MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Rickettsia heilongjiangensis 054 chromosome

Total Repeats: 1167

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015866	TTTTA	2	10	2779	2788	20 %	80 %	0 %	0 %	341583226
2	NC_015866	ATTTA	2	10	3132	3141	40 %	60 %	0 %	0 %	341583226
3	NC_015866	GGTCA	2	10	4376	4385	20 %	20 %	40 %	20 %	341583227
4	NC_015866	TAAAT	2	10	5085	5094	60 %	40 %	0 %	0 %	341583227
5	NC_015866	ACTTT	2	10	7054	7063	20 %	60 %	0 %	20 %	341583229
6	NC_015866	AATAC	2	10	7595	7604	60 %	20 %	0 %	20 %	341583229
7	NC_015866	ATCCA	2	10	8092	8101	40 %	20 %	0 %	40 %	341583230
8	NC_015866	AATTA	2	10	9714	9723	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015866	TAGCT	2	10	11227	11236	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_015866	AGAAT	2	10	11402	11411	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015866	GAATT	2	10	11757	11766	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015866	CGCTC	2	10	12852	12861	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
13	NC_015866	GGCTC	2	10	13394	13403	0 %	20 %	40 %	40 %	341583236
14	NC_015866	AGCAG	2	10	13819	13828	40 %	0 %	40 %	20 %	341583236
15	NC_015866	TTAAT	2	10	13962	13971	40 %	60 %	0 %	0 %	341583236
16	NC_015866	TAACT	2	10	15245	15254	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_015866	ATTTA	2	10	16899	16908	40 %	60 %	0 %	0 %	341583240
18	NC_015866	TTTTA	2	10	17667	17676	20 %	80 %	0 %	0 %	341583240
19	NC_015866	TTTAA	2	10	20252	20261	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015866	TCAAG	2	10	21292	21301	40 %	20 %	20 %	20 %	341583243
21	NC_015866	ATAAA	2	10	21346	21355	80 %	20 %	0 %	0 %	341583243
22	NC_015866	AGAAA	2	10	21608	21617	80 %	0 %	20 %	0 %	341583243
23	NC_015866	ACCAT	2	10	21813	21822	40 %	20 %	0 %	40 %	341583243
24	NC_015866	TAATA	2	10	22748	22757	60 %	40 %	0 %	0 %	341583243
25	NC_015866	CAAAG	2	10	22840	22849	60 %	0 %	20 %	20 %	341583243
26	NC_015866	TTAGT	2	10	23008	23017	20 %	60 %	20 %	0 %	341583243
27	NC_015866	TATAA	2	10	26142	26151	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015866	AGTTC	2	10	26251	26260	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_015866	ATATT	2	10	28245	28254	40 %	60 %	0 %	0 %	341583249
30	NC_015866	ATATT	2	10	28280	28289	40 %	60 %	0 %	0 %	341583249
31	NC_015866	ATGTT	2	10	29195	29204	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015866	CTATA	2	10	32837	32846	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_015866	ATTTT	2	10	35384	35393	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015866	TTAAT	2	10	36949	36958	40 %	60 %	0 %	0 %	341583260
35	NC_015866	TGTAA	2	10	37130	37139	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015866	TTAGT	2	10	39501	39510	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015866	CTTTT	2	10	41576	41585	0 %	80 %	0 %	20 %	341583265
38	NC_015866	TTATT	2	10	41979	41988	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015866	TAAGT	2	10	44870	44879	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015866	AAAGC	2	10	45327	45336	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_015866	CAAAC	2	10	45606	45615	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
42	NC_015866	ACGTA	2	10	45777	45786	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_015866	CTAAC	2	10	46546	46555	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
44	NC_015866	AAAAC	2	10	46921	46930	80 %	0 %	0 %	20 %	341583274
