MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia heilongjiangensis 054 chromosome

Total Repeats: 451

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015866	AAAGTA	2	12	1471	1482	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	341583224
2	NC_015866	AAAACC	2	12	5311	5322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341583227
3	NC_015866	CAAAAT	2	12	6163	6174	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	341583227
4	NC_015866	ACCGTA	2	12	7747	7758	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	341583230
5	NC_015866	AGAAAA	2	12	14286	14297	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	341583237
6	NC_015866	ATTAAA	2	12	15462	15473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583238
7	NC_015866	TTTAAA	2	12	17059	17070	50 %	50 %	0 %	0 %	341583240
8	NC_015866	CTAATT	2	12	17108	17119	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	341583240
9	NC_015866	CTATAT	2	12	17723	17734	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	341583240
10	NC_015866	CAAAGT	2	12	20715	20726	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	341583243
11	NC_015866	ATTTAG	2	12	22453	22464	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	341583243
12	NC_015866	AGGAAA	2	12	22812	22823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583243
13	NC_015866	CAGATG	2	12	23185	23196	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	341583243
14	NC_015866	GAAGCT	2	12	23466	23477	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	341583243
15	NC_015866	GCATTA	2	12	24741	24752	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	341583243
16	NC_015866	TCCGAT	2	12	24858	24869	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	341583243
17	NC_015866	ATTTAA	2	12	25256	25267	50 %	50 %	0 %	0 %	341583243
18	NC_015866	AGAAAA	2	12	26677	26688	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	341583245
19	NC_015866	TAAAGT	2	12	27651	27662	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	341583248
20	NC_015866	CATATA	2	12	34173	34184	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	341583257
21	NC_015866	AATACA	2	12	37595	37606	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	341583261
22	NC_015866	TTTTTG	2	12	38167	38178	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	341583262
23	NC_015866	ATATTA	2	12	45148	45159	50 %	50 %	0 %	0 %	341583271
24	NC_015866	ATACTG	2	12	45981	45992	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	341583272
25	NC_015866	TTAAGG	2	12	46215	46226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583272
26	NC_015866	TTAAAG	2	12	47951	47962	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	341583274
27	NC_015866	ATTTTT	2	12	48481	48492	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	341583275
28	NC_015866	GAGTAT	2	12	53050	53061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583281
29	NC_015866	ATTGCT	2	12	57510	57521	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	341583285
30	NC_015866	ATTTAT	2	12	58097	58108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583286
31	NC_015866	ATAAGG	2	12	58296	58307	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	341583286
32	NC_015866	ATCAGA	2	12	62151	62162	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	341583292
33	NC_015866	TGGTGT	2	12	66882	66893	0 %	50 %	50 %	0 %	341583295
34	NC_015866	TAATAT	2	12	71583	71594	50 %	50 %	0 %	0 %	341583301
35	NC_015866	CAGCAA	2	12	72251	72262	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	341583302
36	NC_015866	ATAGTG	2	12	72582	72593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583302
37	NC_015866	ATTACT	2	12	72659	72670	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	341583302
38	NC_015866	AAAAAG	2	12	73410	73421	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	341583302
39	NC_015866	TATAGT	2	12	77169	77180	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	341583306
40	NC_015866	GAAAGA	2	12	77250	77261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583306
41	NC_015866	AAAGCT	2	12	79366	79377	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	341583309
42	NC_015866	GTAATA	2	12	80005	80016	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	341583309
43	NC_015866	AGTAAA	2	12	88698	88709	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	341583318
44	NC_015866	AAGGAC	2	12	90588	90599	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	341583320
45	NC_015866	CGTGAT	2	12	91557	91568	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	341583324
46	NC_015866	TTGATT	2	12	94017	94028	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	341583325
47	NC_015866	CCAAAG	2	12	94916	94927	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	341583326
48	NC_015866	GAAGCA	2	12	95109	95120	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	341583326
49	NC_015866	TAAAGG	2	12	97215	97226	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	341583327
50	NC_015866	TTTTTA	2	12	100242	100253	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	341583329
51	NC_015866	CCTATA	2	12	105089	105100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583335
52	NC_015866	ACCTAT	2	12	105322	105333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583335
53	NC_015866	ACCGCT	2	12	106670	106681	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	341583336
54	NC_015866	TGTATT	2	12	112401	112412	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	341583341
55	NC_015866	TAGCGG	2	12	121521	121532	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	341583347
56	NC_015866	CTTTTT	2	12	121880	121891	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	341583347
57	NC_015866	CTCAAT	2	12	124838	124849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583350
58	NC_015866	TTTATT	2	12	127040	127051	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	341583354
59	NC_015866	TAAAAT	2	12	131025	131036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583357
60	NC_015866	CTTTGT	2	12	138274	138285	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	341583367
61	NC_015866	TTGCTA	2	12	140364	140375	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	341583368
62	NC_015866	AAGATA	2	12	140529	140540	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	341583368
