MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Rickettsia heilongjiangensis 054 chromosome

Total Repeats: 943

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015866	TATT	2	8	269	276	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015866	TTTA	2	8	1261	1268	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015866	ATTT	2	8	1643	1650	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015866	TTAT	2	8	6780	6787	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015866	TAAA	2	8	6878	6885	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015866	CCTC	2	8	10439	10446	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
7	NC_015866	CAAT	2	8	10486	10493	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_015866	ATTA	2	8	11455	11462	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015866	ATTA	2	8	11669	11676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015866	TTAG	2	8	14995	15002	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015866	GCAA	2	8	15093	15100	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_015866	TCTT	2	8	15170	15177	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_015866	GCTT	2	8	16574	16581	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_015866	AGTA	2	8	18986	18993	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015866	ATTA	2	8	19011	19018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015866	AATA	2	8	19055	19062	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015866	CTTT	2	8	19100	19107	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_015866	AGTA	2	8	20056	20063	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015866	AAAC	2	8	20106	20113	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_015866	ATTT	2	8	20213	20220	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015866	CTTA	2	8	26039	26046	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_015866	AATT	2	8	26861	26868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015866	TAAT	2	8	28170	28177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015866	AAAT	2	8	28410	28417	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015866	ATTA	2	8	28438	28445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015866	AAAT	2	8	28729	28736	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015866	TAAA	2	8	29042	29049	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015866	GATA	2	8	29130	29137	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015866	TAAA	2	8	29364	29371	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015866	GCTA	2	8	29374	29381	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_015866	TAAT	2	8	30621	30628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015866	AATT	2	8	35288	35295	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015866	GCTT	2	8	38971	38978	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_015866	ATAA	2	8	39197	39204	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015866	AACA	2	8	39292	39299	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_015866	CTGA	2	8	41272	41279	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_015866	ATTA	2	8	41926	41933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015866	ATTA	2	8	42523	42530	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015866	AAAT	2	8	42620	42627	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015866	TACC	2	8	44708	44715	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_015866	AAAC	2	8	44716	44723	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_015866	TAAT	2	8	44792	44799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015866	ATTA	2	8	44827	44834	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015866	AAAT	2	8	44846	44853	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015866	ATTC	2	8	45669	45676	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_015866	TTGA	2	8	49983	49990	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015866	AAGT	2	8	51253	51260	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015866	CTTG	2	8	51729	51736	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_015866	ATCT	2	8	52304	52311	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_015866	TGCT	2	8	52465	52472	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_015866	TATT	2	8	53996	54003	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015866	ATTA	2	8	54196	54203	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015866	ATTA	2	8	57022	57029	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015866	TAAA	2	8	57641	57648	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015866	ATCT	2	8	58846	58853	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_015866	GTTT	2	8	60994	61001	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015866	TAAA	2	8	64156	64163	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015866	ATTT	2	8	64182	64189	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015866	ATTT	2	8	66184	66191	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015866	CAAT	2	8	66944	66951	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_015866	TTAA	2	8	68029	68036	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015866	ATAA	2	8	70556	70563	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015866	GTAA	2	8	70604	70611	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015866	AAGT	2	8	74499	74506	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015866	CAAT	2	8	75803	75810	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_015866	CAAT	2	8	76088	76095	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_015866	TGAT	2	8	76854	76861	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015866	TAAG	2	8	76893	76900	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015866	CAAT	2	8	77389	77396	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_015866	TAGA	2	8	78425	78432	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015866	TAAA	2	8	78446	78453	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015866	TTTA	2	8	78491	78498	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015866	TAAA	2	8	80137	80144	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015866	ATTT	2	8	80266	80273	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015866	AATT	2	8	88279	88286	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015866	ATTT	2	8	89305	89312	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015866	TATC	2	8	89938	89945	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_015866	TAGC	2	8	90041	90048	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_015866	TAAA	2	8	90309	90316	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015866	AATT	2	8	98157	98164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015866	AAAT	2	8	99533	99540	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015866	ATTA	2	8	99750	99757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015866	TCCA	2	8	102795	102802	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_015866	AAGC	2	8	102890	102897	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_015866	ATGT	2	8	104945	104952	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015866	ATCA	2	8	108234	108241	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_015866	TATG	2	8	109540	109547	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015866	AAAG	2	8	109702	109709	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015866	ATTC	2	8	115755	115762	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_015866	ATTA	2	8	115771	115778	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015866	ATTA	2	8	115836	115843	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015866	GAAA	2	8	115957	115964	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015866	TAAA	2	8	115982	115989	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015866	ACTC	2	8	119881	119888	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_015866	CAAA	2	8	119903	119910	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_015866	CTAT	2	8	119975	119982	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_015866	AAGT	2	8	123232	123239	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015866	AAAT	2	8	124580	124587	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015866	CTAC	2	8	125100	125107	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_015866	AGTA	2	8	125206	125213	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015866	AAGT	2	8	127703	127710	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015866	CGCT	2	8	127807	127814	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
103	NC_015866	TCAC	2	8	127836	127843	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_015866	GCAG	2	8	127856	127863	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_015866	ATTG	2	8	128211	128218	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015866	AAAG	2	8	128399	128406	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015866	ATAA	2	8	128411	128418	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015866	ACGT	2	8	130909	130916	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_015866	TTTA	2	8	132496	132503	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015866	GAAA	2	8	133883	133890	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015866	TAAT	2	8	134163	134170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015866	AAAT	2	8	137366	137373	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015866	CTGT	2	8	139821	139828	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_015866	TCGC	2	8	150795	150802	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
115	NC_015866	ATTA	2	8	154820	154827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015866	TAAT	2	8	155106	155113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015866	TAGA	2	8	155502	155509	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015866	ATTT	2	8	155788	155795	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015866	ATAA	2	8	155976	155983	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015866	TTGC	2	8	156677	156684	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_015866	ATTT	2	8	156717	156724	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015866	GCGA	2	8	161586	161593	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
123	NC_015866	TCTA	2	8	170269	170276	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_015866	TTTA	2	8	170280	170287	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015866	TTTA	2	8	176648	176655	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015866	AAAT	2	8	179730	179737	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015866	TTAA	2	8	183060	183067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015866	GTAA	2	8	183560	183567	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015866	TCAA	2	8	183627	183634	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_015866	ATAA	2	8	184013	184020	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015866	ATAA	2	8	184202	184209	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015866	TCAG	2	8	184426	184433	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_015866	GTAT	2	8	193066	193073	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015866	CTAG	2	8	193223	193230	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_015866	TTAC	2	8	196290	196297	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_015866	AGTA	2	8	203897	203904	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015866	ATTG	2	8	204040	204047	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015866	CTGC	2	8	205539	205546	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
139	NC_015866	TTTA	2	8	209622	209629	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015866	TATT	2	8	212603	212610	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015866	TGAT	2	8	212679	212686	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015866	AGGT	2	8	213716	213723	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015866	ATTT	2	8	214123	214130	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015866	TGAC	2	8	214738	214745	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_015866	CTAA	2	8	217313	217320	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_015866	TAAT	2	8	217333	217340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015866	AGCA	2	8	217372	217379	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_015866	TAAA	2	8	221237	221244	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015866	TAAT	2	8	231057	231064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015866	AAGT	2	8	231171	231178	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_015866	AAAT	2	8	231434	231441	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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153	NC_015866	TAAT	2	8	231948	231955	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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