MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Megasphaera elsdenii DSM 20460

Total Repeats: 5655

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015873	TTCC	2	8	836	843	0 %	50 %	0 %	50 %	348025248
2	NC_015873	CCAG	2	8	1072	1079	25 %	0 %	25 %	50 %	348025248
3	NC_015873	TGGC	2	8	1092	1099	0 %	25 %	50 %	25 %	348025248
4	NC_015873	CGGC	2	8	1200	1207	0 %	0 %	50 %	50 %	348025248
5	NC_015873	CGAT	2	8	1251	1258	25 %	25 %	25 %	25 %	348025248
6	NC_015873	GAAG	2	8	2088	2095	50 %	0 %	50 %	0 %	348025249
7	NC_015873	CGGC	2	8	2405	2412	0 %	0 %	50 %	50 %	348025249
8	NC_015873	GGCT	2	8	2963	2970	0 %	25 %	50 %	25 %	348025250
9	NC_015873	CGTC	2	8	3000	3007	0 %	25 %	25 %	50 %	348025250
10	NC_015873	GGCC	2	8	4016	4023	0 %	0 %	50 %	50 %	348025251
11	NC_015873	CGGC	2	8	4292	4299	0 %	0 %	50 %	50 %	348025251
12	NC_015873	GGAC	2	8	4328	4335	25 %	0 %	50 %	25 %	348025251
13	NC_015873	GCAG	2	8	4658	4665	25 %	0 %	50 %	25 %	348025251
14	NC_015873	GGCC	2	8	4730	4737	0 %	0 %	50 %	50 %	348025251
15	NC_015873	TGGT	2	8	5279	5286	0 %	50 %	50 %	0 %	348025252
16	NC_015873	TTTC	2	8	5310	5317	0 %	75 %	0 %	25 %	348025252
17	NC_015873	CCTT	2	8	5468	5475	0 %	50 %	0 %	50 %	348025252
18	NC_015873	AGCA	2	8	6482	6489	50 %	0 %	25 %	25 %	348025252
19	NC_015873	CCGG	2	8	6689	6696	0 %	0 %	50 %	50 %	348025253
20	NC_015873	CGGC	2	8	7398	7405	0 %	0 %	50 %	50 %	348025253
21	NC_015873	CCAG	2	8	7406	7413	25 %	0 %	25 %	50 %	348025253
22	NC_015873	GCCA	2	8	7497	7504	25 %	0 %	25 %	50 %	348025254
23	NC_015873	GGAT	2	8	7667	7674	25 %	25 %	50 %	0 %	348025254
24	NC_015873	ATGG	2	8	8381	8388	25 %	25 %	50 %	0 %	348025254
25	NC_015873	GGTA	2	8	8404	8411	25 %	25 %	50 %	0 %	348025254
26	NC_015873	GGAA	2	8	8571	8578	50 %	0 %	50 %	0 %	348025255
27	NC_015873	GTCC	2	8	8974	8981	0 %	25 %	25 %	50 %	348025255
28	NC_015873	GCCA	2	8	8986	8993	25 %	0 %	25 %	50 %	348025255
29	NC_015873	GCCA	2	8	9191	9198	25 %	0 %	25 %	50 %	348025255
30	NC_015873	TCCG	2	8	9320	9327	0 %	25 %	25 %	50 %	348025255
31	NC_015873	CGGC	2	8	10160	10167	0 %	0 %	50 %	50 %	348025256
32	NC_015873	TTCC	2	8	10299	10306	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_015873	TATC	2	8	11387	11394	25 %	50 %	0 %	25 %	348025257
34	NC_015873	GCAT	2	8	12611	12618	25 %	25 %	25 %	25 %	348025258
35	NC_015873	CGTC	2	8	12963	12970	0 %	25 %	25 %	50 %	348025258
36	NC_015873	TGCT	2	8	13370	13377	0 %	50 %	25 %	25 %	348025259
37	NC_015873	TGAA	2	8	13939	13946	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015873	CGGA	2	8	15073	15080	25 %	0 %	50 %	25 %	348025260
39	NC_015873	GGCT	2	8	15179	15186	0 %	25 %	50 %	25 %	348025260
40	NC_015873	GGCC	2	8	15363	15370	0 %	0 %	50 %	50 %	348025260
41	NC_015873	GTAC	2	8	16168	16175	25 %	25 %	25 %	25 %	348025260
42	NC_015873	CAGG	2	8	16752	16759	25 %	0 %	50 %	25 %	348025260
43	NC_015873	TGGA	2	8	16802	16809	25 %	25 %	50 %	0 %	348025260
44	NC_015873	AAAT	2	8	16901	16908	75 %	25 %	0 %	0 %	348025260
45	NC_015873	GGAT	2	8	17258	17265	25 %	25 %	50 %	0 %	348025260
46	NC_015873	AATA	2	8	17403	17410	75 %	25 %	0 %	0 %	348025260
47	NC_015873	CGAA	2	8	17488	17495	50 %	0 %	25 %	25 %	348025260
48	NC_015873	GATA	2	8	17947	17954	50 %	25 %	25 %	0 %	348025261