63	NC_015866	CTTTAG	2	12	140691	140702	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	341583368
64	NC_015866	TTTAGT	2	12	141350	141361	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	341583368
65	NC_015866	TATACC	2	12	144032	144043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583369
66	NC_015866	TAATGC	2	12	145121	145132	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	341583370
67	NC_015866	GATTCC	2	12	145355	145366	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	341583370
68	NC_015866	AAAGAT	2	12	145944	145955	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	341583370
69	NC_015866	TAAAGA	2	12	146168	146179	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	341583370
70	NC_015866	TTTATC	2	12	158922	158933	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	341583379
71	NC_015866	GATTTT	2	12	159216	159227	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	341583380
72	NC_015866	CTTTTG	2	12	161773	161784	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	341583382
73	NC_015866	GTAAAA	2	12	163097	163108	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	341583383
74	NC_015866	CAATAT	2	12	166040	166051	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	341583388
75	NC_015866	ATTGAG	2	12	166391	166402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583389
76	NC_015866	AAAGAA	2	12	169032	169043	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	341583391
77	NC_015866	TCAAGC	2	12	169049	169060	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	341583391
78	NC_015866	GTTGAG	2	12	169604	169615	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	341583392
79	NC_015866	ATCTAA	2	12	170241	170252	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	341583392
80	NC_015866	AAGTAA	2	12	171400	171411	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	341583393
81	NC_015866	TAGAGC	2	12	174252	174263	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	341583398
82	NC_015866	GAACAA	2	12	177761	177772	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	341583402
83	NC_015866	ATAAAA	2	12	179178	179189	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	341583402
84	NC_015866	TTTTTA	2	12	180240	180251	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	341583403
85	NC_015866	CTGTAG	2	12	183235	183246	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	341583408
86	NC_015866	TTAAAA	2	12	185478	185489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583409
87	NC_015866	ATAATT	2	12	193431	193442	50 %	50 %	0 %	0 %	341583411
88	NC_015866	GATGTT	2	12	195324	195335	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	341583412
89	NC_015866	AAAAAT	2	12	197804	197815	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	341583415
90	NC_015866	AAGCCC	2	12	206826	206837	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	341583421
91	NC_015866	CTTTAG	2	12	215926	215937	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	341583430
92	NC_015866	TGCCGA	2	12	216416	216427	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	341583430
93	NC_015866	ATATTT	2	12	216915	216926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583430
94	NC_015866	GTTTCA	2	12	220205	220216	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	341583434
95	NC_015866	AAAAGC	2	12	221391	221402	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	341583435
96	NC_015866	TTTCTT	2	12	222840	222851	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	341583437
97	NC_015866	AAATTA	2	12	224013	224024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583439
98	NC_015866	AGTTAA	2	12	225948	225959	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	341583440
99	NC_015866	TCATAA	2	12	227925	227936	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	341583441
100	NC_015866	TAAATT	2	12	229625	229636	50 %	50 %	0 %	0 %	341583443
101	NC_015866	CTAGCA	2	12	233466	233477	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	341583445
102	NC_015866	AAAGCA	2	12	237171	237182	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	341583451
103	NC_015866	GTACGA	2	12	241216	241227	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	341583455
104	NC_015866	CTTCTA	2	12	242213	242224	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	341583455
105	NC_015866	ATCTCA	2	12	244981	244992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583457
106	NC_015866	TTCTTT	2	12	246374	246385	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	341583458
107	NC_015866	TAGGGA	2	12	246813	246824	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	341583458
108	NC_015866	TACTTC	2	12	248710	248721	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	341583462
109	NC_015866	CAATAT	2	12	257788	257799	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	341583472
110	NC_015866	AAATTT	2	12	262970	262981	50 %	50 %	0 %	0 %	341583475
111	NC_015866	GCACCG	2	12	265399	265410	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	341583480
112	NC_015866	CTTTAA	2	12	265721	265732	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	341583480
113	NC_015866	TGCAGT	2	12	267172	267183	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	341583484
114	NC_015866	CTATAT	2	12	272687	272698	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	341583491
115	NC_015866	ATTGCA	2	12	278561	278572	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	341583496
116	NC_015866	TTAAAG	2	12	281370	281381	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	341583498
117	NC_015866	AGGGTA	2	12	281688	281699	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	341583498
118	NC_015866	GCGGTA	2	12	282306	282317	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	341583498
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231	NC_015866	TAGAGA	2	12	600925	600936	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	341583838
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345	NC_015866	GCATTG	2	12	922939	922950	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	341584155
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347	NC_015866	AGGTAT	2	12	941213	941224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341584174
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