Hexa-nucleotide Coding Repeats of Megasphaera elsdenii DSM 20460

Total Repeats: 1162

Go To Repeat Summary Page

Download The Result in

S.No.Genome IDMotifIterationsLengthStartEndA%T%G%C% Protein ID
1001NC_015873GGTCGG212211115821111690 %16.67 %66.67 %16.67 %348027158
1002NC_015873CCCGTT212211143121114420 %33.33 %16.67 %50 %348027158
1003NC_015873TTCTTT212211244721124580 %83.33 %0 %16.67 %348027159
1004NC_015873ATATTG2122112890211290133.33 %50 %16.67 %0 %348027160
1005NC_015873GTCAAT2122113714211372533.33 %33.33 %16.67 %16.67 %348027160
1006NC_015873CGATTC2122115090211510116.67 %33.33 %16.67 %33.33 %348027160
1007NC_015873CGTTTT212211996621199770 %66.67 %16.67 %16.67 %348027164
1008NC_015873GCCTCC212212579621258070 %16.67 %16.67 %66.67 %348027165
1009NC_015873ACTAAT2122131617213162850 %33.33 %0 %16.67 %348027172
1010NC_015873GAAACA2122134433213444466.67 %0 %16.67 %16.67 %348027175
1011NC_015873ATATTG2122134733213474433.33 %50 %16.67 %0 %348027175
1012NC_015873AGATAC2122135877213588850 %16.67 %16.67 %16.67 %348027175
1013NC_015873TCTATT2122143036214304716.67 %66.67 %0 %16.67 %348027187
1014NC_015873TTTCTT212214531021453210 %83.33 %0 %16.67 %348027191
1015NC_015873CCCATT2122146255214626616.67 %33.33 %0 %50 %348027193
1016NC_015873TGGGTC212214642021464310 %33.33 %50 %16.67 %348027193
1017NC_015873TTTCCG212215024921502600 %50 %16.67 %33.33 %348027198
1018NC_015873CGGTTC212215268421526950 %33.33 %33.33 %33.33 %348027203
1019NC_015873TGCCAG2122161779216179016.67 %16.67 %33.33 %33.33 %348027210
1020NC_015873CAGGGT2122163230216324116.67 %16.67 %50 %16.67 %348027210
1021NC_015873GACCAG2122165731216574233.33 %0 %33.33 %33.33 %348027211
1022NC_015873GCCGTA2122166412216642316.67 %16.67 %33.33 %33.33 %348027211
1023NC_015873CAGGCG2122170467217047816.67 %0 %50 %33.33 %348027213
1024NC_015873TCTGTT212217708621770970 %66.67 %16.67 %16.67 %348027219
1025NC_015873GGCCTG212217717021771810 %16.67 %50 %33.33 %348027220
1026NC_015873ATGGAT2122182247218225833.33 %33.33 %33.33 %0 %348027224
1027NC_015873GATAAT2122184473218448450 %33.33 %16.67 %0 %348027227
1028NC_015873CCTGGC212218471021847210 %16.67 %33.33 %50 %348027227
1029NC_015873TGTCAT2122184758218476916.67 %50 %16.67 %16.67 %348027227
1030NC_015873ACAGCC2122187200218721133.33 %0 %16.67 %50 %348027229
1031NC_015873TCAGCT2122188474218848516.67 %33.33 %16.67 %33.33 %348027230
1032NC_015873ATCGAC2122198036219804733.33 %16.67 %16.67 %33.33 %348027235
1033NC_015873CGCCTT212219977721997880 %33.33 %16.67 %50 %348027236
1034NC_015873GGGCAT2122199795219980616.67 %16.67 %50 %16.67 %348027236
1035NC_015873GGCGCT212220155922015700 %16.67 %50 %33.33 %348027237
1036NC_015873CCGTGC212220246722024780 %16.67 %33.33 %50 %348027237
1037NC_015873CTTCAC2122203262220327316.67 %33.33 %0 %50 %348027237
1038NC_015873AGCGTC2122204112220412316.67 %16.67 %33.33 %33.33 %348027239