49	NC_015873	GCCG	2	8	18121	18128	0 %	0 %	50 %	50 %	348025261
50	NC_015873	ATGG	2	8	18153	18160	25 %	25 %	50 %	0 %	348025261
51	NC_015873	CCGG	2	8	18244	18251	0 %	0 %	50 %	50 %	348025261
52	NC_015873	AGTT	2	8	18462	18469	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015873	CAGC	2	8	18932	18939	25 %	0 %	25 %	50 %	348025262
54	NC_015873	TCAT	2	8	19118	19125	25 %	50 %	0 %	25 %	348025262
55	NC_015873	CTCC	2	8	19135	19142	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
56	NC_015873	AGAA	2	8	19181	19188	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015873	GAGG	2	8	19268	19275	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015873	CCGT	2	8	21417	21424	0 %	25 %	25 %	50 %	348025264
59	NC_015873	GACA	2	8	21592	21599	50 %	0 %	25 %	25 %	348025265
60	NC_015873	CGTC	2	8	21938	21945	0 %	25 %	25 %	50 %	348025265
61	NC_015873	TTTC	2	8	22366	22373	0 %	75 %	0 %	25 %	348025266
62	NC_015873	ATAA	2	8	22496	22503	75 %	25 %	0 %	0 %	348025266
63	NC_015873	ATTG	2	8	22646	22653	25 %	50 %	25 %	0 %	348025266
64	NC_015873	CATA	2	8	23377	23384	50 %	25 %	0 %	25 %	348025266
65	NC_015873	CGGA	2	8	24576	24583	25 %	0 %	50 %	25 %	348025268
66	NC_015873	CAGC	2	8	24872	24879	25 %	0 %	25 %	50 %	348025268
67	NC_015873	CGGC	2	8	25096	25103	0 %	0 %	50 %	50 %	348025269
68	NC_015873	GCCA	2	8	25107	25114	25 %	0 %	25 %	50 %	348025269
69	NC_015873	TTTC	2	8	26381	26388	0 %	75 %	0 %	25 %	348025270
70	NC_015873	CTTC	2	8	27083	27090	0 %	50 %	0 %	50 %	348025270
71	NC_015873	TCCA	2	8	27537	27544	25 %	25 %	0 %	50 %	348025271
72	NC_015873	CCGG	2	8	28301	28308	0 %	0 %	50 %	50 %	348025271
73	NC_015873	GCCC	2	8	28923	28930	0 %	0 %	25 %	75 %	348025271
74	NC_015873	GACA	2	8	30074	30081	50 %	0 %	25 %	25 %	348025273
75	NC_015873	GGCA	2	8	30926	30933	25 %	0 %	50 %	25 %	348025274
76	NC_015873	GCAT	2	8	31288	31295	25 %	25 %	25 %	25 %	348025274
77	NC_015873	CCGG	2	8	32439	32446	0 %	0 %	50 %	50 %	348025275
78	NC_015873	GACG	2	8	32479	32486	25 %	0 %	50 %	25 %	348025275
79	NC_015873	ATAG	2	8	32779	32786	50 %	25 %	25 %	0 %	348025275
80	NC_015873	GCCG	2	8	32956	32963	0 %	0 %	50 %	50 %	348025275
81	NC_015873	CGTC	2	8	33681	33688	0 %	25 %	25 %	50 %	348025275
82	NC_015873	CGGC	2	8	33710	33717	0 %	0 %	50 %	50 %	348025275
83	NC_015873	GCTG	2	8	34020	34027	0 %	25 %	50 %	25 %	348025275
84	NC_015873	ATTC	2	8	34527	34534	25 %	50 %	0 %	25 %	348025275
85	NC_015873	AGGT	2	8	35177	35184	25 %	25 %	50 %	0 %	348025275
86	NC_015873	CTGC	2	8	35295	35302	0 %	25 %	25 %	50 %	348025275
87	NC_015873	CGGC	2	8	35595	35602	0 %	0 %	50 %	50 %	348025275
88	NC_015873	GATA	2	8	36339	36346	50 %	25 %	25 %	0 %	348025275
89	NC_015873	ACCT	2	8	36695	36702	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_015873	CTGG	2	8	37521	37528	0 %	25 %	50 %	25 %	348025276
91	NC_015873	CGAG	2	8	37562	37569	25 %	0 %	50 %	25 %	348025276
92	NC_015873	AGCA	2	8	37574	37581	50 %	0 %	25 %	25 %	348025276
93	NC_015873	GCAG	2	8	37723	37730	25 %	0 %	50 %	25 %	348025277
94	NC_015873	GTCC	2	8	37907	37914	0 %	25 %	25 %	50 %	348025277
95	NC_015873	CAGG	2	8	38003	38010	25 %	0 %	50 %	25 %	348025277
96	NC_015873	TGAA	2	8	39265	39272	50 %	25 %	25 %	0 %	348025278
97	NC_015873	GGCC	2	8	39425	39432	0 %	0 %	50 %	50 %	348025278