45	NC_015866	TAACT	2	10	47652	47661	40 %	40 %	0 %	20 %	341583274
46	NC_015866	AGAAA	2	10	48265	48274	80 %	0 %	20 %	0 %	341583275
47	NC_015866	GTTTC	2	10	48705	48714	0 %	60 %	20 %	20 %	341583275
48	NC_015866	ATTTT	2	10	49254	49263	20 %	80 %	0 %	0 %	341583275
49	NC_015866	AAGAG	2	10	50702	50711	60 %	0 %	40 %	0 %	341583277
50	NC_015866	AGTAC	2	10	51074	51083	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_015866	CATTA	2	10	53442	53451	40 %	40 %	0 %	20 %	341583283
52	NC_015866	TTGAT	2	10	55393	55402	20 %	60 %	20 %	0 %	341583284
53	NC_015866	TAAAG	2	10	56420	56429	60 %	20 %	20 %	0 %	341583284
54	NC_015866	ATTAT	2	10	56493	56502	40 %	60 %	0 %	0 %	341583284
55	NC_015866	GACAT	2	10	58791	58800	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_015866	ATCTT	2	10	60108	60117	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_015866	ATTAT	2	10	60119	60128	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015866	TCGGT	2	10	61979	61988	0 %	40 %	40 %	20 %	341583292
59	NC_015866	GCTTT	2	10	63572	63581	0 %	60 %	20 %	20 %	341583293
60	NC_015866	GATAA	2	10	66925	66934	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015866	TAAAA	2	10	67986	67995	80 %	20 %	0 %	0 %	341583296
62	NC_015866	ACTTT	2	10	71007	71016	20 %	60 %	0 %	20 %	341583301
63	NC_015866	GCTTA	2	10	71196	71205	20 %	40 %	20 %	20 %	341583301
64	NC_015866	CATTT	2	10	71899	71908	20 %	60 %	0 %	20 %	341583301
65	NC_015866	TTAAA	2	10	71924	71933	60 %	40 %	0 %	0 %	341583301
66	NC_015866	TAAAT	2	10	72002	72011	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015866	AAAGC	2	10	72062	72071	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_015866	ACATA	2	10	74725	74734	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_015866	TTTCT	2	10	78165	78174	0 %	80 %	0 %	20 %	341583308
70	NC_015866	ATTTA	2	10	78580	78589	40 %	60 %	0 %	0 %	341583309
71	NC_015866	AAAAG	2	10	79356	79365	80 %	0 %	20 %	0 %	341583309
72	NC_015866	GGGTT	2	10	79566	79575	0 %	40 %	60 %	0 %	341583309
73	NC_015866	TTTAT	2	10	79942	79951	20 %	80 %	0 %	0 %	341583309
74	NC_015866	GCTTA	2	10	81284	81293	20 %	40 %	20 %	20 %	341583310
75	NC_015866	ACAAT	2	10	81648	81657	60 %	20 %	0 %	20 %	341583311
76	NC_015866	GTTAT	2	10	82273	82282	20 %	60 %	20 %	0 %	341583312
77	NC_015866	GTAGA	2	10	82579	82588	40 %	20 %	40 %	0 %	341583312
78	NC_015866	CAATG	2	10	84931	84940	40 %	20 %	20 %	20 %	341583314
79	NC_015866	ATAAA	2	10	85394	85403	80 %	20 %	0 %	0 %	341583315
80	NC_015866	ATTAA	2	10	86100	86109	60 %	40 %	0 %	0 %	341583315
81	NC_015866	ATACA	2	10	86214	86223	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_015866	GAAAA	2	10	86562	86571	80 %	0 %	20 %	0 %	341583316
83	NC_015866	TAAAT	2	10	89988	89997	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015866	CGCAT	3	15	94263	94277	20 %	20 %	20 %	40 %	341583325
85	NC_015866	TGAAA	2	10	97506	97515	60 %	20 %	20 %	0 %	341583327
86	NC_015866	TTGAT	2	10	98940	98949	20 %	60 %	20 %	0 %	341583328
87	NC_015866	TTGTA	2	10	99712	99721	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015866	ATTTA	2	10	100652	100661	40 %	60 %	0 %	0 %	341583330
89	NC_015866	AATTA	2	10	101021	101030	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015866	TCAAA	2	10	102309	102318	60 %	20 %	0 %	20 %	341583332
91	NC_015866	TTAAT	2	10	103093	103102	40 %	60 %	0 %	0 %	341583333
92	NC_015866	AAACT	2	10	105663	105672	60 %	20 %	0 %	20 %	341583335
93	NC_015866	TTAGT	2	10	106014	106023	20 %	60 %	20 %	0 %	341583336
94	NC_015866	CCAAA	2	10	108452	108461	60 %	0 %	0 %	40 %	341583338