1039NC_015873GTAACA2122210195221020650 %16.67 %16.67 %16.67 %348027244
1040NC_015873GCTTCC212221202722120380 %33.33 %16.67 %50 %348027247
1041NC_015873GGCCAG2122212924221293516.67 %0 %50 %33.33 %348027248
1042NC_015873AAAACG2122214282221429366.67 %0 %16.67 %16.67 %348027249
1043NC_015873CGGATG2122216437221644816.67 %16.67 %50 %16.67 %348027252
1044NC_015873AGAATC2122221705222171650 %16.67 %16.67 %16.67 %348027257
1045NC_015873TGCAGA2122222439222245033.33 %16.67 %33.33 %16.67 %348027257
1046NC_015873CATGGC2122227036222704716.67 %16.67 %33.33 %33.33 %348027262
1047NC_015873GGCCGC212222777622277870 %0 %50 %50 %348027262
1048NC_015873GCCGAC2122228588222859916.67 %0 %33.33 %50 %348027263
1049NC_015873GTAGCC2122228933222894416.67 %16.67 %33.33 %33.33 %348027263
1050NC_015873GCGCCG212222924022292510 %0 %50 %50 %348027263
1051NC_015873ACGTAT2122229511222952233.33 %33.33 %16.67 %16.67 %348027264
1052NC_015873TGGAGC2122231328223133916.67 %16.67 %50 %16.67 %348027266
1053NC_015873CACCTA2122234439223445033.33 %16.67 %0 %50 %348027268
1054NC_015873TGACGA2122236425223643633.33 %16.67 %33.33 %16.67 %348027270
1055NC_015873CATCGT2122237160223717116.67 %33.33 %16.67 %33.33 %348027270
1056NC_015873TGAGCA2122240481224049233.33 %16.67 %33.33 %16.67 %348027273
1057NC_015873TCGATG2122241620224163116.67 %33.33 %33.33 %16.67 %348027273
1058NC_015873GGCAGG2122244171224418216.67 %0 %66.67 %16.67 %348027275
1059NC_015873ATAGGT2122244836224484733.33 %33.33 %33.33 %0 %348027275
1060NC_015873CGATGA2122245521224553233.33 %16.67 %33.33 %16.67 %348027277
1061NC_015873ACGATG2122246219224623033.33 %16.67 %33.33 %16.67 %348027277
1062NC_015873CGTATC2122247019224703016.67 %33.33 %16.67 %33.33 %348027278
1063NC_015873TGATGC2122247650224766116.67 %33.33 %33.33 %16.67 %348027280
1064NC_015873GGATCT2122248775224878616.67 %33.33 %33.33 %16.67 %348027280
1065NC_015873TTGGGC212224884022488510 %33.33 %50 %16.67 %348027280
1066NC_015873TGGCCA2122249360224937116.67 %16.67 %33.33 %33.33 %348027280
1067NC_015873ATCTTT2122249739224975016.67 %66.67 %0 %16.67 %348027280
1068NC_015873AGCTTC2122254203225421416.67 %33.33 %16.67 %33.33 %348027283
1069NC_015873TACATA2122254266225427750 %33.33 %0 %16.67 %348027283
1070NC_015873GCCTTC212225461722546280 %33.33 %16.67 %50 %348027283
1071NC_015873TTTAGC2122255190225520116.67 %50 %16.67 %16.67 %348027283
1072NC_015873GCCGAG2122255712225572316.67 %0 %50 %33.33 %348027283
1073NC_015873TTCCGG212225935222593630 %33.33 %33.33 %33.33 %348027286
1074NC_015873GGGCAC2122259898225990916.67 %0 %50 %33.33 %348027286
1075NC_015873GGTTGT212226047322604840 %50 %50 %0 %348027287
1076NC_015873TCCAAG2122265621226563233.33 %16.67 %16.67 %33.33 %348027291
1077NC_015873ACGCGG2122274910227492116.67 %0 %50 %33.33 %348027298
1078NC_015873TTGTCC212227552422755350 %50 %16.67 %33.33 %348027298
1079NC_015873TAACCA2122276452227646350 %16.67 %0 %33.33 %348027300