98	NC_015873	ACGG	2	8	40476	40483	25 %	0 %	50 %	25 %	348025278
99	NC_015873	GTCA	2	8	40632	40639	25 %	25 %	25 %	25 %	348025278
100	NC_015873	CATG	2	8	40682	40689	25 %	25 %	25 %	25 %	348025278
101	NC_015873	TATT	2	8	40927	40934	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015873	TGCC	2	8	41312	41319	0 %	25 %	25 %	50 %	348025279
103	NC_015873	CGGC	2	8	41370	41377	0 %	0 %	50 %	50 %	348025279
104	NC_015873	GGCC	2	8	41808	41815	0 %	0 %	50 %	50 %	348025279
105	NC_015873	CTTC	2	8	41999	42006	0 %	50 %	0 %	50 %	348025279
106	NC_015873	ACAA	2	8	42098	42105	75 %	0 %	0 %	25 %	348025279
107	NC_015873	GCTG	2	8	42468	42475	0 %	25 %	50 %	25 %	348025279
108	NC_015873	GGGC	2	8	42802	42809	0 %	0 %	75 %	25 %	348025279
109	NC_015873	TCCG	2	8	43035	43042	0 %	25 %	25 %	50 %	348025279
110	NC_015873	GGCC	2	8	43294	43301	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_015873	CCAG	2	8	43883	43890	25 %	0 %	25 %	50 %	348025280
112	NC_015873	TTCC	2	8	44344	44351	0 %	50 %	0 %	50 %	348025281
113	NC_015873	GCCG	2	8	44599	44606	0 %	0 %	50 %	50 %	348025281
114	NC_015873	ACTC	2	8	44767	44774	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_015873	GAAT	2	8	45618	45625	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015873	CTTT	2	8	45628	45635	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_015873	CTTT	2	8	45930	45937	0 %	75 %	0 %	25 %	348025283
118	NC_015873	TTTC	2	8	45952	45959	0 %	75 %	0 %	25 %	348025283
119	NC_015873	CTTG	2	8	46124	46131	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_015873	GCCG	2	8	46576	46583	0 %	0 %	50 %	50 %	348025284
121	NC_015873	GGCC	2	8	46650	46657	0 %	0 %	50 %	50 %	348025284
122	NC_015873	GGCC	2	8	47208	47215	0 %	0 %	50 %	50 %	348025284
123	NC_015873	AGAC	2	8	47358	47365	50 %	0 %	25 %	25 %	348025284
124	NC_015873	TTCA	2	8	47374	47381	25 %	50 %	0 %	25 %	348025284
125	NC_015873	CTTT	2	8	47397	47404	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_015873	ACGG	2	8	49097	49104	25 %	0 %	50 %	25 %	348025286
127	NC_015873	CCGT	2	8	50213	50220	0 %	25 %	25 %	50 %	348025287
128	NC_015873	AGTT	2	8	50702	50709	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015873	CTGA	2	8	50777	50784	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_015873	CCGG	2	8	51208	51215	0 %	0 %	50 %	50 %	348025288
131	NC_015873	TCTT	2	8	51231	51238	0 %	75 %	0 %	25 %	348025288
132	NC_015873	TCAA	2	8	51446	51453	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_015873	ATGA	2	8	51535	51542	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015873	TGCC	2	8	51562	51569	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
135	NC_015873	AAGA	2	8	52475	52482	75 %	0 %	25 %	0 %	348025289
136	NC_015873	CAAT	2	8	53303	53310	50 %	25 %	0 %	25 %	348025290
137	NC_015873	GCCT	2	8	53431	53438	0 %	25 %	25 %	50 %	348025290
138	NC_015873	AAGG	2	8	53614	53621	50 %	0 %	50 %	0 %	348025290
139	NC_015873	CAAA	2	8	54145	54152	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_015873	GGTT	2	8	54238	54245	0 %	50 %	50 %	0 %	348025291
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142	NC_015873	TTTG	2	8	54515	54522	0 %	75 %	25 %	0 %	348025291
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