95	NC_015866	TTTAT	2	10	108828	108837	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015866	CGGAT	2	10	108985	108994	20 %	20 %	40 %	20 %	341583339
97	NC_015866	TAATA	2	10	109743	109752	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015866	TTGAT	2	10	110469	110478	20 %	60 %	20 %	0 %	341583341
99	NC_015866	ATTAT	2	10	110650	110659	40 %	60 %	0 %	0 %	341583341
100	NC_015866	TTATA	2	10	111029	111038	40 %	60 %	0 %	0 %	341583341
101	NC_015866	TTTTC	2	10	111698	111707	0 %	80 %	0 %	20 %	341583341
102	NC_015866	AAGGC	2	10	112619	112628	40 %	0 %	40 %	20 %	341583341
103	NC_015866	GCAAA	2	10	116562	116571	60 %	0 %	20 %	20 %	341583342
104	NC_015866	ATAAA	2	10	122468	122477	80 %	20 %	0 %	0 %	341583347
105	NC_015866	AAGTA	2	10	123074	123083	60 %	20 %	20 %	0 %	341583348
106	NC_015866	ATTCG	2	10	124906	124915	20 %	40 %	20 %	20 %	341583351
107	NC_015866	TAAAA	2	10	125244	125253	80 %	20 %	0 %	0 %	341583352
108	NC_015866	AAAAC	2	10	125940	125949	80 %	0 %	0 %	20 %	341583352
109	NC_015866	TTTAA	2	10	126016	126025	40 %	60 %	0 %	0 %	341583352
110	NC_015866	GTTAC	2	10	127105	127114	20 %	40 %	20 %	20 %	341583354
111	NC_015866	TGAAA	2	10	127466	127475	60 %	20 %	20 %	0 %	341583354
112	NC_015866	GCAAG	2	10	128118	128127	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
113	NC_015866	TTAAA	2	10	130052	130061	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015866	CTTGT	2	10	130542	130551	0 %	60 %	20 %	20 %	341583356
115	NC_015866	ATGAT	2	10	131606	131615	40 %	40 %	20 %	0 %	341583357
116	NC_015866	CTTGT	2	10	131944	131953	0 %	60 %	20 %	20 %	341583358
117	NC_015866	TATTT	2	10	132368	132377	20 %	80 %	0 %	0 %	341583359
118	NC_015866	ATTTC	2	10	133057	133066	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_015866	TCTTT	2	10	133518	133527	0 %	80 %	0 %	20 %	341583361
120	NC_015866	CGCTC	2	10	134361	134370	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
121	NC_015866	TCAAT	2	10	135205	135214	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_015866	AAATC	2	10	135466	135475	60 %	20 %	0 %	20 %	341583364
123	NC_015866	TTAAC	2	10	136603	136612	40 %	40 %	0 %	20 %	341583365
124	NC_015866	TATAA	2	10	136695	136704	60 %	40 %	0 %	0 %	341583365
125	NC_015866	TTATA	2	10	137069	137078	40 %	60 %	0 %	0 %	341583366
126	NC_015866	TTTTA	2	10	138722	138731	20 %	80 %	0 %	0 %	341583367
127	NC_015866	GCTTT	2	10	140298	140307	0 %	60 %	20 %	20 %	341583368
128	NC_015866	TATGT	2	10	140948	140957	20 %	60 %	20 %	0 %	341583368
129	NC_015866	GTTTT	2	10	143135	143144	0 %	80 %	20 %	0 %	341583369
130	NC_015866	ACAAG	2	10	147696	147705	60 %	0 %	20 %	20 %	341583370
131	NC_015866	AGTTT	2	10	148032	148041	20 %	60 %	20 %	0 %	341583371
132	NC_015866	TTAGT	2	10	148555	148564	20 %	60 %	20 %	0 %	341583371
133	NC_015866	ATATA	2	10	149461	149470	60 %	40 %	0 %	0 %	341583371
134	NC_015866	TGCAG	2	10	149549	149558	20 %	20 %	40 %	20 %	341583371
135	NC_015866	GTTAT	2	10	149965	149974	20 %	60 %	20 %	0 %	341583371
136	NC_015866	ATGGT	2	10	151129	151138	20 %	40 %	40 %	0 %	341583372
137	NC_015866	AGGAG	2	10	151384	151393	40 %	0 %	60 %	0 %	341583372
138	NC_015866	TATTT	2	10	152060	152069	20 %	80 %	0 %	0 %	341583372
139	NC_015866	AAAGA	2	10	157468	157477	80 %	0 %	20 %	0 %	341583376
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271	NC_015866	ATTTT	2	10	312639	312648	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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