1080NC_015873CTTCCA2122277819227783016.67 %33.33 %0 %50 %348027301
1081NC_015873GGGGAT2122279183227919416.67 %16.67 %66.67 %0 %348027303
1082NC_015873GACGGC2122279549227956016.67 %0 %50 %33.33 %348027303
1083NC_015873CATAGC2122286683228669433.33 %16.67 %16.67 %33.33 %348027311
1084NC_015873TGGGCC212228750422875150 %16.67 %50 %33.33 %348027311
1085NC_015873ATGGCA2122290389229040033.33 %16.67 %33.33 %16.67 %348027315
1086NC_015873GGCGAC2122290985229099616.67 %0 %50 %33.33 %348027315
1087NC_015873TTTTCT212229105922910700 %83.33 %0 %16.67 %348027315
1088NC_015873CATGCC2122292541229255216.67 %16.67 %16.67 %50 %348027316
1089NC_015873GGCCAG2122292808229281916.67 %0 %50 %33.33 %348027316
1090NC_015873TCGACA2122293526229353733.33 %16.67 %16.67 %33.33 %348027317
1091NC_015873TATGAT2122296947229695833.33 %50 %16.67 %0 %348027319
1092NC_015873GAATAC2122300115230012650 %16.67 %16.67 %16.67 %348027321
1093NC_015873GCGGAC2122300973230098416.67 %0 %50 %33.33 %348027321
1094NC_015873TCCATA2122301667230167833.33 %33.33 %0 %33.33 %348027322
1095NC_015873GCAATA2122301708230171950 %16.67 %16.67 %16.67 %348027322
1096NC_015873GAATAC2122302115230212650 %16.67 %16.67 %16.67 %348027323
1097NC_015873GATAAC2122303062230307350 %16.67 %16.67 %16.67 %348027323
1098NC_015873AATGGA2122304139230415050 %16.67 %33.33 %0 %348027324
1099NC_015873CCTTGA2122304816230482716.67 %33.33 %16.67 %33.33 %348027324
1100NC_015873GATGGT2122308780230879116.67 %33.33 %50 %0 %348027329
1101NC_015873GATGGT2122308970230898116.67 %33.33 %50 %0 %348027330
1102NC_015873GCATCG2122310373231038416.67 %16.67 %33.33 %33.33 %348027331
1103NC_015873GACATA2122311263231127450 %16.67 %16.67 %16.67 %348027331
1104NC_015873TCTGGT212231295523129660 %50 %33.33 %16.67 %348027333
1105NC_015873AGCCAT2122314117231412833.33 %16.67 %16.67 %33.33 %348027334
1106NC_015873TCGCGG212231886223188730 %16.67 %50 %33.33 %348027339
1107NC_015873CCAGGA2122320204232021533.33 %0 %33.33 %33.33 %348027339
1108NC_015873GCCGAG2122320832232084316.67 %0 %50 %33.33 %348027340
1109NC_015873AAACAG2122323696232370766.67 %0 %16.67 %16.67 %348027342
1110NC_015873GCCCTG212232696223269730 %16.67 %33.33 %50 %348027345
1111NC_015873TTGACC2122328871232888216.67 %33.33 %16.67 %33.33 %348027347
1112NC_015873GCGGAA2122332416233242733.33 %0 %50 %16.67 %348027351
1113NC_015873CTTCCC212233353723335480 %33.33 %0 %66.67 %348027351
1114NC_015873CAGCCA2122333780233379133.33 %0 %16.67 %50 %348027351
1115NC_015873GTCAGG2122337872233788316.67 %16.67 %50 %16.67 %348027353
1116NC_015873CCATGG2122338923233893416.67 %16.67 %33.33 %33.33 %348027353
1117NC_015873CGCCGA2122343149234316016.67 %0 %33.33 %50 %348027359
1118NC_015873CTTGGC212234345023434610 %33.33 %33.33 %33.33 %348027359
1119NC_015873CAGGGC2122346467234647816.67 %0 %50 %33.33 %348027360
1120NC_015873GGATGT2122347174234718516.67 %33.33 %50 %0 %348027360
1121NC_015873TGCGCC212234838523483960 %16.67 %33.33 %50 %348027361
