098	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015875	CTTG	2	8	310060	310067	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_015875	TAAA	2	8	321343	321350	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015875	TTTA	2	8	321362	321369	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015875	TTTA	2	8	321547	321554	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015875	CTGA	2	8	330190	330197	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_015875	GAAA	2	8	330272	330279	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015875	AATT	2	8	332336	332343	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015875	TCTA	2	8	338084	338091	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_015875	AATC	2	8	344983	344990	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_015875	CAAT	2	8	348907	348914	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_015875	AACT	2	8	351691	351698	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_015875	AAAT	2	8	353334	353341	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_015875	AAAC	2	8	353347	353354	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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