1122NC_015873TATCGA2122357141235715233.33 %33.33 %16.67 %16.67 %348027369
1123NC_015873CCATGA2122360327236033833.33 %16.67 %16.67 %33.33 %348027370
1124NC_015873TTTTTC212236664523666560 %83.33 %0 %16.67 %348027375
1125NC_015873TTCTTG212236971323697240 %66.67 %16.67 %16.67 %348027380
1126NC_015873GACGCG2122375235237524616.67 %0 %50 %33.33 %348027384
1127NC_015873CCATGA2122375318237532933.33 %16.67 %16.67 %33.33 %348027384
1128NC_015873TTCGCC212237533423753450 %33.33 %16.67 %50 %348027384
1129NC_015873CGTTTC212238389123839020 %50 %16.67 %33.33 %348027393
1130NC_015873GGCCAG2122386109238612016.67 %0 %50 %33.33 %348027395
1131NC_015873CATGGG2122389944238995516.67 %16.67 %50 %16.67 %348027398
1132NC_015873TCCCCT212239563323956440 %33.33 %0 %66.67 %348027403
1133NC_015873GGCGAC2122395667239567816.67 %0 %50 %33.33 %348027403
1134NC_015873ATCCAG2122398004239801533.33 %16.67 %16.67 %33.33 %348027405
1135NC_015873GCCGAT2122399966239997716.67 %16.67 %33.33 %33.33 %348027407
1136NC_015873GCCAGG2122400895240090616.67 %0 %50 %33.33 %348027408
1137NC_015873TTCAGC2122405937240594816.67 %33.33 %16.67 %33.33 %348027410
1138NC_015873CGGCTG212240740324074140 %16.67 %50 %33.33 %348027411
1139NC_015873GCAAAG2122407813240782450 %0 %33.33 %16.67 %348027411
1140NC_015873CTACGC2122408513240852416.67 %16.67 %16.67 %50 %348027412
1141NC_015873CCGTTA2122410162241017316.67 %33.33 %16.67 %33.33 %348027414
1142NC_015873ACCTCG2122410917241092816.67 %16.67 %16.67 %50 %348027414
1143NC_015873AGATGC2122412108241211933.33 %16.67 %33.33 %16.67 %348027416
1144NC_015873GGCAAA2122415767241577850 %0 %33.33 %16.67 %348027419
1145NC_015873GCGGCC212241674724167580 %0 %50 %50 %348027420
1146NC_015873AACCGT2122419544241955533.33 %16.67 %16.67 %33.33 %348027421
1147NC_015873TGCCGG212242540524254160 %16.67 %50 %33.33 %348027428
1148NC_015873TATCCT2122426531242654216.67 %50 %0 %33.33 %348027429
1149NC_015873ATGCCG2122428324242833516.67 %16.67 %33.33 %33.33 %348027431
1150NC_015873CCAGGC2122428668242867916.67 %0 %33.33 %50 %348027432
1151NC_015873TTTCCG212243022124302320 %50 %16.67 %33.33 %348027433
1152NC_015873CACCGG2122431239243125016.67 %0 %33.33 %50 %348027434
1153NC_015873CAGGGA2122440549244056033.33 %0 %50 %16.67 %348027445
1154NC_015873CTTCGC212244200024420110 %33.33 %16.67 %50 %348027445
1155NC_015873CTTTTC212244211824421290 %66.67 %0 %33.33 %348027445
1156NC_015873GGCCTG212244398624439970 %16.67 %50 %33.33 %348027446
1157NC_015873AGTCAC2122453773245378433.33 %16.67 %16.67 %33.33 %348027455
1158NC_015873TGGCCA2122457025245703616.67 %16.67 %33.33 %33.33 %348027459
1159NC_015873GCCAGG2122461164246117516.67 %0 %50 %33.33 %348027461
1160NC_015873TCAGCC2122467648246765916.67 %16.67 %16.67 %50 %348027465
1161NC_015873CCTGGC212246842424684350 %16.67 %33.33 %50 %348027466
1162NC_015873GCCCTG212246878224687930 %16.67 %33.33 %50 %348027466